長鏈非編碼RNAlongnoncodingRNA,IncRNA)指的是長度在200-100000nt之間的RNA分子。它們不編碼蛋白,但參與細胞內多種過程調控。近年來的研究表明,IncRNA參與了X染色體沉默。基因組印記以及染色質修飾,轉錄***。轉錄干擾。核內運輸等多種重要的調控過程,IncRNA的這些調控作用也開始引起人們廣泛的關注。IncRNA的種類遠遠超過編碼RNA,哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產“生的轉錄本是IncRNA(相應的蛋白編碼RNA的比例是1%-5%)。IncRNA已經成為非編碼RNA研究領域的一個熱點。本公司完善的實驗平臺和經驗豐富的實驗人員,可以為您提供完善IncRNA定量PCR技術服務,并完成數據分析,提供完整的實驗報告。這些數據表明大黃酸***可以改善DSS誘導的結腸炎。收縮壓科研服務兩年
LncExpDB提供101293個人類lncRNA基因(對應于331244個轉錄本)***且高質量的**。它包含了這些lncRNA在337個生物學條件下的豐富表達譜,這些條件屬于九個重要的生物學背景,涉及正常組織/細胞系、*細胞系、亞細胞定位、外泌體、細胞分化、植入前胚胎、***發育、晝夜節律和病毒***.此外,LncExpDB識別了25191個特征lncRNA基因,并表征了24508個lncRNA基因和17345個mRNA基因之間的28443865個共表達相互作用。
基于跨多個生物環境的綜合表達譜,LncExpDB具有增值管理和分析功能,可提供可靠轉錄的lncRNA基因。因此,我們發現92016個lncRNA基因(90.8%)得到可靠轉錄證據的支持(表達值閾值為1TPM),在九個生物學背景中分布不均。在可靠轉錄的基因中,大多數(82.6%)在至少兩種生物環境中表達,3318個lncRNAs(3.6%)在所有9種環境中表達。 上海醫學科研服務科研FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉移。
背景:超過100個不同的RNA修改特征已經在過去的幾十年里,其中,該N6-methyladenosine(m6A)修改是**豐富的形式在真核mRNA。不同的m6A讀者蛋白優先區分轉錄組范圍內的RNAm6A景觀。在細胞質中,大多數YTH(YTHDF1-3和YTHDC2)和IGF2BP(IGF2BP1-3)家族蛋白與m6a修飾的mrna結合并調節其穩定性和翻譯。此外,其他蛋白質可以結合m6a修飾的前體rna在細胞核內,并影響其加工。
m6a相關基因缺陷影響多種生物過程。例如,metttl3的缺失導致受損的胚胎干細胞退出自我更新走向分化;抑制METTL14導致明顯的胚胎生長遲緩;斑馬魚胚胎中YTHDF2的消融延遲了早期胚胎發育中的母-合子過渡。特別是,RNAm6a相關基因正在成為在各種**中促進**啟動和進展的關鍵調控因子,包括肺*中的metttl3、肝*中的metttl14、白血病中的FTO和乳腺*中的ALKBH5。然而,m6A如何調節*變以及下游通路和機制如何傳遞這些信號尚不完全清楚。
作者收集并分析了黑色素瘤患者在***過程中的連續血液樣本,在此期間,患者接受CDK4/6i聯合靶向MEK抑制劑***,隨后接受PD-1和CTLA-4 ICB聯合***(Fig.6 F),患者達到完全緩解。使用CITE-seq技術評估一系列患者樣本,觀察到CDK4/6i + MEKi***后CD8 + T細胞記憶群的頻率呈時間依賴性增加,其特征為SELL、IL7R和TCF7的高表達(Fig.6G-I),這與臨床分析一致。事實上,偽時間分析揭示了從記憶樣群體到效應細胞的分化軌跡,CDK4/6i在該軌跡早期抑制CD8 + T細胞,隨后的ICB***加速了分化(Fig.6J)。跨越該時間的TCR克隆追蹤也發現,CDK4/6抑制增加了罕見T細胞克隆的頻率,主要存在于記憶群體內,隨后ICB處理擴增了這些克隆(Fig.6K)。這表明ICB***釋放了外周血中更多種類T細胞受體。總之,這些數據表明,CDK4/6i可用作ICB給藥前促進更有利T細胞表型的啟動工具。
這項研究證明了在細胞毒性T細胞中藥理學抑制CDK4/6可誘導RB介導的G1期阻滯,并促進記憶表型的獲得,可***增強這些細胞的長期抗**活性(Fig. 7)。 鑒定的前列腺瘤細胞內源性雄***受體網絡。
系統性紅斑狼瘡(SLE)患者大多數存在I型IFN刺激基因(ISGs)的高表達。線粒體異常也有報道,但I型IFN暴露對這些變化的貢獻尚不清楚。此外,I型IFN通過上調脂肪酸氧化(FAO)和氧化磷酸化(OXPHOS)促進漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs)的線粒體功能。本文數據表明,I型IFN暴露通過代謝重編程促進CD8 + T細胞死亡,有助于SLE發病。本文于2021年3月發表在《Nature Communications》IF:12.121。
1、ISGs高表達患者OXPHOS基因下調
為了確定是否T細胞的轉錄組特征可以幫助鑒定SLE患者的疾病活動,作者對來源于***和未***女性的CD8+T和CD4+T細胞的mRNA進行測序。對DEGs進行聚類熱圖分析,發現SLE患者根據ISG表達水平被分為***的兩類:SLE-1和SLE-2(Fig.1a,b)。在兩種T細胞中,SLE-2類群的患者具有更強烈的I型IFN特征。在CD4+T細胞中,這種特征伴隨著參與JAK-STAT信號和T細胞共刺激的基因,而在CD8+T細胞中,ISG基因的高表達與基因參與細胞周期,響應DNA損傷和凋亡有關(Fig.1a,b)。 英拜生物提供專業的編輯潤色團隊保證服務到文章接收為止。行為絕望抑郁BDD科研實驗可參觀
Th1/Th2細胞失衡也是結腸炎的一個重要特征。收縮壓科研服務兩年
與對照組相比,乳腺*來源的外泌體miR-138-5p降低了M1相關表型,相反,M2標志物增加并伴隨著CD163陽性細胞數的增加(圖6G-I)。用從乳腺*細胞中分離出來的外泌體處理THP-1細胞導致了M2極化,抑制miR-138-5p的表達可挽救這種極化(圖4J-L)。總之,這些結果表明外泌體miR-138-5p通過抑制KDM6B表達調節巨噬細胞極化。
5、KDM6B去甲基化酶活性增加了M1相關基因的表達
抑制KDM6B的組蛋白去甲基化酶活性可抑制其靶基因的轉錄。因此,使用雙熒光素酶實驗來分析M1靶基因的啟動子活性。KDM6B的過表達特異性地刺激了促炎因子IL-6、IL-1β和TNF-α編碼基因的啟動子活性(圖5A)。相反,沉默KDM6B活性則導致他們的啟動子活性抑制,而過表達KDM6B降低了H3K27me3的水平(圖5B)。ChIP檢測顯示,與對照相比,THP-1細胞中KDM6B的過表達或敲除***增加或減少了KDM6B啟動子在不同區域的占用(圖5C-D)。與此結果一致,啟動子區域H3K27me3的募**降低或增加當KDM6B過表達或沉默時(圖5E-F)。總之,下調KDM6B可提高H3K27me3水平和促炎因子編碼基因的轉錄活性,導致抑制M1極化。 收縮壓科研服務兩年
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