4.Caspase-11缺失抑制MCD誘導(dǎo)的肝臟炎癥
接下來，我們評估了Caspase-11缺乏對MCD誘導(dǎo)炎癥的影響。首先，我們比較了野生型和Caspase-11缺陷小鼠肝臟白細(xì)胞浸潤情況。在正常情況下，野生型小鼠和caspase-11缺陷小鼠肝臟中CD45細(xì)胞的比例相似(圖4A和B)。MCD***導(dǎo)致野生型小鼠肝臟中CD45細(xì)胞的比例增加。相比之下，MCD****輕微增加了Caspase11缺陷小鼠肝臟中CD45細(xì)胞的比例。與MCD處理的野生型小鼠相比，MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠肝臟中CD45細(xì)胞的比例明顯下降(圖4A和B)，表明MCD處理后Caspase-11缺陷導(dǎo)致肝臟中白細(xì)胞浸潤減少。相應(yīng)地，我們發(fā)現(xiàn)了MCD***促進(jìn)肝臟F4/80的表達(dá)而Caspase-11缺乏則抑制MCD誘導(dǎo)的F4/80上調(diào)(圖4C)。我們進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)MCD***誘導(dǎo)野生型小鼠肝臟中TNF-α(圖4D)、IL-1β(圖4E)和CCL2(圖4F)的表達(dá)。相比之下，與MCD處理的野生型小鼠相比，MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠肝臟中TNF-α(圖4D)、IL-1β(圖4E)和CCL2(圖4F)蛋白水平***降低。這些結(jié)果表明Caspase-11缺陷抑制了MCD誘導(dǎo)的肝臟炎癥。 致力于醫(yī)學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的實驗技術(shù)服務(wù)和相關(guān)生物醫(yī)學(xué)課題的研究。胞漿
驗證LIR基序突變影響自噬
在HEK293T細(xì)胞中進(jìn)行co-IP，結(jié)果表明STBD1LIR基序W203C是影響基因互作的重要結(jié)構(gòu)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，STBD中W203C突變影響其與GABARAPL1的結(jié)合，進(jìn)而影響自噬指標(biāo)的表達(dá)。
5. 在臨床樣本中檢測STBD1的表達(dá)
在*組織、*旁中檢測STBD1的表達(dá)水平，結(jié)果表明STBD1在*組織中***下調(diào)，與之前的預(yù)測結(jié)果一致。
6.細(xì)胞實驗研究STBD1的功能
在多種*細(xì)胞中進(jìn)行細(xì)胞功能實驗，STBD1抑制*細(xì)胞生長，突變W203C會部分回復(fù)STBD1的抑制作用。
7.動物實驗驗證STBD1的功能
裸鼠成瘤實驗表明，STBD1抑制**生長。
8.轉(zhuǎn)錄組、代謝組分析
在細(xì)胞中干擾STBD1，然后進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序，分析表達(dá)水平***改變的基因，并進(jìn)行通路富集分析。分析發(fā)現(xiàn)，STBD1抑制**生長可能是通過改變基因轉(zhuǎn)錄和重塑糖酵解/糖異生途徑。
為了進(jìn)一步驗證STBD1是否重塑代謝，進(jìn)行代謝組分析。結(jié)果表明，STBD1敲除后糖酵解增強(qiáng)。
9.構(gòu)建LIRCP調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)
將LAMs對應(yīng)蛋白、自噬相關(guān)基因按照生物學(xué)功能聚類，構(gòu)建調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)，將自噬與**聯(lián)系起來。 T細(xì)胞Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物介導(dǎo)了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉(zhuǎn)移的積極作用。
急性髓系白血病(AML)的靶向***的實施一直具有挑戰(zhàn)性。FTO是一種m6A去甲基酶，作為一種致*基因，促進(jìn)白血病*基因介導(dǎo)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和白血病發(fā)生。因此為大家介紹于2021年3月發(fā)表于影響因子為8.579的Theranostics上文章“Saikosaponin D exhibits anti-leukemic activity by targeting FTO/m6A signaling”。在這里，我們研究了Saikosaponin-d (SsD)在AML中***的抗增殖作用中的作用，并通過靶向SsD的FTO來評估m(xù)6A去甲基化活性。SsD在體外和體內(nèi)均能***抑制AML細(xì)胞增殖，促進(jìn)細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期阻滯。機(jī)制上，SsD直接靶向FTO，從而增加了m6A RNA的甲基化，降低了下游基因轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性，導(dǎo)致相關(guān)通路的抑制。重要的是，SsD還克服了FTO/m6A介導(dǎo)的白血病對酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性。總之，F(xiàn)TO依賴的m6A RNA甲基化介導(dǎo)了SsD的抗白血病作用，使SsD成為一種***白血病的藥物。
為了確定CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934是否誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞的M2極化，首先生成了miR-934 mimics和anti-miR-934來過表達(dá)或抑制miR-934的表達(dá)。與對照組相比，轉(zhuǎn)染miR-934 mimics的巨噬細(xì)胞M2標(biāo)記物(CD163、CD206、arginase-1和IL10)的表達(dá)明顯增加（Fig. 3h, i）。此外，用anti-miR-934、miR-934 mimics或其陰性對照載體轉(zhuǎn)染HCT-8和HT29細(xì)胞，提取其外泌體并添加到PMA處理的THP-1細(xì)胞中。結(jié)果顯示，轉(zhuǎn)染anti-miR-934或miR-934 mimics的CRC細(xì)胞的外泌體中M2標(biāo)記物(CD206、arginase-1、IL10和CD163)在PMA處理的THP-1細(xì)胞中表達(dá)明顯低于或高于載體對照組（Fig. 3j, k）。綜上所述，證實CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934可以誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化。提供分子生物以及到后續(xù)動物建模的一整套服務(wù)。
結(jié)果顯示，過表達(dá)miR-337-3p和miR-137抑制了HMGA2、TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達(dá)(圖6E和6F)。agomir-3373p/137處理和sh-MIR210HG-或sh- HMGA2處理Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞中，b-catenin在細(xì)胞核中的分布減少，E-cadherin的表達(dá)增加。然后，我們研究了MIR210HG是否通過改變miR-337-3p/137-HMGA2軸來影響EMT進(jìn)展。Western blotting和免疫熒光結(jié)果顯示，MIR210HG的下調(diào)降低了Ishikawa和HEC1A細(xì)胞中HMGA2蛋白的表達(dá)，而加入miR-337-3p/137抑制劑后，對HMGA2、b-catenin和E-cadherin表達(dá)的抑制作用被逆轉(zhuǎn)(圖6G和6H)。ATM對PTEN的磷酸化驅(qū)動細(xì)胞周期進(jìn)程。蛋白組學(xué)
按照實驗設(shè)計路線和實驗結(jié)果進(jìn)行文章的構(gòu)思與潤色。胞漿
3.TYRO3通過抑制鐵死亡和**TME，誘導(dǎo)抗PD-1/PD-L1耐藥性。
為探究TYRO3在TME中的功能，首先評估了TYRO3-OE4T1和4T1-P**之間免疫學(xué)特征的整體變化。免疫細(xì)胞譜分析發(fā)現(xiàn)在CD45-**細(xì)胞中，Tyro3過表達(dá)與PD-L1或caspase-3無關(guān)，Tyro3-OE**中M1樣巨噬細(xì)胞水平降低，M1/M2比值下降，提示**表達(dá)的Tyro3促進(jìn)M1～M2巨噬細(xì)胞極化。用TYRO3-OEBT549細(xì)胞或TYRO3-OE和TYRO3–/–4T1**細(xì)胞的條件培養(yǎng)基孵育THP1單核細(xì)胞或骨髓源性巨噬細(xì)胞，進(jìn)一步驗證TYRO3的體外***功能。RNA-Seq發(fā)現(xiàn)VEGF在耐藥細(xì)胞系4T1-R和Tyro3-OE中表達(dá)上調(diào)，TYRO3-OEBT549細(xì)胞的條件培養(yǎng)基CM***降低M1標(biāo)記物的表達(dá)，增加M2標(biāo)記物的表達(dá)，加入VEGFR抑制劑完全消除TYRO3對巨噬細(xì)胞極化的影響。這些結(jié)果表明TYRO3通過上調(diào)VEGF降低M1/M2比值，從而促進(jìn)原瘤TME。 胞漿
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗