piRNA的預測識別:通過高通量smallRNA測序數據預測piRNA;piRNA全基因組分布特征分析:解析piRNA在全基因組范圍內的具體定位和簇分布特征piRNA臨近序列特征提取:采用motif短序列模式比配算法識別piRNA臨近調控區域加工區域特征，5"U端和10nt位置權重矩陣分析等計算調控序列的非隨機性概率,預測其序列調控功能。全基因組TE轉座子元件預測與重新注釋:針對物種基因組內的轉座子序列,將轉座子識別為若干類別,包括longterminalrepeat(LTR),longinterspersednuclear(LINE),andinvertedrepeat(R)elements。并結合piRNA的生成來源進行座位的富集度分析和聚類;全基因組特征區域的覆蓋度分析:針對rRNA,tRNA,miRNA,codinggene,repeat,transposon,Su(Ste),AT-ChX等特殊基因組功能區域進行序列的覆蓋度分析;piRNA全基因組ORF與CDS注釋:結合piRNA定位進行功能基因的分布分析;piRNA表達量計算與piRNA簇表達相關性分析:計算樣本之間的piRNA表達量,計算樣本之間piRNA簇之間的表達相關系數。統計重復序列內piRNA表達量分布.基因區piRNA表達量分布。部分課題提供SCI成文服務,-次收費，服務到底周期:--年，費用與IF以及接受時間有關。湖南實驗服務實驗可參觀
數據分析:原始數據產出統計數據飽和度分析表達豐度分布統計重復性分析(需有2次以上**的重復實驗數據)樣本間共有、特有及差異標簽統計標簽序列注釋基因表達圖譜分析基因表達模式聚類分析(不少于兩個樣品)基因差異表達分析GeneOntology顯菩性富集分析Pathway***性富集分析樣品要求●樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品。●樣品量:細胞樣品請提供至少1x107個細胞,組織樣品請提供至少100mg的組織塊或切片,RNA樣品請提供10μg以上的總RNA。。樣品質量:RNA無明顯降解,提取的總RNAOD260/280值在1.8~2.2之間,濃度z500ng/ul,28S:18S≥1.5,RIN≥●樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80*C保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80°C保存。樣品保存期間避免反復凍融。●樣品運輸:樣品置于1.5ml管中,封口膜封好。干冰運輸。風險提示:丁香通*作為第三方平臺,為商家信息發布提供平臺空間。用戶咨詢產品時請注意保護個人信息及財產安全,合理判斷,謹慎選購商品,商家和用戶對交易行為負責。對于醫療器械類產品,請先查證核實企業經營資質和醫療器械產品注冊證情況。重慶實驗服務售后服務此外,芯片上還包括16個已經被實驗證實的線粒體能量代謝信號通路的生物標識物基因。
佩土物多性性位測環境微生物多樣性檢測,是以樣品中的微生物群落作為整體進行研究,通過對核糖體RNA高變區域(比如16S/18S/1TS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)進行PCR擴增和測序,然后分析相應環境下微生物群落的多樣性和分布規律。生物信息分析1.原始數據整理、過濾及質量評估2.OTU生成和注釋3.基于物種豐度分析:◆稀釋曲線◆豐度分布曲線+Alpha多樣性分析◆物種豐度差異分析4.基于群落結構分析:◆單樣品物種分布餅圖多樣品物種分布柱圖+含進化關系的物種豐度+Beta多樣性分析5.根據客戶需求進行個性化分析
circRNA是通過特殊的選擇性剪切產生封閉環狀結構的非編碼RNA。circRNA不受RNA外切酶的影響。比線性RNA表達更穩定。研究表明,某些特殊的circRNA分子富含miRNA結合位點,在細胞中起到miRNAsponges的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用。ciRS-7(CDR1a)包含63個保守的miR-7結合位點,該circRNA在細胞中能夠有效吸附miR-7。而miR-7作為關鍵調節因子***參與**途徑,如抑制在乳腺*、膠質瘤等**中表達***上調的Pak1的表達;miR-7也能通過結合a-synuclein抑制其表達。這些研究暗示ciRS-7通過ceRNA機制調節miR-7的功能,是神經系統疾病和*****的潛在靶點。基金標書的寫作與基金申請指導:提供基金標書的修改,潤色.專業內容的提點。
技術優勢●通量高:一次測序得到500萬條以上的序列;●分辨率高:可以檢測小RNA單個堿基的差異;●精細度高:從幾個到數十萬個拷貝精確計數;.●不依賴已知信息:既能鑒定已知小RNA,又能發現新小RNA;.可重復性高:深度測序保證了抽樣隨機性,重復性非常好,無需重復實驗。全基因組重測序隨著測序成本降低和已知基因組序列物種增多,全基因組重測序已經成為動植物育種、群體進化、藥物研發、疾病研究和臨床診斷中**為迅速而有效的方法之一。全基因組重測序是對基因組序列已知物種的個體進行基因組測序,并在個體或群體水平進行差異性分析的測序方法。相比芯片檢測或者外顯子測序,華大科技采用短序列(Short-Reads).雙末端(Paired-End)和不同長度的插入片段(Insert-Size)的測序策略。可以***的挖掘基因序列差異和結構變異。在全基因組水平上掃描并檢測與生物體重要性狀相關的突變位點,具有重大的科研價值和產業價值。技術優勢:多種變異檢測:單核苷酸多態行(SNP).插入缺失(InDel)和結構變異(SV);與芯片方法比較,可以檢測到新的變異序列;與人類全基因組從頭測序相比,耗時更短、成本更低。每一輪測序反應體系中.只加入一種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)。湖南實驗服務實驗可參觀
NO是參與和抑制疾病發生的動態生物效應分子。湖南實驗服務實驗可參觀
技術優勢:多種變異檢測:單核苷酸多態行(SNP).插入缺失(InDel)和結構變異(SV);與芯片方法比較，可以檢測到新的變異序列;與人類全基因組從頭測序相比，耗時更短、成本更低。研究內容:一、數據產出統計基因組單堿基深度分布及覆蓋度分析二、一致性序列組裝根據與參考基因組序列的比對結果,利用貝葉斯統計模型檢測出測序個體基因組中每個堿基位點比較大可能性的基因型,并組裝出該個體基因組的一致序列。三、SNP檢測及在基因組的分布在全基因組一致性序列的基礎上,從中提取全基因組中所有的潛在多態性位點,再根據質量值、深度、重復性等因素做進一步的過濾篩選，**終得到高可信度的SNP數據集。根據已有的基因集對檢測到得變異進行注釋。四、InDel檢測及在基因組的分布使用測序個體的短序列與參考基因組進行Paired-End比對,將比對結果進行聚類分析,并結合Paired-End關系檢測可信的shortInDel。在檢測過程中,gap的長度為1~3個堿基。對于每個InDel的檢測，至少需要3個雙末端序列的支持。湖南實驗服務實驗可參觀
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗