數(shù)據(jù)庫概況
目前，MarkerDB數(shù)據(jù)庫包含142個蛋白質生物標記，1089個化學生物標記，154個核型生物標記和26374個遺傳標記。這些分類為25560個診斷生物標志物，102個預后生物標志物，265個暴露生物標志物和6746個預測生物標志物或生物標志物組。這些標記可共同用于檢測，監(jiān)視或預測670種特定人類疾病，這些疾病分為27大疾病類別。
MarkerDB中五個主要分子標記類別
化學生物標志物
MarkerDB中的化學生物標記物包括各種先天性代謝或遺傳疾病、**、代謝紊亂、傳染病、藥物暴露、化學/污染物暴露和飲食攝入的標記物。MarkerDB中的1089個化學標記與448種疾病以及106種暴露有關。目前，MarkerDB中的每個化學標記都有一個或多個疾病關聯(lián)，以及MarkerDB ID、結構、化合物描述、名稱/同義詞、理化數(shù)據(jù)、疾病濃度、正常濃度、性別、年齡范圍（成人/兒童/新生兒）、生物流體（標記物通常用于測量）、ROC曲線、敏感性、特異性、***性（P值）、一個或多個文獻參考和其他在線數(shù)據(jù)庫（OMIM、GenBank、UniProt、HMDB、PubMed、PDB等）的外部超鏈接。 這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強。上海科研服務兩年
6、外泌體miR-138-5p促進乳腺*肺轉移
極化的巨噬細胞在決定**細胞的表型中起著重要的作用。因此，探究M2巨噬細胞外泌體miR-138-5p處理是否有助于乳腺*小鼠異**模型的**轉移。使用氯膦酸鈉***小鼠巨噬細胞，然后轉移使用過表達miR-138-5p的T47D或T47D細胞來源的外泌體處理的Raw264.7細胞。小鼠模型通過尾靜脈注射4T1-熒光素酶細胞構建（圖6A）。結果顯示，外泌體miR-138-5p處理組***促進小鼠體內乳腺*細胞的**體積和肺轉移，同時增加了CD206和Arg-1陽性細胞數(shù)（圖6B-E）。這些結果表明外泌體miR-138-5p誘導的M2巨噬細胞促進乳腺*的肺轉移。 內蒙古科研服務價格外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化促進CRC肝轉移。
VD以VDR依賴的方式調控AMPK
由于維生素D通過VDR發(fā)揮其比較大的生物學作用，我們使用HK-2VDRKO細胞研究VD是否通過VDR***AMPK。結果表明l，paricalcitol增加了PRKAA1和ULK1的磷酸化，而在高糖條件下則降低了PRKAA1和ULK1的磷酸化。而在HK-2VDRKO細胞中，這種作用完全消失。此外， 二甲雙胍在高糖條件下***了HK-2WT細胞中的PRKAA1和ULK1，但二甲雙胍的這種作用在HK-2VDRKO細胞中仍然可以觀察到。這些結果表明VD以VDR依賴的方式***AMPK。
10）M1-Exos在bEnd.3細胞中通過miR-155/SOCS6/p65軸上調ROS水平，損害線粒體功能
我們進行了一系列功能喪失和功能獲得實驗來研究miR-155/SOCS6/p65軸在調節(jié)線粒體功能中的作用。如圖10A-E所示，SOCS6過表達消除了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos誘導的ROS水平(圖10A和B)、線粒體超氧化物含量(圖10C和D)和線粒體電位(圖10E)的升高。此外，SOCS6過表達***緩解了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos處理后的線粒體腫脹，并降低了線粒體碎片細胞的比例(圖10F和G)。進一步的結果表明，SOCS6過表達可挽救miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos處理導致的OCR、基礎呼吸、ATP產生、呼吸能力和呼吸逆轉的下降(圖10H和I)。miR-NCKD-Exos或miR-155KD-Exos處理后沉默SOCS6則出現(xiàn)相反的結果(圖10J-R)。
結論：在本研究中，我們發(fā)現(xiàn)SCI后浸潤的巨噬細胞可通過傳遞外泌體miR-155促進EndoMT，損害線粒體功能，從而加重BSCB完整性，隨后通過抑制SOCS6誘導的p65降解，***NF-κB通路。我們的工作可能會加強對巨噬細胞和血管內皮細胞之間相互干擾的理解，并揭示脊髓損傷后BSCB完整性的潛在調節(jié)機制。 上海英拜生物設有專業(yè)的武漢技術中心。
采用LEfSe方法分析經(jīng)DHEA和tempol處理后***改變的關鍵系統(tǒng)發(fā)育類型。Desulfovibrionaceae屬富集于oil+PBS組，而Muribaculaceae和Alloprevotella屬富集于DHEA+PBS和DHEA+tempol組(圖5A-B)，這表明tempol可以重塑微生物PCOS大鼠的腸道微生物群的結構。通過分析細菌分類在門和屬水平上的相似性程度，進一步比較三組腸道菌群的整體組成。在門水平上，厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)是3個類群的優(yōu)勢門(圖5)。DHEA處理增加了放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、Patescibacteria、軟毛桿菌門(Tenericutes)和Verrucomicrobia的豐度，減少了psilonbacteraeota和變形菌門(Proteobacteria)的數(shù)量。然而，在tempol干預下，放線菌門、Patescibacteria門、變形菌門和Tenericutes門的變化減弱了(圖5D)。在屬水平上，Lachnospiraceae_NK4A136_group和Multibaculaceae為優(yōu)勢屬(圖5E)。DHEA***提高了thaauera、葡萄球菌、Ideonella、棒狀桿菌和瘤胃球菌_2的豐度，降低了瘤胃球菌_1的豐度。這些變化被tempol處理抵消了(圖5F)。英拜生物是國內承接各類高通量測序科研項目以及一站式的測序文章發(fā)表服務的公司之一。西藏科研服務價格
英拜提供春節(jié)回家探親車費補貼。上海科研服務兩年
DNA生物標志物
DNA生物標記物是MarkerDB中比較大的一類標記物。MarkerDB中的DNA生物標記進一步分為26021個與209種疾病相關的DNA突變標記、353個與70種疾病相關的SNP標記和23個與16種傳染病相關的微生物/病毒基因。DNA突變數(shù)據(jù)（和臨床批準的突變試驗）來自Genetic Testing Registry，序列數(shù)據(jù)從GenBank中提取，DNA SNP生物標記物的主要來源是數(shù)據(jù)庫GWAS-ROCS，疾病信息從OMIM或Genetics Home Reference中提取，關于微生物/病毒生物標記基因的剩余數(shù)據(jù)通過原始文獻或專利檢索獲得。目前，MarkerDB中的所有DNA標記都有一個或多個疾病關聯(lián)，以及MarkerDB ID、序列（標記了疾病變體）、詳細的基因描述（編碼區(qū)范圍內）、基因名稱/同義詞、一個或多個文獻參考和到其他在線數(shù)據(jù)庫的外部超鏈接。 上海科研服務兩年
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關研究
4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗