近日，美國圣路易斯華盛頓大學醫(yī)學院Yoshiharu Muto教授等在Nature communications發(fā)布了Single cell transcriptional and chromatin accessibility profiling redefine cellular heterogeneity in the adult human kidney的研究論文。文中，作者采用單細胞核轉(zhuǎn)錄組snRNA-seq和單細胞核染色質(zhì)可及性snATAC-seq技術(shù)，對5個健康成人（50歲到62歲，男性(n = 3)和女性(n = 2)）腎臟樣本進行檢測。此文揭示腎臟內(nèi)獨特的細胞狀態(tài)，并重新定義近端小管和粗升肢的細胞異質(zhì)性。英拜跟客戶形成產(chǎn)學研合作模式。江蘇腸道菌科研
6、MiR-199a-5p改善MRL/lpr小鼠疾病
接下來，在體內(nèi)評估了miR-199a-5p對MRL/lpr小鼠的影響。17周齡MRL/lpr小鼠每4天注射20nmolmiR-199a-5pagomir或?qū)φ?agomirnc)，共4周(圖6A)。末次注射后48h處死小鼠，分離脾臟CD4+T細胞。與對照組相比，miR-199a-5pagomir處理組顯示miR-199a-5p水平升高(圖6B)，Sirt1表達降低(圖6C)，衰老標志物p21和p16的表達***上調(diào)(圖6D)。這些數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p增加MRL/lpr脾CD4+T細胞衰老。
接下來，研究系統(tǒng)給予miR-199a-5p agomir是否能挽救MRL/lpr小鼠的狼瘡表型。與agomir nc組相比，miR-199a-5p agomir處理組脾臟和淋巴結(jié)明顯縮小(圖7A-B)，血清中anti-dsDNA抗體、IgG水平下降(圖7D-E)。血清ANA水平有下降趨勢(圖7C)。miR-199a-5p agomir處理組的腎損傷，表現(xiàn)為尿蛋白下降（圖7F），腎小球增大和細胞增生減少(圖7G)，外周***袢中IgG沉積減少(圖7h)。綜上所述，這些數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs移植通過miR -199a-5p介導的Sirt1信號下調(diào)從而增加脾CD4+ T細胞的衰老，改善MRL/lpr小鼠的疾病表型。 細胞膜科研實驗外包METTL14是其***的潛在靶點。
本文在一組臨床定義明確的SLE伴活檢證實的腎炎患者中進行的T細胞轉(zhuǎn)錄組學和代謝研究表明，高IFN信號可驅(qū)動CD8 + T細胞線粒體代謝途徑的變化，使其生物能量不適應且更容易死亡。本文證明在SLE患者的CD8 + T細胞中觀察到的代謝重編程是延長IFNα暴露和TCR刺激的結(jié)果。在這兩種刺激的持續(xù)組合下，這可能是SLE患者特有的一種情況，CD8 + T細胞表現(xiàn)出與NAD + 消耗增強、線粒體氧化能力降低和存活率下降相關(guān)的PARP基因表達增加（圖7)。總的來說，本文的發(fā)現(xiàn)證明高ISG特征與SLE CD8 + T細胞的代謝適合性之間的聯(lián)系，以及它們在壓力下或?qū)乖偌ぐl(fā)的反應中存活的能力。
4、TCR和IFN信號共同誘導CD8+T細胞代謝重組
為了研究導致IFN-HighCD8+T細胞線粒體和代謝變化的連續(xù)事件，接下來使用來源于健康對照和結(jié)合了延長IFN處理和TCR活化（這是SLE患者中存在的兩種基本細胞信號）的細胞。盡管CD8+T細胞暴露于IFNα里2天不會引發(fā)任何***的線粒體或代謝變化但7天IFNα暴露，尤其是結(jié)合T細胞活化，可誘導mtDNA編碼基因表達下調(diào)（圖4a）和線粒體變化（圖4b）。然后，分析了CD8+T細胞的氧化能力，發(fā)現(xiàn)在有或沒有CD3/CD28活化的情況下，7天IFNα刺激***增強了基礎(chǔ)OCR，但沒有比較大OCR，當數(shù)值標準化到每個樣本的基礎(chǔ)水平時，導致SRC降低，尤其是當IFNα暴露與T細胞活化結(jié)合時（圖4c）。 文章使用FMT(糞微生態(tài)移植)來確定大黃酸改變的腸道菌群是否對結(jié)腸炎有療效。
巨噬細胞在AP恢復不同階段的不同作用
鑒于AP恢復過程中巨噬細胞的表型變化，接下來試圖通過用脂質(zhì)體***巨噬細胞來檢查巨噬細胞在不同修復/再生階段的作用。首先，我們在急性炎癥反應后（從第1天到第2天）立即消耗了胰腺巨噬細胞，并在第3天檢查了胰腺。如圖所示，第3天之前巨噬細胞的消耗可以在很大程度上減少導管樣結(jié)構(gòu)，這表明巨噬細胞在ADM的形成。AP損傷后第3天巨噬細胞的消耗顯著延遲了胰腺修復。Ki67+細胞在第3天達到峰值，并隨著胰腺恢復逐漸下降。與組織學結(jié)果一致，發(fā)現(xiàn)CN處理組的Ki67+細胞從第5天到第7天大幅下降，但在CL處理組中沒有，表明CL處理小鼠的修復過程受損。 上海英拜生物提供可視化實驗過程參觀。江蘇16s測序科研
Caspase-11介導的肝細胞焦亡促進非酒精性脂肪性肝炎的進展。江蘇腸道菌科研
2.Lnc-PMIF抑制OPCs遷移到骨形成表面
在成骨細胞分化過程中，lnc-PMIF在早期增加，在礦化啟動后減少，表明lnc-PMIF可能在成骨分化的早期階段發(fā)揮作用。過表達/敲低lnc-PMIF不影響OPCs的增殖和成骨分化。敲低lnc-PMIF的細胞遷移減弱，敲低組細胞處理的小鼠脛骨中Dil標記細胞數(shù)量升高，小鼠中l(wèi)nc-PMIF表達更高。這些表明lnc-PMIF可抑制OPCs向骨形成表面的遷移，而不干擾其增殖和成骨潛能。
3.Lnc-PMIF與HuR相互作用抑制β-actin的表達以抑制OPC遷移
為探索Lnc-PMIF介導的OPC遷移的調(diào)節(jié)機制。RNApulldown-MS實驗尋找lnc-PMIF的相互作用蛋白，鑒定出一種RNA結(jié)合蛋白HuR，WB證實HuR在生物素標記的lnc-PMIF細胞裂解的下拉組分中富集，RNA免疫沉淀(RIP)試驗lnc-PMIF與HuR的結(jié)合。 江蘇腸道菌科研
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