m6A RNA甲基化是mRNA轉錄后**常見的內部甲基化。這是一個由m6A WER系統控制的可逆過程,由書寫器(W)、擦除器(E)和閱讀器(R)組成,而m6A甲基化的**終結果取決于特異性閱讀器的識別并結合。目前研究發現抑制肺腺*(LUAD)與m6A閱讀器YTHDC2相關。該研究2021年1月發表在《Redox biology》,IF:11.799的期刊上。
1.YTHDC2表達在LUAD中被抑制,且與臨床預后差相關
為了驗證m6A閱讀器在肺*的表達,作者通過GEPIA數據庫分析了LUAD中已知的閱讀器,包括YTHDF1/2/3、YTHDC1/2、HNRNPA2B1、HNRNPC/G、eIF3A、FMR1和IGF2BP1/2。如圖1A和B顯示,與正常肺相比,LUAD中YTHDC2、IGF2BP2表達下調,而結合Oncomine數據庫和Kaplan-Meier圖譜進一步分析,發現較低的YTHDC2與LUAD患者較差的總生存率相關(圖1D),這證實了YTHDC2與LUAD存在負相關的關系。 英拜生物提供生物科學內的專業的技術咨詢,技術合作。趨化因子科研整體服務
3)USP35過表達阻斷erastin/RSL3介導的**抑制作用
細胞也用慢病毒載體***以在體外過表達USP35,并通過PCR驗證其效率(圖3A)。然而,在基礎條件下,USP35過表達不影響H460和H1299細胞的細胞死亡和集落形成(圖3B,C)。裸鼠的**體積和重量也不受USP35過表達的影響(圖3D,E)。我們進一步研究了USP35操作是否對鐵刺激引起的細胞死亡有影響。不出所料,erastin或RSL3處理***降低了H460和H1299細胞的細胞活力或集落形成,而這是通過USP35過表達來阻止的(圖3F,G)。相應地,接種CTRL肺*細胞的裸鼠在erastin或RSL3***后**體積和重量減少;然而,這些**抑制作用被USP35過表達阻斷(圖3H,I)。總的來說,USP35過表達阻斷了erastin/RSL33介導的**抑制作用。 染色科研大黃酸導致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。
5)NOX4的升高通過抑制人類星形膠質細胞線粒體呼吸和ATP的產生來促進線粒體代謝的損傷,從而促進氧化應激
我們研究了AD期間NOX4升高誘導受損星形膠質細胞氧化應激的潛在分子機制。與對照組相比,NOX4過表達***抑制了OCR的基礎水平,且***降低了寡霉素和FCCP作用下的OCR水平(圖5A和B)。接下來,我們研究了NOX4上調對人類星形膠質細胞線粒體呼吸途徑調控的分子靶點。我們分析了包括NADH在內的5種線粒體ETC蛋白復合物的水平(圖5C)。與OCR水平一致,與對照組相比,NOX4過表達***抑制了5種線粒體氧化磷酸化酶復合物的蛋白水平并***減少ATP的產生(圖5D)。免疫熒光染色顯示,與對照組相比,NOX4的升高導致線粒體碎裂,并***增加了線粒體碎裂的細胞數量(圖5G)。這些結果表明,NOX4的升高通過抑制人類星形膠質細胞線粒體呼吸和ATP的產生,從而損害線粒體代謝,從而促進氧化應激。
H460和H1299細胞是表皮生長因子受體(EGFR)野生型細胞,我們進一步確定了在EGFR突變的H1650細胞中,USP35對細胞生長、鐵死亡誘導和**生長的作用。如圖5A-C所示,USP35沉默***減少了H1650細胞生長、集落形成和**進展。因此,在USP 35缺陷型H1650細胞中,ROS生成、MDA生成、細胞內LIP和Fe2+增加,而GSH水平和GPX4活性降低(圖5D-F)。相反,USP35過表達***阻止了erastin/RSL3誘導的體內外對H1650細胞生長、集落形成和**進展的抑制(圖5G-J)。在H1650細胞中過表達USP35也降低了ROS生成、MDA產生和鐵負荷的增加(圖5K-M)。總的來說,USP35過表達減少了erastin/RSL3觸發的鐵紊亂和鐵死亡。血清或尿液中尿酸濃度的升高與痛風腎臟和血管疾病密切相關。
環狀RNA(circRNA)是動植物中一類豐富且保守的RNA。**近的研究表明,circRNA可以通過充當非編碼RNA或編碼RNA發揮多種生物學作用。體外合成的circRNA可以不依賴于帽的方式進行翻譯。但鑒定circRNA編碼的蛋白質是困難的,主要是因為circRNA序列及其宿主基因的同源線性mRNA具有較大的重疊。近期NucleicAcidsResearch雜志在線發表了題名為:TransCirc:aninteractivedatabasefortranslatablecircularRNAsbasedonmulti-omicsevidence的文章,該文章主要講述了circRNA翻譯預測和分析的數據庫——TransCirc。METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。配體科研實驗可參觀
降低腸上皮細胞尿酸的產生。趨化因子科研整體服務
三、在體內,tbi介導的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制
為了確定TBI是否會損害體內的核質運輸,我們在果蠅運動神經元中過表達了一個帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達nlsnes -GFP的大腦中,GFP信號分布在細胞核和細胞質中(圖3A)。然而,定量分析顯示,在nls - nes -GFP表達的vnc暴露于TBI中,核GFP信號減少的細胞百分比***增加,而核GFP強度***降低(圖3B和C),說明GFP核進口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來,我們在運動神經元中表達了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標記的沒有核輸出活性的GFP蛋白。表達NLS的非創傷性腦損傷動物的腦細胞-ΔNES-GFP顯示了GFP在細胞核的強大定位(圖3A),而創傷性腦損傷動物的vnc顯示了核GFP減少的細胞數量***增加,核GFP強度降低((圖3B和C)。果蠅幼蟲暴露于TBI,并在DMSO單獨、KPT-350(0.05、0.1或0.5 mM)或KPT-276(50、200或1000 nM)上飼養。對經歷過TBI的果蠅幼蟲的羽化試驗顯示,KPT-350處理的動物(圖3D)或KPT-276處理的動物(圖3E)具有***的劑量依賴性的致死抑制。kpt -350處理的果蠅核GFP信號***高于dmso處理的對照組(圖3G)。 趨化因子科研整體服務
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗