piRNA的預測識別:通過高通量smallRNA測序數據預測piRNA;piRNA全基因組分布特征分析:解析piRNA在全基因組范圍內的具體定位和簇分布特征piRNA臨近序列特征提取:采用motif短序列模式比配算法識別piRNA臨近調控區域加工區域特征,5"U端和10nt位置權重矩陣分析等計算調控序列的非隨機性概率,預測其序列調控功能。全基因組TE轉座子元件預測與重新注釋:針對物種基因組內的轉座子序列,將轉座子識別為若干類別,包括longterminalrepeat(LTR),longinterspersednuclear(LINE),andinvertedrepeat(R)elements。并結合piRNA的生成來源進行座位的富集度分析和聚類;全基因組特征區域的覆蓋度分析:針對rRNA,tRNA,miRNA,codinggene,repeat,transposon,Su(Ste),AT-ChX等特殊基因組功能區域進行序列的覆蓋度分析;piRNA全基因組ORF與CDS注釋:結合piRNA定位進行功能基因的分布分析;piRNA表達量計算與piRNA簇表達相關性分析:計算樣本之間的piRNA表達量,計算樣本之間piRNA簇之間的表達相關系數。統計重復序列內piRNA表達量分布.基因區piRNA表達量分布。通過實時定量PCR的方法,研究者即能夠利用該芯片簡單可靠地同時檢測白血病的發生和發展相關的基因表達。寧夏實驗服務整體服務
TaqMan探針:該技術是由美國應用生物系統公司(ABI)研發的SNP分型技術,其技術原理如下:PCR反應時,加入-對兩端有不同熒光標記的MGB特異探針來識別不同的等位基因(llel和llele2),5端為報告熒光基團(reporter),3端為淬滅熒光基團(quencher)。PCR過程中,兩個探針能與正向引物和反向引物之間的互補序列特異退火結合。當探針以完整形式存在時,由于能量共振轉移,熒光基團只發出微弱熒光。特異的探針與相應的等位基因結合后,DNA聚合酶發揮5到3'外切酶活性,把報告熒光基團切割下來,脫離3端淬滅熒光基團的淬滅作用(quench),從而發出熒光。兩個探針的5端標有不同的熒光(FAM或VIC),3端標有MGB淬滅基團結合體。根據檢測到的不同熒光,可以判斷相應的樣本的SNP等位基因型。寧夏實驗服務整體服務為在基因組范圍內快速研究任-物種已知的smallRNA的表達情況和預測挖掘新的smallRNA調控分子提供工具。
LncRNA是一類轉錄本長度超過200nt的RNA,它們本身并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)調控基因的表達水平。生物體內含量相相當豐富,約占RNA的4-9%(mRNA約占1-2%)。LncRNA的組織特異性及特定的細胞定位,顯示IncRNA受到高度嚴謹的調控,目前已知其與發育、干細胞維持、**及-些疾病相關。雖然近年來隨著基因芯片及第二二代高通量測序技術的***運用,IncRNA不斷被發現,但此類轉錄本的確切功能還未知。目前市場上的IncRNA芯片通常格IncRNA與mRNA設計在一起,RNASeq數據中也包含IncRNA,mRNA序列,因此可以通過分析IncRNA與mRNA表達相關性對IncRNA進行功能注釋。
心臟毒性PCR芯片可用于研究由藥物或化合物誘導而發生心臟損傷的84個關鍵基因的表達。毒性反應是藥物上市的檢測指標之一,其中就包括心臟毒性反應的檢測。出于安全考慮,在過去40年,約有10%的藥品因為對心血管有影響而撤出臨床市場。傳統的形態學研究昂貴又耗時,且很難分辨是否為藥物或化合物引發的心臟毒性反應。這一芯片包含了多個模型中由于藥物或化合物引起的心臟損傷的生物標志物基因,既減少了實驗周期和成本,也能在研究**初階段就發現和剔除會引起心臟毒性反應的藥物。通過實時定量PCR的方法,研究者即能夠利用該芯片簡單可靠地同時檢測心臟毒性相關基因的表達。芯片包含幾個重要的糖基轉移酶和糖苷酶基因,包括半乳糖,葡萄糖,N-乙酰基半乳糖胺,巖藻糖和唾液酸。
高分辨率熔解曲線分析技術(HighResolutionMelting),簡稱HRM,是近年來興起的一種檢測基因突變、進行基因分型而及甲基化檢測的新方法。基本原理是基于核酸分子由于片段長短、GC含量、GC分布及單個堿基差異等物理性質不同而造成DNA分子在加熱變性時都會有不同的熔解曲線的形狀和位置,并配合運用高濃度的飽和熒光染料,可以迅速的檢測出核酸片段中GC含量和單堿基的突變。近年來,公司引進了RocheLightCycler@480II和ABIVIIA7全自動熒光定量PCR系統,為客戶提供專業化、個性化的甲基化HRM檢測服務。可以根據客戶研究方向選定研究課題,設計研究內容及研究路線,并提供相關實驗服務。寧夏實驗服務整體服務
部分課題提供SCI成文服務,-次收費,服務到底周期:--年,費用與IF以及接受時間有關。寧夏實驗服務整體服務
數據分析:原始數據產出統計數據飽和度分析表達豐度分布統計重復性分析(需有2次以上**的重復實驗數據)樣本間共有、特有及差異標簽統計標簽序列注釋基因表達圖譜分析基因表達模式聚類分析(不少于兩個樣品)基因差異表達分析GeneOntology顯菩性富集分析Pathway***性富集分析樣品要求●樣品類型:細胞、新鮮組織或RNA樣品。●樣品量:細胞樣品請提供至少1x107個細胞,組織樣品請提供至少100mg的組織塊或切片,RNA樣品請提供10μg以上的總RNA。。樣品質量:RNA無明顯降解,提取的總RNAOD260/280值在1.8~2.2之間,濃度z500ng/ul,28S:18S≥1.5,RIN≥●樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)可用TRIZOL或RNA保護劑處理或液氮凍存后,-80*C保存。RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80°C保存。樣品保存期間避免反復凍融。●樣品運輸:樣品置于1.5ml管中,封口膜封好。干冰運輸。風險提示:丁香通*作為第三方平臺,為商家信息發布提供平臺空間。用戶咨詢產品時請注意保護個人信息及財產安全,合理判斷,謹慎選購商品,商家和用戶對交易行為負責。對于醫療器械類產品,請先查證核實企業經營資質和醫療器械產品注冊證情況。寧夏實驗服務整體服務
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗