河北科研細(xì)胞實(shí)驗(yàn)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-10

5)SsD可***抑制AML在體內(nèi)的進(jìn)展

為了研究SsD在體內(nèi)對(duì)白血病的***效果,我們建立了C1498和FLT3+白血病小鼠模型(圖5A)。對(duì)照組小鼠的白細(xì)胞生長(zhǎng)較快。0.1mg/kg或0.5mg/kg劑量的SsD***抑制WBC生長(zhǎng)(圖5B)。與對(duì)WBC的抑制作用一致,SsD也有效地?fù)p害了骨髓(BM)克隆原性潛能(圖5C和5D)。此外,與對(duì)照組相比,接受SsD***組的小鼠的脾臟更輕,表明SsD處理***逆轉(zhuǎn)了脾腫大,抑制了脾臟轉(zhuǎn)移性**細(xì)胞(圖5C和5E)。與病理表型一致,SsD處理小鼠的生存時(shí)間也明顯延長(zhǎng)(圖5F)。機(jī)制上,SsD在體內(nèi)的抗白血病作用是通過(guò)其m6ARNA甲基化活性介導(dǎo)的(圖5G);因?yàn)镾sD處理小鼠的BM增加了m6ARNA甲基化,從而調(diào)節(jié)靶基因(圖5H)。 METTL14上調(diào)促進(jìn)胰腺*生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。河北科研細(xì)胞實(shí)驗(yàn)

為了闡明miR-934是否主要來(lái)源于CRC細(xì)胞的外泌體,使用GW4869抑制CRC細(xì)胞的外泌體分泌,發(fā)現(xiàn)miR-934在CRC細(xì)胞來(lái)源的外泌體中的表達(dá)水平明顯高于外泌體耗盡的CRC細(xì)胞(Fig.2h)。此外,采用qPCR分析miR-934在總CM、外泌體耗盡CM(超離心耗竭)和外泌體中的表達(dá),結(jié)果顯示,miR-934在總CM或外泌體中的表達(dá)***高于外泌體缺失的CM(Fig.2i)。此外,使用qPCR研究了上述四種CRC細(xì)胞系的外泌體中miR-934的表達(dá),發(fā)現(xiàn)外泌體中miR-934的表達(dá)模式與CRC細(xì)胞CM中的表達(dá)模式一致(Fig.2j)。以上結(jié)果表明miR-934主要包裹在CRC細(xì)胞來(lái)源的外泌體中。云南科研技術(shù)指導(dǎo)外泌體miR-934誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化促進(jìn)CRC肝轉(zhuǎn)移。

9)M1-Exos通過(guò)miR-155/SOCS6/p65軸加重了bEnd.3細(xì)胞的EndoMT

為了探討外泌體miR-155/SOCS6/p65軸在M1-Exos誘導(dǎo)的EndoMT中的作用,我們?cè)隗w外進(jìn)行了一系列功能喪失和功能獲得實(shí)驗(yàn)。我們發(fā)現(xiàn),SOCS6過(guò)表達(dá)部分逆轉(zhuǎn)了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos誘導(dǎo)的TEER值降低和通透性增加(圖9A和B)。ZO-1和Occludin的熒光強(qiáng)度進(jìn)一步顯示SOCS6過(guò)表達(dá)***逆轉(zhuǎn)了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos在bEnd.3細(xì)胞中引起的TJs破壞(圖9C)。此外,EndoMT標(biāo)記物的蛋白水平與這些結(jié)果一致,SOCS6上調(diào)可消除miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos介導(dǎo)的p65上調(diào)(圖9D)。值得注意的是,當(dāng)miR-NCKD-Exos或miR-155KD-Exos下調(diào)SOCS6時(shí),則出現(xiàn)相反的結(jié)果(圖9E-H)。

與對(duì)照組相比,乳腺*來(lái)源的外泌體miR-138-5p降低了M1相關(guān)表型,相反,M2標(biāo)志物增加并伴隨著CD163陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)的增加(圖6G-I)。用從乳腺*細(xì)胞中分離出來(lái)的外泌體處理THP-1細(xì)胞導(dǎo)致了M2極化,抑制miR-138-5p的表達(dá)可挽救這種極化(圖4J-L)。總之,這些結(jié)果表明外泌體miR-138-5p通過(guò)抑制KDM6B表達(dá)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化。

5、KDM6B去甲基化酶活性增加了M1相關(guān)基因的表達(dá)

抑制KDM6B的組蛋白去甲基化酶活性可抑制其靶基因的轉(zhuǎn)錄。因此,使用雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)來(lái)分析M1靶基因的啟動(dòng)子活性。KDM6B的過(guò)表達(dá)特異性地刺激了促炎因子IL-6、IL-1β和TNF-α編碼基因的啟動(dòng)子活性(圖5A)。相反,沉默KDM6B活性則導(dǎo)致他們的啟動(dòng)子活性抑制,而過(guò)表達(dá)KDM6B降低了H3K27me3的水平(圖5B)。ChIP檢測(cè)顯示,與對(duì)照相比,THP-1細(xì)胞中KDM6B的過(guò)表達(dá)或敲除***增加或減少了KDM6B啟動(dòng)子在不同區(qū)域的占用(圖5C-D)。與此結(jié)果一致,啟動(dòng)子區(qū)域H3K27me3的募**降低或增加當(dāng)KDM6B過(guò)表達(dá)或沉默時(shí)(圖5E-F)。總之,下調(diào)KDM6B可提高H3K27me3水平和促炎因子編碼基因的轉(zhuǎn)錄活性,導(dǎo)致抑制M1極化。 大黃酸處理改變腸道菌群組成。

二、G4穩(wěn)定性在基因區(qū)和非基因功能區(qū)之間存在差異根據(jù)穩(wěn)定性得分將G4基因座分為2組,高于19分的為“穩(wěn)定G4基因座”(342778個(gè)),低于19分的為“不穩(wěn)定G4基因座”(327298個(gè)),繪制穩(wěn)定性得分分布圖:

三、G4功能受到不同基因區(qū)域的限制HKT檢驗(yàn)顯示,G4基因座的進(jìn)化取決于它們位于哪個(gè)基因組件內(nèi)。G4基因座在上游、下游基因區(qū)域、5'UTR、3'UTR的優(yōu)勢(shì)比***大于1。位于增強(qiáng)子、復(fù)制起點(diǎn)以及在TAD邊界區(qū)域的G4基因座優(yōu)勢(shì)比都很高,這一發(fā)現(xiàn)表明這三種區(qū)域的G4基因座是有功能的。

這項(xiàng)工作表明, G4 的覆蓋率、密度、預(yù)測(cè)穩(wěn)定性和選擇壓力取決于它們所在的基因成分和非基因功能區(qū)域。自然選擇在基因組的某些功能區(qū)域中保持了高密度的 G4 位點(diǎn)和高穩(wěn)定性的 G4 結(jié)構(gòu),以及在其他功能區(qū)中保持低密度和低穩(wěn)定性。每個(gè)特定區(qū)域組的情況可能取決于維持功能性 G4 的選擇壓力與容納此類結(jié)構(gòu)的成本之間的平衡。 文章使用FMT(糞微生態(tài)移植)來(lái)確定大黃酸改變的腸道菌群是否對(duì)結(jié)腸炎有療效。內(nèi)分泌科研實(shí)驗(yàn)可參觀

METTL14的上調(diào)可以通過(guò)m6A修飾降低PERP水平。河北科研細(xì)胞實(shí)驗(yàn)

8、CXCL13/CXCR5/NFκB/p65/miR-934正反饋環(huán)路在CRLM期間介導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞和CRC細(xì)胞之間的相互作用

如Fig.8a所示,WB顯示,與對(duì)照組相比,SW480和RKO細(xì)胞中,CXCL13促進(jìn)p65磷酸化,NFκB、MMP2和MMP9的表達(dá)上調(diào)而IκBα的表達(dá)下調(diào)。CXCR5表達(dá)下調(diào)可部分減弱CXCL13的增強(qiáng)作用。此外,PMA處理的THP-1細(xì)胞用miR-934mimics預(yù)處理,然后與SW480細(xì)胞或RKO細(xì)胞與anti-CXCL13抗體共培養(yǎng),或與shCXCR5共培養(yǎng)。我們發(fā)現(xiàn)CRC細(xì)胞中的anti-CXCL13抗體或CXCR5敲低可以抑制miR-934過(guò)表達(dá)誘導(dǎo)的NFκB信號(hào)通路的活化(Fig.8b)。值得注意的是,helenalin抑制NFκB/p65信號(hào)后,SW480和RKO細(xì)胞中miR-934、MMP2和MMP9的表達(dá)***低于對(duì)照組(Fig.8c),這表明miR-934也可能通過(guò)正反饋回路被NFκB/p65信號(hào)正調(diào)控。 河北科研細(xì)胞實(shí)驗(yàn)

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5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)

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