空間轉錄組學標書

來源: 發布時間:2021-11-16

YTHDF1水平的降低導致MGC-803移植**的**進展延遲(補充圖S2D和S2E);與對照組相比,YTHDF1缺陷**的重量和體積***減少(圖2D)。因此,在YTHDF1缺陷**中,增殖標記物Ki-67下調,凋亡標記物cleavedcaspase-3上調(圖2E)。通過兩種轉移模型探討YTHDF1是否參與了胃*的體內轉移。尾靜脈注射MGC-803-sicontrol細胞導致肺轉移,而注射MGC-803-siYTHDF1l細胞幾乎完全消除轉移淋巴結的形成。***建立了PDX模型,發現敲除YTHDF1抑制了**的生長和重量。上述結果表明YTHDF1在胃*發生中起重要作用。轉座酶染色質可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術。空間轉錄組學標書

PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩定性有關。此外,小鼠胚胎成纖維細胞(mef)中PTEN基因的缺失導致了未修復的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認為通過至少兩種分子機制促進了基因組的完整性。在細胞核中,PTEN與著絲粒結合蛋白CENP-C結合,促進著絲粒組裝和中期到后期的轉變。此外,作為轉錄因子E2F1的輔助因子,核PTEN似乎調節Rad51的表達,Rad51是DNA修復機制的關鍵組成部分。然而,后續的研究得出了不一致的結果,表明PTEN在轉錄水平上對RAD51的調控可能***于特定的細胞環境。標書與未接受FMT***的受傷小鼠相比接受FMT***的小鼠表現出相對更大的運動恢復。

一、scRNA-Seq和scATAC-Seq的整合

共嵌入的UMAP圖顯示,scRNA-seq和scATAC-seq數據集中分析的大部分細胞相互重疊,這表明在大多數細胞簇中,染色質可及性和相應的基因轉錄表達的變化是一致的(圖2A)。整合結果顯示,兩個數據集中所有巨噬細胞簇幾乎完全重疊,表明我們的研究中確定的所有巨噬細胞簇沒有明確區分。scATAC-seq和scRNA-seq數據的單個UMAP圖顯示了各自的小區集群標識(圖2B和2C)。然后使用每個細胞簇中**個上調的基因生成熱圖(圖2D)。如圖2E所示,暴露于慢性d-流中的ec表現出許多與致***途徑相關的已知生物學過程的誘導。

2、CDK4/6i介導的CD8+T細胞記憶獲得是細胞固有的

為了確定在CDK4/6i處理的**中觀察到的T細胞記憶是否由于CDK4/6在這些細胞內的直接抑制,在體外將活化的小鼠CD8+T細胞暴露于CDK4/6i中,并監測Tcm獲取和分裂數。***CDK4/6i暴露0、24、72h后,Tcm細胞平均分裂數減少,同時細胞比例增加,且呈劑量依賴性,*在24h內發生(Fig.2A)。這表明CDK4/6i不是簡單地抑制分化,而是直接促進記憶形成,表明細胞周期機制與分化之間存在方向性關系。通過3'RNA-seq進一步分析發現,在CDK4/6i處理后,記憶相關轉錄本增加,GSEA分析證實了記憶相關特征的富集,以及細胞周期相關特征的減少,包括E2F靶點(Fig.2B-E)。矛盾的是,CDK4/6抑制也誘導了效應相關轉錄本,包括Gzma、Gzmc和Pdcd1(Fig.2B-C),這與之前CDK4/6i促進T細胞活化的報道一致。 水蘇糖確實改善了PCOS大鼠卵巢功能障礙改善了卵巢組織病理損傷。

結果1)DRD2通過啟動子甲基化在轉錄上下調為了研究新的潛在TSGs,采用BrCa組織和正常組織進行RNA-seq篩選。與正常乳腺組織相比,BrCa組織中DRD2mRNA表達明顯下調(圖1A)。免疫組化染色發現,與BrCa組織相比,正常乳腺組織中DRD2蛋白水平也較高(圖1B)。同樣,基于TCGA,在BrCa中也觀察到DRD2mRNA的下調,并且在BrCa中DRD2啟動子甲基化也更頻繁(圖1C)。根據Kmplot,DRD2的高表達促進了BrCa患者的更長的生存期,這也在HER2陽性基因型患者中可見。但這一優勢在LuminalA患者中未見(圖1D)。根據RT-PCR和MSP結果,幾乎所有的BrCa細胞系與永凍的正常乳腺細胞系相比,都可以看到DRD2mRNA表達下調或缺失以及啟動子甲基化(圖1E)。因此,DRD2的高甲基化頻率可能有助于其下調BrCa。Aza藥物去甲基化恢復了兩種沉默的BrCa細胞系MDA-MB231和BT549中DRD2的表達(圖1F)。Tempol減輕PCOS大鼠腸道微生物失調.北京標書中標率高

circNDUFB2通過增強泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩定性。空間轉錄組學標書

4)APP/PS1小鼠大腦皮質區受損星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高

我們研究了NOX4來源的氧化應激在APP/PS1小鼠受損星形膠質細胞中的作用。我們用免疫熒光染色法測定了APP/PS1小鼠和野生型(WT)小鼠大腦皮層GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE的蛋白水平(圖4A)。免疫熒光染色顯示,與WT小鼠相比,APP/PS1小鼠皮質區GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE陽性染色強度增加(圖4A、C)。APP/PS1小鼠皮質區受損的GFAP陽性星形膠質細胞中4-HNE陽性染色強度升高。此外,與WT小鼠相比,APP/PS1小鼠中4-HNE和GFAP亞細胞共定位呈陽性的受損星形膠質細胞數量***增加(圖4D)。與WT小鼠相比,APP/PS1小鼠皮質區GFAP陽性星形膠質細胞(圖4B和E)和MDA與GFAP亞細胞共定位陽性的受損星形膠質細胞(圖4F)數量增加。4-HNE在APP/PS1小鼠NOX4陽性星形膠質細胞***定位(圖4G)。此外,APP/PS1小鼠NOX4和4-HNE陽性星形膠質細胞數量***增加(圖4H)。這些結果提示APP/PS1受損小鼠星形膠質細胞中氧化應激誘導的脂質過氧化水平升高。 空間轉錄組學標書

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