作者進行了PAR-CLIP實驗，以評估SLC7A11 mRNA-YTHDC2相互作用是否依賴于m6A甲基化。結(jié)果表明，在H1299細胞中，通過過表達METTL3來提高m6A的甲基化水平，促進YTHDC2與SLC7A11 mRNA的結(jié)合(圖6D)。無論METTL3是否過表達，YTH結(jié)構(gòu)域的缺失都阻斷了SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用(圖6D)。作者通過SLC7A11 3’-UTR探針進行RNA-pull down實驗，發(fā)現(xiàn)YTHDC2WT，優(yōu)先結(jié)合于含有m6A的SLC7A11 mRNA的3'UTR，而不是含有未甲基化腺苷的mRNA(圖6E)。此外，YTHDC2傾向于結(jié)合m6A共識基元GGAC (圖6E)。通過在H1299和H1975細胞中進行METTL3的功能增加和丟失實驗，發(fā)現(xiàn)細胞內(nèi)SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用是由m6A水平?jīng)Q定的(圖6F和G)。這些數(shù)據(jù)表明YTHDC2優(yōu)先與m6A甲基化的SLC7A11 mRNA結(jié)合。為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機制。深圳細胞骨架調(diào)控因子科研
由于RPS3是NF-κB的重要調(diào)控因子，我們進一步分析了circPLCE1對NF-κB信號通路的影響。Western blot結(jié)果顯示，過表達circPLCE1-411導致全細胞提取物中p-P65表達降低，細胞核中P65表達下調(diào)。正如預期的那樣，核P65的DNA結(jié)合活性也減弱了。相反，circPLCE1-411敲低則上調(diào)了全細胞提取物中p-P65的蛋白水平，增加了細胞核中P65的積累，增強了細胞核中P65的DNA結(jié)合活性。綜上所述，circPLCE1-411結(jié)合HSP90α的N端，促進RPS3與HSP90α/RPS3復合物的解離，導致RPS3的泛素依賴性降解，抑制NF-κB信號。成都牙周病科研專注于生命科學內(nèi)的前沿研究。
急性腎損傷(Acute kidney injury, AKI)是一種起病急、進展快、預后差的嚴重臨床急癥。**近的證據(jù)表明，AKI伴隨著***的代謝異常，包括脂質(zhì)代謝的改變。然而，脂質(zhì)在AKI中的具體變化及其作用和調(diào)控機制目前尚不清楚。***小編給大家?guī)碛?021年3月發(fā)表在影響因子8.579的“Theranostics”的文章“Relieving lipid accumulation through UCP1 suppresses the progression of acute kidney injury by promoting the AMPK/ULK1/autophagy pathway”。本研究***系統(tǒng)分析AKI中脂質(zhì)組成的變化，發(fā)現(xiàn)脂質(zhì)積累程度與UCP1高度相關(guān)。重要的是，通過上調(diào)UCP1緩解AKI中的脂質(zhì)堆積，可以通過促進AMPK/ULK1/自噬通路，***抑制AKI的進展。
2、在體內(nèi)，慢性暴露于27HC可選擇更具致瘤性和轉(zhuǎn)移性的細胞目前已建立的聯(lián)系是膽固醇升高和**進展相關(guān)，作者認為，雖然這些臨床觀察與27HC抑制細胞增殖的結(jié)果不一致，這可能與本研究中通過使細胞/**發(fā)生膽固醇/27HC急性升高而建立的高膽固醇血癥模型有關(guān)。為了探索這種可能性，構(gòu)建27HC抗性版本的4T1、Py230、BPD6、HCC1954、MDAMB436和B16F10細胞，在5μM27HC持續(xù)存在的2D培養(yǎng)中傳代14個月，直到菌落出現(xiàn)。4T1、Py230和BPD6的27HC敏感和等基因抗性細胞在2D培養(yǎng)下的時間/劑量-響應生長曲線如所示。盡管27HC的敏感性存在***差異，但在不含27HC的情況下，敏感細胞（27HCS）和耐藥細胞（27HCR）的總體增殖能力相似。然而，當作為異種移植物在小鼠體內(nèi)傳播時，所有這三種細胞模型的27HC抵抗衍生物都顯示出比27HC敏感的衍生物更具有致瘤性。尾靜脈注射模型評估敏感和耐藥細胞的肺轉(zhuǎn)移能力，結(jié)果顯示，在三種模型(4T1,Py230和BPD6)中，對27HC的抗性與***增加的轉(zhuǎn)移潛能相關(guān)。綜上所述，細胞在適應27HC水平的增加時，獲得了使它們更具致瘤性和轉(zhuǎn)移性的活性。這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以改善DSS誘導的結(jié)腸炎。
二、偽時間軌跡，染色質(zhì)可及性和基因表達分析揭示Flow-Dependent內(nèi)皮細胞重新編程
我們的分析明確了3種主要的分化細胞類型:(1)ec，(2)免疫細胞(巨噬細胞，樹突狀細胞和T細胞)，以及(3)SMCs和纖維細胞(圖3A)。此外，在每一細胞類型走向的軌跡路徑上，還有許多其他細胞出現(xiàn)，表明它們響應d-flow的過渡性去分化狀態(tài)。為了更好地理解軌跡結(jié)果，我們將分析分為四種實驗條件(圖3B)。在s-flow條件下(2D-R和2W-R)，大部分細胞分化良好，少數(shù)細胞處于過渡狀態(tài)。相反，d-flow條件誘導許多ec進入過渡狀態(tài)，潛在地向smc和纖維轉(zhuǎn)化分化，表明EndMT。令人驚訝的是，我們還發(fā)現(xiàn)許多ec在急性d-flow條件下(2D-L)向免疫細胞轉(zhuǎn)移，在慢性d-flow條件下(2W-L)進一步增加。 我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。CAR-T科研省自然科學基金
N6甲基腺苷（m6A）是一種常見的真核細胞mRNA修飾。深圳細胞骨架調(diào)控因子科研
IL-3/IL-4能誘導M2巨噬細胞極化，預先用50ng/mLIL-3/IL-4處理THP-1細胞3天，驗證anti-miR-934對M2巨噬細胞極化的影響。結(jié)果顯示PTEN過表達部分減弱了miR-934和HCT-8細胞來源外泌體對M2標記物(CD206,arginase-1和IL10)表達的增強作用，而PTEN的沉默則相應地逆轉(zhuǎn)了anti-miR-934對M2標記物表達的衰減效應（Fig.5g,i）。流式細胞術(shù)檢測M2巨噬細胞標志物CD163在PMA處理的THP-1細胞中的表達，結(jié)果與上述結(jié)果一致（Fig.5j）。總之，研究結(jié)果表明，miR-934增強了CRC細胞來源的外泌體對M2巨噬細胞極化誘導的增強作用，而anti-miR-934減弱了其增強作用。
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗