對snATAC-seq數據集使用97%置信閾值對細胞類型分配進行過濾,以去除異型雙重體。通過標簽轉移獲得的snATAC-seq細胞類型預測(圖1d)與無監督簇的編輯注釋(圖1e, f)的比較表明,所有主要的細胞類型都存在于這兩個數據集中,并且在檢測和分配細胞身份方面,snATAC-seq與snRNA-seq具有可比性(補充圖3)。使用基于基因活性的細胞類型分配進行下游分析,這是通過對snatc -seq數據集的無監督聚類獲得的。有趣的是,snATAC-seq能夠檢測到近端小管簇內的兩個亞群,這可能**近端曲小管(圖1e, PCT)和近端直小管(圖1e, PST)。PCT顯示編碼SGLT2的SLC5A2具有更強的染色質可及性;而PST在編碼SGLT1的SLC5A1(圖1f,補充圖4)中表現出更強的可達性。SGLT2在近端小管S1和S2段重新吸收葡萄糖,SGLT1位于S3。英拜注重客戶的隱私。沈陽斷鏈脂肪酸科研
由于p65轉位到細胞核并促進其靶向基因的轉錄,假設NFκB/p65信號通路的***可通過p65的轉錄活性上調miR-934表達。在p65和miR-934啟動子之間發現了5個潛在的轉錄結合區域和2個特異性結合位點(Fig. 8d)。隨后,用miR-934啟動子中含有p65結合區域的載體轉染SW480和RKO細胞;ChIP實驗證明p65對miR-934的轉錄在-2002和-1500 bp(區域1)之間的區域內***增高,在其他四個結合區域中未觀察到明顯變化(Fig. 8e)。這些數據表明,區域1可能在調節CRC細胞中p65介導的miR-934轉錄誘導中起關鍵作用。熒光素酶報告基因檢測證實p65對SW480和RKO細胞中miR-934啟動子的轉錄影響(Fig. 8f)。作者發現只有突變結合位點1可以下調p65的熒光素酶報告基因活性,抑制miR-934的轉錄表達,這證明p65可以通過結合位點1正向直接調節miR-934的表達(Fig. 8f)。此外,作者證明了SW480和RKO細胞中的突變結合位點1可以消除CXCL13的促進作用和NFκB/p65信號對miR-934表達的抑制作用(Fig. 8g,h)。綜上所述,這些結果證明CXCL13/CXCR5/NFκB/p65信號通路促進CRC細胞中miR-934的轉錄,形成一個正反饋回路,參與持續的M2巨噬細胞極化和CRC細胞的侵襲和轉移。重慶胃腸道消化科研英拜的實驗室坐落在上海漕河涇園區浦江園區。
5.沉默lnc-PMIF促進老年OPCs向骨形成表面遷移,促進老年小鼠骨形成
BMSCs中沉默lnc-PMIF,增殖無變化,OPCs成骨能力不改變,細胞遷移數量高,表明沉默lnc-PMIF可增強老年OPCs的遷移能力,而不干擾老年OPCs的體外增殖和成骨分化。接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠中骨形成表面Dil+細胞數***升高,提示沉默lnc-PMIF可促進老年OPCs在體內向骨形成表面遷移,大部分遷移的Dil+細胞中檢測到Runx2表達,表明si-PMIF處理的老年BMSCs遷移到骨形成表面發生正常的成骨分化,這將有助于小鼠的骨形成。接受si-PMIF處理的老年BMSCs小鼠骨表面TGF-β+細胞的平均積分光密度***更高,而TRAP+面積無***差異,表明si-PMIF處理的老化BMSCs可能影響細胞募集,而不是骨吸收。上述si-PMIF或si-NC處理的老年BMSCs對老年雄性小鼠進行脛骨內注射,4周后接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠骨量更高,脛骨干骺端微結構更好,BMD和BV/TV更高,MAR和BFR/BS更高。這些結果證明,老年BMSCs敲低lnc-PMIF可促進骨形成。
PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩定性有關。此外,小鼠胚胎成纖維細胞(mef)中PTEN基因的缺失導致了未修復的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認為通過至少兩種分子機制促進了基因組的完整性。在細胞核中,PTEN與著絲粒結合蛋白CENP-C結合,促進著絲粒組裝和中期到后期的轉變。此外,作為轉錄因子E2F1的輔助因子,核PTEN似乎調節Rad51的表達,Rad51是DNA修復機制的關鍵組成部分。然而,后續的研究得出了不一致的結果,表明PTEN在轉錄水平上對RAD51的調控可能***于特定的細胞環境。乳酸菌是益生菌在嘌呤代謝中發揮關鍵作用。
同時,白樺素并沒有促進HMGCR的降解(圖1B)。同樣,白樺素以Insig依賴的方式完全阻止了轉染SREBP-2的裂解(圖1C)。因此,白樺素特異性地抑制了SREBP的加工,但并不***LXR或加速HMGCR的降解。此外,在共免疫沉淀實驗中,白樺素刺激了SCAP和Insig-1之間的相互作用(圖1D, lanes 4和lanes 5),這暗示白樺素的作用機制。
為了進一步測試白樺素是否通過與SCAP結合發揮作用,合成了一種白樺素衍生探針,命名為化合物1(圖2A)。化合物1包含一個光敏反應基和一個疊氮乙酰基,可以通過點擊化學與生物素炔烴連接。與白樺素類似,化合物1可以抑制SREBP-2的加工(圖2B)。化合物1與膽固醇敲除的CHO細胞的膜組分孵育,然后暴露在紫外線下***交聯。紫外線照射后,用click化學方法粘貼生物素標簽。然后將膜球均質化,與親和素結合的瓊脂糖孵育,以拉下白樺素結合蛋白。如圖2C所示,在化合物1和3 mM處,SCAP被沉淀,高濃度的白樺素可以取代其結合,說明白樺素與SCAP發生物理作用。作為陰性對照,用化合物1幾乎不沉淀轉鐵蛋白受體,白樺素競爭沒有影響(圖2C)。總之,這些結果表明SCAP可能與白樺素結合,并且是其靶標。 專注于生命科學內的前沿研究。滲透性應激科研服務兩年
細菌可能是導致小鼠腸道尿酸降低的主要原因。沈陽斷鏈脂肪酸科研
大約 1% 的人類基因組能夠折疊成 G 四鏈體 (G quadruplexes,G4s)——在富含 G 的基序上形成的非經典鏈特異性 DNA 結構。G4 的熱穩定性不同,這可能會影響它們的功能。然而,G4s 也可能阻礙復制、轉錄和翻譯,并可能增加基因組的不穩定性和突變率。因此,根據其基因組位置、熱穩定性和功能性,G4 基因座可能會在不同的選擇壓力下進化,而這一點從未被研究過。
一、基因組中G4基因座的密度不均勻
與全基因組平均值相比,CpG島、上游區域和轉錄鏈的G4密度的倍數差異特別**別為12.3、4.98和4.11。相比之下,內含子的非轉錄和轉錄鏈、非轉錄外顯子鏈和3'UTR的非轉錄鏈具有G4密度接近全基因組平均值;校正G含量總體趨勢不變,復制起點和增強子具有特別高的G4密度:分別比全基因組平均值高6.88倍和3.03倍。 沈陽斷鏈脂肪酸科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗