IGF信號通路科研服務兩年

來源: 發(fā)布時間:2021-11-14

6)FPN蛋白在肺*細胞中的穩(wěn)定性需要USP35

USP35屬于DUBs家族,在控制各種蛋白質的Ub依賴性降解中起關鍵作用。此外,F(xiàn)PN泛素化和隨后的內吞作用導致鐵超載和鐵死亡。因此,我們研究了USP35是否通過影響其蛋白質穩(wěn)定性來調節(jié)FPN表達。如圖8A所示,USP35敲除增加,而USP35過表達降低泛素化FPN水平。用MG132蛋白酶體抑制劑***后,shUSP35***細胞的全部或膜裂解物中FPN水平的降低被阻止(圖8B)。隨后,我們檢查了USP35是否是FPN的直接結合伙伴。IP分析的數(shù)據(jù)揭示了內源性USP35和FPN之間的聯(lián)系(圖8C)。總之,這些數(shù)據(jù)表明USP35可以直接與FPN相互作用,并作為deubiquitinase發(fā)揮作用,以保持其蛋白質穩(wěn)定性。 英拜提供分子生物學以及免疫病理相關實驗。IGF信號通路科研服務兩年

進一步檢測S100A4的功能,結果顯示敲除S100A4***降低高轉移性HCC細胞系的遷移和侵襲能力,過表達S100A4則***增強低轉移性HCC細胞系的遷移和侵襲能力(圖3d)。然后作者收集了S100A4敲除和S100A4過表達的HCC細胞的外泌體,結果得到了類似的結論,S100A4過表達外泌體***增強HCC細胞的遷移和侵襲,以及體內肺部轉移的能力(圖3e-f)。這些結果證實了外泌體S100A4具有增強HCC細胞轉移潛力的功能。

4、外泌體S100A4通過STAT3磷酸化***OPN轉錄

接下來探究了S100A4的作用機制,首先選擇了21個**干性相關基因,然后下載了GEO數(shù)據(jù)進行相關性分析,結果顯示S100A4主要和11個基因正相關(圖4a)。隨后檢測了不同HCC細胞系中敲除和過表達S100A4后11個基因的表達水平的改變,結果顯示只有OPN是S100A4的下游基因,其表達受到S100A4的調控(圖4b-f)。OPN是促進HCC轉移和干性的關鍵因子,但外泌體S100A4調節(jié)OPN的機制仍不清楚。 脂肪生產芯片科研實驗可參觀英拜生物提供生物科學內的專業(yè)的技術咨詢,技術合作。

使用SmartSeq2協(xié)議對15個胎兒的單個細胞進行scRNA-seq處理(圖1a)。基于差異表達(DE)分析和按標準化表達***性排序的前20個標記基因。紅細胞(表達HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細胞祖細胞和單核細胞(表達CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細胞、肥大細胞(表達CD63、GATA2和HDC)、漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs;表達IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環(huán)pDCs(表達pDC和增殖標記物;例如,MKI67)和粒細胞1、2和3(表達AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細胞分析顯示,在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在***的轉錄異質性,一些表型祖細胞群體(如造血干細胞、MPPs、cmp、gmp、MEPs和CLPs)由超過10個不同的轉錄定義群體組成(圖1c).注釋了23個不同群體(圖1d).

七、股骨和肝臟細胞在不同細胞類型之間的統(tǒng)計學差異

HSC/MPP簇中的細胞來源于肝臟,股骨和髖部,這為評估起源于胚胎肝臟或骨髓的HSC/MPP群體中潛在的定性和定量差異提供了機會。研究者首先對處于不同細胞周期狀態(tài)的肝臟和股骨細胞的數(shù)量進行了Fisher精確檢驗。結果顯示,在股骨和肝臟中,絕大多數(shù)CD-REF細胞處于G0/G1期,而肝臟中處于S-G2-M期的細胞數(shù)量幾乎是股骨的兩倍。KS和MWW檢驗顯示,與肝臟相比,股骨中HSCs/MPPS中基因表達數(shù)量也比較少,但股骨中HSCs/MPPs***上調了與核小體組裝、染色質組裝和DNA組裝有關的基因,而肝臟中HSC/MPPs***上調了與肌動蛋細胞骨架重塑、細胞粘附和遷移有關的基因。 METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。

METTL3增強APCmRNA的m6A和隨后的YTHDF結合抑制APC表達YTHDF1-3介導mRNA降解,針對YTHDF1的抗體進行RIP分析,實時定量PCR分析顯示,在KYSE180中,與APCmRNA結合的YTHDF2的數(shù)量遠遠多于YTHDF1和YTHDF3的數(shù)量,并且由于METTL3缺失而減少。這些結果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,在很大程度上促進了YTHDF2與APCmRNA的結合。為了研究YTHDF2與APCmRNA結合在APC表達中的作用,我們去除了YTHDF2,這增加了KYSE450細胞中APC的mRNA(圖5d和補充圖5e)和蛋白質表達。YTHDF1–3的聯(lián)合缺失進一步增加了這些細胞中APC的mRNA和蛋白質表達。此外,還進行了熒光素酶報告子分析,結果表明,缺失YTHDF2增強了由含m6A的WTAPCCDS序列驅動的熒光素酶活性,而突變的APC增強了熒光素酶活性,并使該活性抵抗了YTHDF2缺失的調節(jié)。此外,METTL3過表達抑制由WTAPCCDS序列驅動的熒光素酶活性通過YTHDF2耗竭恢復,其不影響突變的APC增強的熒光素酶活性。這些結果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,隨后的YTHDF結合抑制了APC的表達。英拜的實驗室坐落在上海漕河涇園區(qū)浦江園區(qū)。SCI科研地區(qū)科學基金

英拜有一支高精尖的團隊。IGF信號通路科研服務兩年

5.沉默lnc-PMIF促進老年OPCs向骨形成表面遷移,促進老年小鼠骨形成

BMSCs中沉默lnc-PMIF,增殖無變化,OPCs成骨能力不改變,細胞遷移數(shù)量高,表明沉默lnc-PMIF可增強老年OPCs的遷移能力,而不干擾老年OPCs的體外增殖和成骨分化。接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠中骨形成表面Dil+細胞數(shù)***升高,提示沉默lnc-PMIF可促進老年OPCs在體內向骨形成表面遷移,大部分遷移的Dil+細胞中檢測到Runx2表達,表明si-PMIF處理的老年BMSCs遷移到骨形成表面發(fā)生正常的成骨分化,這將有助于小鼠的骨形成。接受si-PMIF處理的老年BMSCs小鼠骨表面TGF-β+細胞的平均積分光密度***更高,而TRAP+面積無***差異,表明si-PMIF處理的老化BMSCs可能影響細胞募集,而不是骨吸收。上述si-PMIF或si-NC處理的老年BMSCs對老年雄性小鼠進行脛骨內注射,4周后接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠骨量更高,脛骨干骺端微結構更好,BMD和BV/TV更高,MAR和BFR/BS更高。這些結果證明,老年BMSCs敲低lnc-PMIF可促進骨形成。 IGF信號通路科研服務兩年

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎

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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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