為了表征RIT1相互作用組，我們進(jìn)行了親和純化-質(zhì)譜篩選(圖1A)，確定MAD2(MAD2L1)和p31conmet(也稱為MAD2L1結(jié)合蛋白)作為新的和選擇性的RIT1結(jié)合伙伴，不與其他RasGTPases相互作用(圖S1A和S1B)。MAD2參與了在未附著的動(dòng)點(diǎn)處催化MCC形成的SAC信號(hào)放大，MCC由MAD2、CDC20、BubR1和Bub3.1組成。16MAD2和p31conmet二聚促使我們?cè)u(píng)估RIT1是否與MAD2和p31conmet直接相互作用。Pulldown分析顯示，這兩種相互作用都直接且**于MAD2和p31conmet二聚(圖1B)。此外，RIT1-MAD2相互作用在斑馬魚和果蠅中是保守的(圖1C)。為了確定RIT1與MAD2或p31conmet的結(jié)合是否受其GTPase周期的調(diào)控，我們?cè)u(píng)估了與GTPgS(一種不可水解的GTP類似物)加載的RIT1的結(jié)合。這表明這兩種相互作用都不依賴于RIT1的鳥苷核苷酸負(fù)載狀態(tài)(圖1D)。一致地，與MAD2和p31conmet的結(jié)合不受與疾病相關(guān)的RIT1突變的影響(圖S1C)。這些結(jié)果表明，結(jié)合界面位于對(duì)GDP/GTP結(jié)合敏感的RIT1s開關(guān)I和II結(jié)構(gòu)域外，因此MAD2和p31conmet不是典型的RIT1效應(yīng)蛋白。MAD2和p31conmet的結(jié)構(gòu)相似性突出了RIT1的潛在結(jié)合競(jìng)爭(zhēng)。上海英拜生物提供可視化實(shí)驗(yàn)過程參觀。眼缺血綜合癥科研省自然科學(xué)基金
瀏覽工具將PROTAC-DB中的數(shù)據(jù)歸納為兩類：“目標(biāo)瀏覽”和“化合物瀏覽”。目標(biāo)瀏覽將在“PROTAC”、“彈頭”、“E3配體”和“Linker”類別選項(xiàng)卡下顯示目標(biāo)蛋白質(zhì)的名稱列表，點(diǎn)擊列表中選定的蛋白質(zhì)將跳轉(zhuǎn)到與該蛋白質(zhì)相對(duì)應(yīng)的所有化合物的列表。化合物瀏覽主要用于可視化“PROTAC”、“彈頭”、“E3配體”和“Linker”類標(biāo)簽下所有化合物的二維結(jié)構(gòu)。此外，在“PROTAC”、“彈頭”和“E3配體”類標(biāo)簽下還將展示生物活性。
可視化和過濾數(shù)據(jù)表中的結(jié)果查詢或?yàn)g覽結(jié)果顯示為數(shù)據(jù)表，包含2D結(jié)構(gòu)和其他信息，如化合物ID、目標(biāo)蛋白質(zhì)和生物活性(圖2)。 生產(chǎn)發(fā)育科研N6甲基腺苷（m6A）是一種常見的真核細(xì)胞mRNA修飾。
WTAP是DLBCL中piRNA-30473的一個(gè)功能重要的靶基因
作者研究WTAP是否在DLBCL的臨床結(jié)果中發(fā)揮了關(guān)鍵作用，并使用免疫組化分析來評(píng)估DLBCL患者樣本中WTAP蛋白的表達(dá)。免疫組化和GEO數(shù)據(jù)庫(kù)分析均顯示W(wǎng)TAP表達(dá)升高預(yù)示DLBCL患者預(yù)后不良(圖4A,4B)。另外耗盡WTAP也可誘導(dǎo)生長(zhǎng)抑制和細(xì)胞周期阻滯，且無凋亡跡象(圖4C,4D,4E,圖4F)。通過過表達(dá)WTAP可在很大程度上挽救對(duì)piRNA-30473的抑制作用。這些數(shù)據(jù)表明WTAP是piRNA-30473的重要功能靶點(diǎn)，并在DLBCL中發(fā)揮致*作用。
CD163是一種免疫調(diào)節(jié)劑，是巨噬細(xì)胞清清體受體家族的成員，已知在單核細(xì)胞系的AML細(xì)胞中表達(dá)。在 committed cluster 中其他基因的高表達(dá)包括免疫相關(guān)基因，如C1QA, CD14和MARCO。msl1基因，一種已知的白血病干細(xì)胞增殖抑制因子，也在committed cluster中高表達(dá)。我們通過qPCR驗(yàn)證了關(guān)鍵基因的差異表達(dá)(圖2B)。使用基因**富集分析(GSEA)，在committed 亞型中，免疫反應(yīng)通路如干擾素- γ介導(dǎo)的信號(hào)通路、GPCR信號(hào)通路和toll樣受體(TLR)信號(hào)通路上調(diào)(圖2C, D, Supplementary Figs. 16, 18，與FLT3-ITD和DNMT3A突變的弱相關(guān)性一致。大黃酸可以改變腸道菌群組成。
1、人PTC組織中tRFs和tiRNAs的表達(dá)為了鑒定人PTC組織中的tRFs和tiRNAs，收集3對(duì)PTC*組織和*旁組間，用于高通量測(cè)序，其結(jié)果比對(duì)至tRNAlibraryGtRNAdb文庫(kù)，并從中去除線粒體tRNA。**終累計(jì)獲得1723個(gè)tRN**段，其中594個(gè)片段只存在于**組織，136個(gè)只存在于*旁組織（圖1A-B）。成分分析顯示，**中tiRNAs的數(shù)量遠(yuǎn)超*旁組織，而tRFs則主要存在于*旁（圖1C）。火山圖可以看出5個(gè)在**組織中***上調(diào)的tRN**段：5’-tiRNA-Gly-GCC，5’-tiRNA-Lys-CTT，5’-tiRNA-Glu-CTC，5’-tRF-Val-CAC，pre-tRNA-Ser-TGA(Fig.1D)。圖1E顯示tRN**段1260，1293，1297和1385明顯來源于**組織。tRN**段1293和1297都是5’-tiRNA-Gly-GCC剪切自tiRNA-Gly-GCC的不同部分的。tRN**段1260切割自tRNA-Glu-CTC，tRN**段1358切割自tRNA-Lys-CTT。英拜在全國(guó)各省會(huì)城市均有自己的**客戶。江蘇佝僂病大鼠模型科研
METTL14上調(diào)促進(jìn)胰腺*生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。眼缺血綜合癥科研省自然科學(xué)基金
H&E染色顯示oil+ PBS組卵巢在不同發(fā)育階段均出現(xiàn)卵泡和少量新鮮黃體(圖1C)。與對(duì)照組相比，DHEA + PBS組的囊泡數(shù)量較多，黃體數(shù)量較少。另一方面，tempol處理減少了囊泡的數(shù)量，增加了黃體的形成(圖1C-E)。檢測(cè)了血清睪酮、eE2、LH、PRGE、FSH 5種性類固醇***水平。DHEA + PBS組血清睪酮水平明顯高于oil+ PBS組。Tempol***降低PCOS大鼠血清睪酮和eE2水平，但對(duì)血清LH、PRGE、FSH水平無明顯影響(圖1F)。DHEA處理的大鼠血清膽汁酸水平***降低，但這種減弱在DHEA + tempol組消失了(圖1G)。在DHEA + PBS組大鼠卵巢中，cleaved caspase-3的表達(dá)增加，而在tempol作用下，cleaved caspase-3的表達(dá)減少(圖1H)。TUNEL染色顯示，tempol***降低DHEA處理大鼠的凋亡細(xì)胞比例(圖1I)。提示tempol可改善PCOS大鼠卵巢功能障礙及卵巢組織病理損傷。眼缺血綜合癥科研省自然科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)