隨后,作者研究了YTHDC2是否通過SLC7A11抑制胱氨酸攝取。當(dāng)YTHDC2在H1299細(xì)胞中過表達(dá)時(shí),并過表達(dá)SLC7A11完全恢復(fù)了受損的胱氨酸攝取(圖4E-G)。ATF4是SLC7A11轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,ATF4在H1299細(xì)胞中上調(diào)SLC7A11(圖4H、I)。過表達(dá)YTHDC2仍然拮抗ATF4的作用(圖4H-J)。因此,YTHDC2損害依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取。結(jié)合臨床分析,YTHDC2表達(dá)下調(diào),而SLC7A11表達(dá)上調(diào)(圖4K、L),并且它們?cè)?*中呈負(fù)相關(guān)(圖4M)。
5.YTHDC2以m6A依賴的方式使SLC7A11mRNA不穩(wěn)定
作者為研究YTHDC2是否在轉(zhuǎn)錄被阻斷后調(diào)控SLC7A11mRNA的穩(wěn)定性,通過泛轉(zhuǎn)錄抑制劑ActD處理H1299和H1975細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)YTH結(jié)構(gòu)域?qū)τ赮THDC2縮短H1299細(xì)胞中SLC7A11mRNA的半衰期至關(guān)重要(圖5A)。在H1975細(xì)胞中,CRISPR/Cas9技術(shù)使YTHDC2功能喪失,然后YTHDC2重構(gòu),進(jìn)一步證實(shí)YTHDC2加速了SLC7A11mRNA的衰變(圖5B)。EXOSC10是一種外切酶,負(fù)責(zé)3’-5’外切酶活性。EXOSC10的缺失,減弱了YTHDC2縮短SLC7A11mRNA半衰期的作用(圖5C、D)。在藥理學(xué)水平上,用兩種泛-RNase抑制劑DEPC和RNasin***H1299細(xì)胞,也阻斷了YTHDC2的功能(圖5D)。 caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。MCD誘導(dǎo)課題第三方實(shí)驗(yàn)室
我們發(fā)現(xiàn),在circMAPK1穩(wěn)定下調(diào)的SGC7901和MGC803細(xì)胞中,與對(duì)照組相比,MAPK1-109aa與MEK1的結(jié)合明顯減少,而MAPK1與MEK1的結(jié)合增加(圖7f)。在MKN45和BGC823細(xì)胞中,IRES突變時(shí)MAPK1-109aa不翻譯。因此,MAPK1與MEK1的結(jié)合沒有明顯變化。然而,過表達(dá)circMAPK1后,MAPK1與MEK1的結(jié)合***減少,而MAPK1-109aa與MEK1的結(jié)合***增加(圖7g)。因此,以上結(jié)果表明MAPK1-109aa與MAPK1競爭結(jié)合MEK1。隨后的Western blot結(jié)果也證實(shí),在過表達(dá)circMAPK1的細(xì)胞系中,MAPK1-109aa***升高,磷酸化的MAPK1/2降低,而在circMAPK1敲低的細(xì)胞中則相反(圖7h)。此外,MAPK1的下游效應(yīng)因子,如p-ELK1、p-c-Fos、p-c-JUN和p-RSK,也被過表達(dá)的circMAPK1***抑制(圖7i)。這些結(jié)果表明,circMAPK1編碼的MAPK1-109aa通過抑制MAPK1信號(hào)通路發(fā)揮抑*作用。pcr課題CRO生命科學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的精細(xì)研究。
2、CDK4/6i介導(dǎo)的CD8+T細(xì)胞記憶獲得是細(xì)胞固有的
為了確定在CDK4/6i處理的**中觀察到的T細(xì)胞記憶是否由于CDK4/6在這些細(xì)胞內(nèi)的直接抑制,在體外將活化的小鼠CD8+T細(xì)胞暴露于CDK4/6i中,并監(jiān)測Tcm獲取和分裂數(shù)。***CDK4/6i暴露0、24、72h后,Tcm細(xì)胞平均分裂數(shù)減少,同時(shí)細(xì)胞比例增加,且呈劑量依賴性,*在24h內(nèi)發(fā)生(Fig.2A)。這表明CDK4/6i不是簡單地抑制分化,而是直接促進(jìn)記憶形成,表明細(xì)胞周期機(jī)制與分化之間存在方向性關(guān)系。通過3'RNA-seq進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在CDK4/6i處理后,記憶相關(guān)轉(zhuǎn)錄本增加,GSEA分析證實(shí)了記憶相關(guān)特征的富集,以及細(xì)胞周期相關(guān)特征的減少,包括E2F靶點(diǎn)(Fig.2B-E)。矛盾的是,CDK4/6抑制也誘導(dǎo)了效應(yīng)相關(guān)轉(zhuǎn)錄本,包括Gzma、Gzmc和Pdcd1(Fig.2B-C),這與之前CDK4/6i促進(jìn)T細(xì)胞活化的報(bào)道一致。
相反,miR-199a-5p抑制劑處理可提高WT小鼠脾CD4+T細(xì)胞中Sirt1的表達(dá)(圖5E),并降低衰老標(biāo)志物p21,p16和乙酰p53水平(圖5F)。***,與MRL/lpr相比,hUC-MSCs可增加miR-199a-5p的產(chǎn)生,表明hUC-MSCs是miR-199a-5p來源的關(guān)鍵調(diào)控因子(圖5G)。在transwell系統(tǒng)中,hUC-MSCs與MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞共培養(yǎng)48h后,細(xì)胞內(nèi)miR-199a-5p升高,Sirt1基因表達(dá)降低,CD4+T細(xì)胞中衰老標(biāo)志物的表達(dá)水平恢復(fù),而miR-199a-5p抑制劑處理后仍處于抑制狀態(tài)(圖5G-I)。總的來說,這些數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p介導(dǎo)的Sirt1下調(diào)和隨后p53去乙酰化的減少,增加了脾臟CD4+T細(xì)胞的衰老。課題CRO服務(wù)找上海英拜。
2)阿爾茨海默病患者皮質(zhì)區(qū)受損星形膠質(zhì)細(xì)胞中氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化水平升高
由于NOX4蛋白水平在AD患者受損星形膠質(zhì)細(xì)胞中升高,我們研究NOX4在AD患者受損星形膠質(zhì)細(xì)胞氧化應(yīng)激中的作用。我們用免疫熒光染色法檢測了AD患者或非AD供者大腦顳葉皮質(zhì)組織中GFAP陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞中4-HNE的蛋白水平(圖2A)。免疫熒光染色顯示,AD患者(AD)皮質(zhì)區(qū)分子層GFAP陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞中4-HNE陽性染色強(qiáng)度相對(duì)于非AD供者增加(圖2A、B)。此外,AD患者皮質(zhì)區(qū)ML中受損的GFAP陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞4-HNE陽性染色強(qiáng)度高于非AD供者(圖2A和B)。AD患者中4-HNE與GFAP亞細(xì)胞共定位陽性的受損星形膠質(zhì)細(xì)胞數(shù)量***增加(圖2C)。此外,相對(duì)于非AD供體,4-HNE在AD患者的NOX4陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞***定位(圖2D)。AD患者的NOX4和4-HNE陽性星形膠質(zhì)細(xì)胞數(shù)量相對(duì)于非AD供者***增加(圖2E)。這些結(jié)果提示AD患者受損星形膠質(zhì)細(xì)胞中氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化水平升高。 課題外包服務(wù)找英拜放心安心。星形膠質(zhì)細(xì)胞
TRF測序課題整體服務(wù)。MCD誘導(dǎo)課題第三方實(shí)驗(yàn)室
Il4ra缺陷小鼠的M2 樣巨噬細(xì)胞減少和再生失調(diào)
為了探索再生過程中胰腺巨噬細(xì)胞的調(diào)節(jié)機(jī)制,我們進(jìn)行了基因集富集分析 (GSEA) 以比較第 3 天和第 1 天巨噬細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組譜。巨噬細(xì)胞的 M2 ***和 IL4 刺激特征從第 3 天開始富含巨噬細(xì)胞。我們發(fā)現(xiàn),表達(dá)IL-4和IL-13分別提高在第1天,和表達(dá)Il4ra自第1天升高,達(dá)到峰值在第3天。為了進(jìn)一步確定受體和配體的細(xì)胞來源,在 AP 損傷后***從胰腺中分離并比較了 CD45.2 +和 CD45.2 -細(xì)胞,有趣的是,Il4ra1被顯性免疫細(xì)胞上表達(dá)(CD45.2 +),而IL4和IL13中主要表達(dá)于實(shí)質(zhì)細(xì)胞(CD45.2 - )。此外,通過使用Il4ra 缺陷小鼠,我們證明了 IL4Rα 信號(hào)在 AP 損傷后胰腺修復(fù)/再生過程中介導(dǎo)了 M2 巨噬細(xì)胞的極化。值得注意的是,與它們的對(duì)應(yīng)物相比,來自Il4ra -/-小鼠的胰腺在第 3 天和第 5 天具有更多的 ADM 結(jié)構(gòu)。總的來說,這些發(fā)現(xiàn)表明 IL4/IL4Rα 軸是 AP 恢復(fù)過程中胰腺巨噬細(xì)胞 M2 極化所必需的,發(fā)揮***功能來控制 ADM 形成的程度。 MCD誘導(dǎo)課題第三方實(shí)驗(yàn)室
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
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7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)