4)SsD通過直接抑制FTOm6A去甲基化活性來誘導m6A修飾
為了檢測m6A在RNA上的變化,我們在SsD處理的白血病細胞中進行了m6A點印跡實驗。如圖4A所示,SsD***增加了m6A在轉錄組中的豐度。此外,HPLC-MS/MS定量證實了SsD處理的NB4和Kas-1細胞mRNA中細胞m6A的增加(圖4B)。接下來,我們檢測了FTO的兩個直接靶點MYC和RARA在SsD處理的細胞中的表達。SsD在mRNA和蛋白水平***下調了NB4和Kas-1細胞的MYC,而上調了RARA(圖4C-D)。有趣的是,SsD依賴的MYC和RARA的減少是由于FTO過表達細胞中mRNA和蛋白穩定性的降低(圖4E-4H)。綜上所述,這些結果證明了FTO及其下游靶點(如MYC,RARA)是FTO過表達白血病細胞中SsD的主要效應因子。 評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調節因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達。自噬醫學相關科研實驗可參觀
近日,美國圣路易斯華盛頓大學醫學院Yoshiharu Muto教授等在Nature communications發布了Single cell transcriptional and chromatin accessibility profiling redefine cellular heterogeneity in the adult human kidney的研究論文。文中,作者采用單細胞核轉錄組snRNA-seq和單細胞核染色質可及性snATAC-seq技術,對5個健康成人(50歲到62歲,男性(n = 3)和女性(n = 2))腎臟樣本進行檢測。此文揭示腎臟內獨特的細胞狀態,并重新定義近端小管和粗升肢的細胞異質性。上??蒲匈浰吞峁┘夹g路線我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。
根據以往的研究,DDX5可以結合p50,并協助IκB釋放p50。本研究還揭示了293T和MDA-MB231中DDX5與p50的結合(圖6E)。此外,有報道稱DRD2可在神經系統中與EGFR結合。在BrCa細胞中,293T和MDA-MB231中也證實了DRD2和EGFR的結合(圖6E)。DRD2的表達下調ERBB1 (EGFR)和ERBB2 (HER2)的表達(圖6F)。在異位表達DRD2的BrCa細胞中,DDX5可以促進p-IκBα的磷酸化,增加磷酸化p65的蛋白水平(圖6G)。eEF1A2可直接***上調p-p65的表達,而不影響IKKα/β或IκBα,甚至在沒有LPS的情況下,eEF1A2可上調表達DRD2的MDA-MB231的p-p65蛋白水平(圖6G)。以上結果表明,DDX5和eEF1A2對NF-κB信號通路的促進作用受DRD2異位表達的抑制。
結論:這項研究新發現了一種**抑制基因-DRD2,可以提高BrCa患者的生存率和PTX***反應。DRD2誘導細胞凋亡和壞死,并在Mφ向M1重編程過程中進一步觸發焦亡。DRD2通過與β-arrestin2結合,下調DDX5和eEF1A2,從而限制NF-κB信號通路的***。DRD2是一種潛在的預測預后的生物標志物,并且DRD2是BrCa中一個很有前途的***靶點。
5、MAO-A阻斷**免疫***-小鼠**模型研究
MAO-A作為TAM免疫抑制極化的關鍵調控因子的鑒定使得MAO-A成為**免疫***的一個有前途的藥物靶點。由于已知的MAO-A在大腦中的功能,小分子MAOIs已經被開發和臨床用于***各種神經系統疾病,使其成為一種高度可行和有吸引力的方法來重新利用這些已建立的MAOI藥物用于**免疫***。在體外IL-4/IL-13誘導WTBMDM極化培養中(圖5a),添加多種MAOIs可以有效降低BMDM中的ROS水平,抑制它們的免疫抑制極化和基因(圖5b-e)。值得注意的是,圖5a測試的MAOIs包括苯乙肼、克勞吉林、莫氯比胺和吡吲哚,涵蓋了已建立的MAOIs的主要類別,這些類別是基于它們對MAO-A是非選擇性的還是選擇性的,以及它們的作用是否可逆。 大黃酸改變嘌呤代謝降低尿酸水平。
為了研究ESCRT-III在ferroptosis中的功能作用,作者評估了抑制CHMP4B對NIH-3T3細胞死亡的影響(圖5A, B)。與對照組相比,CHMP4B敲除細胞的死亡發生率更高、更快,特別是在早期時間點(1-3 h),這表明CHMP4B的缺失導致細胞對ferroptosis的敏感性更高。另外,作者使用蛋白質組譜儀XL細胞因子陣列試劑盒(圖5C),確定ferroptosis是否可以直接調節不同細胞系和不同處理下的細胞因子分泌。在誘導ferroptosis時,作者檢測到細胞因子亞群水平的變化,這些變化與細胞系和***有關。此外,敲除CHMP4B改變了RSL3處理后獲得的細胞因子譜(圖5C, D)。這些結果表明,盡管具體的細胞因子改變依賴于***,但ESCRT-III通常影響ferroptotic細胞的細胞因子分泌。另外,RSL3處理的沉默CHMP4B細胞的上清能夠增加小鼠巨噬細胞的CD14表面表達(圖5E)。這些結果表明,與壞死和焦亡相似,ESCRT-III也調節ferroptotic細胞的免疫輸出。
結論:ESCRT-III在ferroptosis微環境中調節細胞因子水平,揭示了這一機制在調控ferroptosis炎癥的作用。這些發現支持了一個普遍的模型,在這個模型中,質膜孔的形成和膜修復是控制不同類型的壞死及其炎癥特征的中心和相反的調控機制。 為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機制。單細胞相關課題科研地區科學基金
上海英拜生物設有專業的武漢技術中心。自噬醫學相關科研實驗可參觀
此外,Ago2 RIP 分析表明 miR-1252-5p、circ_0072083、ALKBH5 和 NANOG 可以在同一復合物上富集。此外,在U251/TR和U87/TR 細胞中,通過circ_0072083 沉默,miR-1252-5p 水平明顯增強。miR-1252-5p 過表達顯著降低了 U251/TR 和 U87/TR 細胞中的 ALKBH5 和 NANOG 水平。此外,在用 sh-NC + anti-NC、sh-circ_0072083 + anti-NC 或 sh-circ_0072083 + anti-miR-1252-轉染的細胞中研究了 circ_0072083/miR-1252-5p 軸對 ALKBH5 和 NANOG 水平的影響。ALKBH5和NANOG 水平通過circ_0072083沉默顯著降低,這通過miR-1252-5p 敲低恢復。此外,miR-1252-5p 敲低逆轉了 circ_0072083沉默介導的 TMZ IC50 降低、細胞增殖、遷移和侵襲以及促進 U251/TR 和 U87/TR 細胞凋亡。這些結果表明 circ_0072083 可以調節 miR-1252-5p/ALKBH5/NANOG 軸以控制膠質瘤細胞中的 TMZ 抗性。自噬醫學相關科研實驗可參觀
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗