PGE2 增強 IL4Rα 信號以增強巨噬細胞的 M2 ***
巨噬細胞能夠響應可變的局部微環境信號從一種功能表型切換到另一種功能表型。除了經典的信號級聯(例如,IL4/IL4Rα),巨噬細胞還可以整合由細胞外刺激觸發的代謝線索,以***它們的 M2表型。在這里,我們想知道 PGE2 是否也參與了 AP 損傷后胰腺巨噬細胞的 M2 極化。為此,我們首先檢查了 AP 損傷后 PGE2 的動態表達。COX1 和 COX2 是產生前列腺素的兩種關鍵酶。在這里我們發現Ptgs2 (COX2)的表達在第 3 天達到峰值,而Ptgs1 (COX1)的表達在第 1 天下降并在第 3 天回到基礎水平。一致地,免疫熒光分析顯示 PGE2 在第 3 天升高,并在第 5 天迅速恢復到基礎水平。值得注意的是,PGE2在第 3 天主要與導管樣細胞(CK19 +細胞)共表達,以及部分與巨噬細胞(F4/80 +細胞)共表達。此外,根據我們的 RNA-seq 數據和流式細胞術分析,我們發現巨噬細胞中 COX2 的表達也在第 3 天達到峰值。更有趣的是,與 IL4Rα -巨噬細胞和單核細胞相比,IL4Rα +巨噬細胞表達了更高水平的 COX2。 促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。浙江焦亡活化標書
在Fth- KO小鼠中, TBI后褪黑素對神經的保護作用被**取消
為了進一步探索神經元Fth的喪失是否影響褪黑素對TBI誘導的鐵死亡的影響,測量了鐵死亡的幾種假定的生物標志物。發現***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平沒有影響。令人驚訝的是,盡管褪黑素***的和未***的Fth -KO小鼠的Tfr1 mRNA和蛋白表達水平沒有顯著差異,但是在褪黑素***的小鼠中,觀察到Fpn mRNA和蛋白表達水平顯著增加Fth- KO小鼠。值得注意的是,與未***的Fth- KO小鼠相比,用褪黑素***Fth- KO小鼠未能顯著改變mRNA(Slc7a11,Ptgs2)和蛋白質(xCT,Cox2、4HNE)的表達。另外,用褪黑素***Fth- KO小鼠并沒有統計學上降低GSH和MDA以及4HNE的水平,和FJB陽性細胞的數目。這些結果表明褪黑素沒有統計學上減少TBI引起的鐵死亡和神經元變性。 重慶RNA甲基化標書在786-O細胞中穩定轉染靶向circSDHC的shRNA.
FIR 逆轉 circACTN4 在 BC 細胞中的**促進作用
為了進一步研究 circACTN4 是否通過 circACTN4/FUBP1/MYC 軸發揮其生物學作用,在 OE-FIR 或 sh-FIR 與circACTN4或si-circ#2 共轉染后,在 BC 細胞中進行了一系列拯救實驗。結果表明,FIR 過表達可以顯著逆轉 circACTN4 上調在 BC 細胞增殖、遷移和侵襲中的促進作用,而 FIR 敲低通過傷口愈合、EdU 和 transwell 測定減弱了 BC 細胞中 circACTN4 下調介導的抑制作用。此外,IF 分析還表明 FIR 過表達和敲低可以明顯逆轉 circACTN4 上調和下調對 MYC 表達的影響。IF發現與*旁組織相比,在BC 組織中 MYC 高表達。WB分析表明,FIR的上調和下調可以通過過表達和沉默circACTN4來抵消對MYC及其下游蛋白CDK4和CCND2表達的增強和抑制作用。綜上所述,上述結果進一步證明circACTN4可能與FUBP1競爭性結合,阻斷FIR對MYC的轉錄抑制作用,從而促進BC的**發生和進展。
白血病發生需要增強由致*基因引起的自我更新。其潛在的分子機制尚不完全清楚。本文確定C/D box snoRNAs和rRNA甲基化是白血病干細胞活性的關鍵決定因素。Aes基因在有融合基因AML1-ETO, PML-RARα和PLZF-RARα的白血病中高表達,但是其功能和機制一直是未知的。研究者通過老鼠模型和細胞系實驗,發現Aes對**細胞的自我更新能力是至關重要的。研究者通過RNA-seq對比Aes(*基因)缺失前后轉錄組的變化,意外發現大量的snoRNA下調,而在過表達Aes后snoRNA表達量***上升,這說明Aes能影響snoRNA的表達。有趣的是,研究者利用CRISPR技術敲除snoRNA后,發現即使是敲除單個snoRNA,rRNA的甲基化***降低,并且抑制白血病細胞的克隆形成能力。這說明,snoRNA不僅是一類受*細胞調控的非編碼RNA,更參與了**的發***展。AES通過與RNA解旋酶DDX21相互作用誘導snoRNA/RNP形成。CircRNA在NSCLC發生、發展中誘導免疫反應的行為和機制尚未見報道.
4、miR-208b直接靶向和抑制CD4+T細胞中PDCD4的表達
為了進一步探究miR-208b的分子機制,探究了其下游靶基因機制,使用生信預測了其靶基因,**終挑選到PDCD4(圖5A)。熒光素酶進一步證實了miR-208b和PDCD4之間的結合(圖5C-D)。研究發現,T細胞中PDCD4的表達在SW480外泌體處理組***下降,而這個抑制作用在SW480-OXA組更加明顯,PCD表達在miR-208b缺失組則***升高(圖5E)。此外,加入miR-208bmimics后,PDCD4蛋白***降低,而抑制miR-208b后,PDCD4蛋白的表達相對增強,此外,PDCD4在mRNA水平的表達沒有明顯變化(圖5F)。然后,評估了miR-208b對CD4+T細胞擴增的影響。研究表明,轉染miR-208bmimics***增強了Treg的擴增,而抑制miR-208b水平則抑制了Treg的擴增(圖5G-H)。這些結果表明miR-208b直接靶向抑制PDCD4的表達,導致Treg分化。
5、確認PDCD4在調節Treg擴增中的作用
隨后探究了PDCD4在調節Treg擴增中的作用。如圖A-C所示,成功構建了PDCD4的過表達和干擾表達細胞系。與對照組相比,PDCD4過表達***降低了Treg細胞的擴增率,而干擾其表達則***提高了Treg細胞的擴增率。表明PDCD4是負調節Treg細胞擴增的關鍵基因。 FMT可能通過***NF -κB信號通路來緩解腸道炎癥。肝損傷標書北京
circNDUFB2作為一個支架增強IGF2BP蛋白與TRIM25的結合。浙江焦亡活化標書
RNA甲基化修飾(m6A)研究
RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上,而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和lncRNAs上**為普遍的修飾。目前發現microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發生m6A修飾。m6A修飾主要發生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]。“編碼器(Writer)”即甲基轉移酶,目前已知這個復合物的成分有METTL3,METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉甲基化;m6A由m6A結合蛋白識別,目前發現m6A結合蛋白(讀碼器)有YTH結構域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3,YTHDC1和YTHDC2)和核不均一蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。 浙江焦亡活化標書
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1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗