為了探索 HIF1α促進circMYH9表達的分子機制,測量了 MYH9 前體 mRNA 的表達。SG或Glu饑餓增加了MYH9的前體mRNA 水平,HIF1α敲低降低了缺乏SG或Glu的CRC細胞中的MYH9前體 mRNA 水平。這些結果表明HIF1α在轉錄水平上促進 MYH9 前體 mRNA,這進一步增加了circMYH9。使用 JASPAR 搜索了MYH9啟動子中的HIF1α結合位點和基序。確定了兩個**可能的HIF1α結合位點。ChIP-qPCR 證明 HIF1α與HCT116細胞中MYH9 啟動子的兩個HBS位點結合。為了證實HIF1α通過HBS促進MYH9表達,構建了包含全長MYH9啟動子區域和HBS缺失的circMYH9啟動子區域的熒光素酶報告基因。HBS1或HBS2的缺失部分消除了HIF1α敲低或過表達對MYH9 熒光素酶報告基因活性的抑制或促進,而HBS1和HBS2的缺失則完全消除了 HIF1α shRNA 或質粒對MYH9熒光素酶報告基因活性的影響。這些數據表明,HBS區域對于SG或Glu剝奪下的HIF1α依賴性circMYH9轉錄調控至關重要。乳酸菌是益生菌在嘌呤代謝中發揮關鍵作用。反轉錄科研
接著作者為了進一步證明YTHDC2與LUAD的關系,與相鄰的*旁組織相比,在LUAD**中觀察到YTHDC2 mRNA和蛋白的***下調(圖1E-G),組織芯片檢測(TMA)評估cohort #1中YTHDC2的表達,結果顯示51% (98/192) LUAD患者的YTHDC2表達下調(圖1H、I)。值得注意的是,YTHDC2表達下調與更大的**直徑和更晚期的分期相關(圖1J、K)。表明抑制YTHDC2可促進LUAD的**進展。
2.過表達YTHDC2抑制細胞活力和**發生為了探索YTHDC2在體內的m6A解讀器功能,作者構建AAV5表達系統(KPYWT、KPYΔYTH和對照KPE)(圖2A)。與KPE小鼠***25周后的**相比,KPYWT和KPYΔYTH小鼠的**證實了YTHDC2持續上調(圖2B),這表明AAV5表達系統具有持久的效率。雖然YTHDC2不能阻止**的發生,但**發生時間延遲,**負荷明顯受到抑制,KPYWT小鼠的生存時間比KPE小鼠和KPYΔYTH小鼠更長(圖2C-F)。 染色質科研我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。
這些基因的體細胞突變狀態如圖所示。平均突變頻率比較高的基因是TP53(31.4%)、PTEN(5.7%)、NOTCH1(3.6%)、CTNNB1(3.6%)、XIST(3.4%)和MALAT1(3.4%)。還觀察到在子宮內膜體*(UCEC)中有相對較高的突變頻率(7.6%)。
在泛*中構建 m6A 亞型和特征
我們使用K-means算法分別將患者分為不同的m6A亞型。Elbow法確定了三種亞型。對數秩檢驗發現,在排除死亡比例的**后,27種**中有24種**的定義亞型與總生存率***相關?<?10%。具體來說,我們定義了按中位生存時間(MST)排序的聚類。MST**長的組定義為第1組,MST**短的組定義為第3組,中間組定義為第2組。與第1組相比,第2組和第3組在27種**中有22種的生存率***降低。此外,當臨床結果為無進展間期(PFI)時,分類在大多數**類型中仍然***(16/26)或疾病特異性生存率(DSS)(18/26)。在總體人群的KM生存率分析中,m6A亞型在調整**類型后可***分層患者的生存率。四個體細胞突變在不同m6A亞型中的分布有***性差異,包括TP53、NOTCH1、CTNNB1和PTEN。
藥物代謝1期PCR芯片可用于研究參與1期藥物代謝的84個關鍵基因的表達。1期藥物代謝酶使的化合物更加親水性并且增加對1期藥物代謝完成必須的功能基團。此芯片**的基因參與1期藥物代謝反應包括氧化、還原水解、環臺、脫環。在期藥物代謝反應方面發揮重要作用的細胞色素P450酶家族成員也包含在芯片上。通過實時定量PCR的方法,研究者即能夠利用該芯片簡單可靠地同時檢測與期藥物代謝有關的基因表達。整體課題服務外包服務:外泌體研究專題,**相關課題研究專項,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,micrroRNA/lncRNA/circRNA 相關研究課題外包一站式服務,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書申請做好祭奠。大黃酸處理對正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應。
A.29名兒童在進行異體造血干細胞移植前、移植時、移植后即刻以及后期隨訪時均進行了監測。監測患者的基線特征、臨床結果、免疫細胞計數以及炎癥和***標志物。表S1(附加文件1)詳細描述了患者特征。宿主免疫系統參數與腸道、口腔和鼻腔微生物群的縱向動力學相關,這些微生物群在指定的時間點進行了評估。
B.每個身體部位HSCT前、移植時和移植后的細菌α多樣性以log10變換后的y軸顯示。星號表示時間點間的中值逆Simpson指數存在***差異。C.相對于HSCT的時間點LDA分析。對于糞便樣本,HSCT后立即采集的樣本LDA評分為陽性。對于口腔和鼻腔樣本,在HSCT前和后期隨訪時間點樣本的LDA評分均為陽性 嘌呤在細胞中執行許多重要的功能。胞漿科研
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在Fth- KO小鼠中, TBI后褪黑素對神經的保護作用被**取消
為了進一步探索神經元Fth的喪失是否影響褪黑素對TBI誘導的鐵死亡的影響,測量了鐵死亡的幾種假定的生物標志物。發現***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平沒有影響。令人驚訝的是,盡管褪黑素***的和未***的Fth -KO小鼠的Tfr1 mRNA和蛋白表達水平沒有顯著差異,但是在褪黑素***的小鼠中,觀察到Fpn mRNA和蛋白表達水平顯著增加Fth- KO小鼠。值得注意的是,與未***的Fth- KO小鼠相比,用褪黑素***Fth- KO小鼠未能顯著改變mRNA(Slc7a11,Ptgs2)和蛋白質(xCT,Cox2、4HNE)的表達。另外,用褪黑素***Fth- KO小鼠并沒有統計學上降低GSH和MDA以及4HNE的水平,和FJB陽性細胞的數目。這些結果表明褪黑素沒有統計學上減少TBI引起的鐵死亡和神經元變性。 反轉錄科研
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗