6）上調UCP1減輕AKI中的脂質積累，可***緩解體內炎癥和凋亡
以上研究證實，在體外，上調UCP1可以通過抑制炎癥和凋亡來抑制AKI的進展。為了探究其在體內的作用，我們在腎多點注射模型中檢測了相應的指標。如圖6A-E所示，炎癥指標CD68、IL-1β、IL-6、TNF-α均***降低，UCP1上調。在凋亡方面，凋亡指標Bax和C-caspase3也隨著UCP1的上調而降低，而Bcl-2隨著UCP1的上調而升高(圖6F)。TUNEL熒光染色也直接證明了UCP1上調導致的凋亡減少(圖6G-H)。同樣，我們也使用UCP1激動劑CL316243在動物模型中證實了同樣的炎癥和凋亡趨勢(圖6I-P)。 N6甲基腺苷（m6A）是一種常見的真核細胞mRNA修飾。上海氨基酸代謝科研
耗盡的**內T細胞會經歷嚴重的缺氧
雖然缺氧在**中很常見，但尚不清楚**內T細胞亞群是否比其他T細胞更容易缺氧。我們首先在8-10 mm(第14天)B16黑色素瘤中沿著衰竭譜對CD8+**浸潤淋巴細胞(TILs)進行表型分析(擴展數據圖1a)。**終衰竭的T細胞被定義為高水平和持續表達PD-1和共表達Tim-3(圖1a)，具有高的LAG3和Tox表達，低的TCF1表達，通過將gp100特異的Pmel-1 T細胞轉移到攜帶b16的小鼠中，一旦它們達到**終衰竭，就會重新刺激它們，從而測定抗原特異性反應(擴展數據圖1b)。與LN-resident Pmel-1 T細胞相比，gp100-restimulated T細胞的多功能性要少得多(圖1f)。在處死B16**小鼠之前，將其注入一種缺氧示蹤劑吡莫硝唑，使用抗吡莫硝唑和抗hif1 α抗體，發現與其他亞群相比，**終耗盡的T細胞缺氧程度比較高(圖1g,h)。因此，缺氧是**代謝景觀的主要代謝組成部分，與其他亞群相比，**終衰竭的T細胞會經歷更高的缺氧。 天津科研英拜是您身邊的科研小助手。
六、INPP4B通過增強GSK3β的溶酶體降解促進pi3k依賴的Wnt/β-catenin信號轉導
通過nanoStringRNA譜分析，我們檢測了GFP-INPP4B和gfp載體表達MCF-7細胞中已知的**通路，結果顯示幾種Wnt/β-catenin通路基因的表達發生了改變(圖6a)。定量RTPCR證實GFP-INPP4B-MCF-7細胞中Wnt/β-catenin靶基因AXIN2(1.8倍)、LEF1(5.6倍)、DKK1(3.3倍)和MYCN(2倍)的mRNA表達增加，表明Wnt/β-catenin信號通路增加(圖6b)。它結合TCF/LEF轉錄因子，促進Wnt靶基因的轉錄。Wnt/β-catenin信號通路被Wnt3a和R-spondin處理***，在這些條件下，與gfp載體對照相比，GFP-INPP4B細胞表現出AXIN2mRNA表達和非磷酸化-β-catenins33/S37/T41(活性-β-catenin)水平增加(圖6c,d)。
急性胰腺炎(AP)是**常見的炎癥性胃腸道疾病之一，在小鼠和人類模型中似乎通過外分泌腺泡細胞的再生而恢復。巨噬細胞是由組織損傷引發的炎癥和組織再生反應的重要驅動因素，包括***、自身免疫性疾病、機械或毒性損傷以及其他原因。在組織損傷時，骨髓(BM)衍生的巨噬細胞和/或組織駐留巨噬細胞被***并以促炎方式響應局部環境，然后迅速轉變為傷口修復表型。巨噬細胞的表型和作用已在急性和慢性胰腺炎中得到充分證明。然而，關于巨噬細胞如何調節損傷后的胰腺修復/再生，包括ADM和腺泡再分化，我們知之甚少。***講一篇關于巨噬細胞表型變化與AP炎癥相關的文章，該文章題名為：Macrophagephenotypicswitchorchestratestheinflammationandrepair/regenerationfollowingacutepancreatitisinjury，IF=5.737，一區雜志。評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調節因子（METTL3、METTL14和WTAP）的表達。
這些基因的體細胞突變狀態如圖所示。平均突變頻率比較高的基因是TP53（31.4%）、PTEN（5.7%）、NOTCH1（3.6%）、CTNNB1（3.6%）、XIST（3.4%）和MALAT1（3.4%）。還觀察到在子宮內膜體*（UCEC）中有相對較高的突變頻率（7.6%）。
在泛*中構建 m6A 亞型和特征
我們使用K-means算法分別將患者分為不同的m6A亞型。Elbow法確定了三種亞型。對數秩檢驗發現，在排除死亡比例的**后，27種**中有24種**的定義亞型與總生存率***相關?<?10%。具體來說，我們定義了按中位生存時間（MST）排序的聚類。MST**長的組定義為第1組，MST**短的組定義為第3組，中間組定義為第2組。與第1組相比，第2組和第3組在27種**中有22種的生存率***降低。此外，當臨床結果為無進展間期（PFI）時，分類在大多數**類型中仍然***（16/26）或疾病特異性生存率（DSS）（18/26）。在總體人群的KM生存率分析中，m6A亞型在調整**類型后可***分層患者的生存率。四個體細胞突變在不同m6A亞型中的分布有***性差異，包括TP53、NOTCH1、CTNNB1和PTEN。 英拜提供可靠的技術咨詢。上海粘性鏈接芯片科研
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8.EVs介導的ELNAT1上調HLECs中SOX18的表達
qRT-PCR分析UM-UC-3-EV1載體或UM-UC-3-EVELNAT1處理的HLECs中淋巴管生成相關基因的表達，結果顯示SRY-box轉錄因子18（SOX18）是**明顯的與EVs介導的ELNAT1表達正相關的基因（Figure8A,B）。此外，ChIRP分析表明EVs介導的ELNAT1與HLECs中SOX18啟動子的771~786bp（p4）直接相互作用（Figure8C,D）。SOX18-p4區域的突變降低了EVs介導的ELNAT1誘導的熒光素酶活性（Figure8E,F），表明SOX18-p4對于EVs介導的ELNAT1誘導HLECs中SOX18的上調至關重要。hnRNPA1和H3K4me3在SOX18啟動子上的富集與EVs介導的ELNAT1表達***相關（Figure8G,J）。EVs介導的ELNAT1過表達增強了HLECs的管形成和遷移能力，而干擾SOX18則HLECs的管形成和遷移能力受損（Figure8K,M），表明SOX18是EVs介導的ELNAT1驅動體外BCa淋巴管生成所必需的。綜上所述，這些結果表明，EVs介導的ELNAT1通過轉錄上調HLECs中SOX18的表達來促進BCa淋巴管生成。 上海氨基酸代謝科研
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6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗