服務流程2.1標準服務流程1)客戶溝通,確認實驗位點,并進行相關分析,提示實驗可行性。2)建立實驗方案,并在此過程中和客戶保持密切溝通。3)大規模實驗,有嚴格的指控流程保證實驗結果可靠。4)補數據,盡可能提高樣本的使用率。實驗數據質量控制流程1)所有分型信號要求信號清晰***,排除不確定信號干擾。2)每板數據中都有陰性對照,質控PCR和LDR污染數據。3)整個實驗服務流程有15%的雙盲重復對照,保證數據準確可靠。4)利用HWE原理進行數據評估。本公司在多年miRNA表達譜芯片服務的基礎上,推出基于lluminaGAllx的smallRNA測序服務.海南測序贈送提供技術路線
長鏈非編碼RNAs(longnon-codingRNAs,IncRNAs)是-類長度大于200nt且不編碼蛋白質的RNAS(不含rRNA),***存在于各種生物體內。IncRNAs參與表觀遺傳、轉錄以及轉錄后等多水平的調控過程,在生命活動中具有重要作用。本公司IncRNA測序服務使用高通量測序技術結合先進的生物信息學分析,-次性獲得樣本中幾乎全部的IncRNAs.信息,為您***、深入地研究IncRNAs的功能提供了全新的工具。實驗流程:1.樣品提取總RNA后,去除rRNA。2.RN**斷化。3.以短片段為模板,用六堿基隨機引物反轉錄合成雙鏈cDNA。4.經純化、末端修復、加堿基A、加測序接頭的步驟,根據測序長度和是否做對讀測序,確定瓊脂糖凝膠電泳回收片段的大小,并進行PCR擴增,完成測序文庫的制備。5.構建好的文庫經cBot擴增,用IluminaHiseq2500進行對讀測序。海南測序贈送提供技術路線人全外顯子組測序技術已逐步應用到單基因致病基因和復雜疾病易感基因研究中。
連接酶檢測反應(LigaseDetectionReaction,LDR)LDR是利用高溫連接酶實現對基因多態性位點的識別。高溫連接酶一旦檢測到DNA與互補的兩條穿聚核苷酸接頭對應處存在著基因點突變類型的堿基錯配,則連接反應就不能進行。如圖1:右邊的探針與模板有一個堿基不配對,所以連接反應不能進行,沒有連接產物;左邊的探針與模板DNA完全互補,故進行連接反應。通過溫控循環該特異性連接反應可反復進行,達到線性擴增的效果。PCR-LDR技術分型實驗流程1)通過多重PCR(MultiplexPCR)獲得含有待檢測突變位點的基因片斷,2)進行多重LDR(MultiplexLDR)進行特異性分型檢測。3)***通過測序儀電泳讀取檢測結果。
piRNA是一類長度為26~31nt單鏈的小RNA,大部分集中在29~30nt。piRNA的表達具有組織特異性,只存在于具有全能性的動物細胞,如生殖細胞、**細胞和干細胞等。piRNA通過與Piwi亞家族蛋白結合形成piRNA復合物(piRC)來發揮生物學功能(沉默轉錄基因過程,維持生殖系和干細胞功能,調節翻譯和mRNA的穩定性)。此外,piRNA在一些痘癥細胞中存在異常表達的現象,提示piRNA可能參與**的發生,并可作為**診斷和***中的潛在生物標記物。PiRNA的沉默機制主要利用(1)通過轉錄自與轉座元件(TE)加工而成piRNA,并結合互補結合TE抑制其轉錄;(2)通過編碼蛋白基因區轉錄加工成piRNA,與AGO3,AUB蛋白形成復合體抑制靶基因:(3)由基因3'UTR轉錄生成piRNA,并結合與PIW1,抑制靶基因:(4)從piRNA簇生成piRNA,并與AUB等蛋白相互作用起到抑制靶基因的目的。(5)另外,piRNA也被報道有起到高甲基化調控的協同調控行為。piRNA的生成加工過程途徑(BiogenesisPathway)主要分為二大類:(a)轉錄自TE轉錄元件或piRNA簇的反義鏈經過加工,加載到蛋白AUB或PIWI上形成功能piRNA。通常piRNA介導的piRISC復合體起到引發第二種生成加工途徑的激發作用。(b)通過AUB和AGO3蛋白的剪接體翠功能發生piRNA擴增效應。通過高通量smallRNA測序數據預測piRNA;
轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組研究是基因功能及結構研究的基礎和出發點,通過新一代高通量測序,能夠***快速地獲得某一物種特定組織或***在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息,已曠泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。技術優勢。任意物種的全轉錄組分析:無需預先設計特異性探針,因此無需了解物種基因或基因組信息,能夠直接對任何物種進行*****的轉錄組分析。通過酶切富集啟動子及CpG島區域,并進行Bisulfite測序,實現DNA甲基化狀態檢測的高分辨率。泌尿測序免費設計
提高了測序覆蓋度和均一性,測序數據更加準確、可靠。海南測序贈送提供技術路線
目前對circularRNA的研究還不多,特別是對這類RNA的生物學功能研究還有待挖掘。通過高通量測序技術尋找反向剪接的reads,即back-splicingreads。可以檢測樣本中circRNA表達及其發現樣本中新的circRNA。數據分析:1.基礎分析測序數據評估及預處理基因組比對circRNA預測circRNA注釋circRNA表達定量circRNA差異表達分析2.高級分析circRNA關聯基因的GO富集分析circRNA關聯基因的KEGG富集分析circRNA-miRNA靶向預測circRNA-miRNA-mRNAceRNA分析海南測序贈送提供技術路線
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗