四、在體內(nèi)和體外，NUPs的上調(diào)導(dǎo)致TDP-43/TBPH定位錯(cuò)誤和聚集
為了檢測(cè)Nup上調(diào)對(duì)Tbph (Drosophila TDP-43)病理的影響，我們建立了一個(gè)位點(diǎn)特異性Nup62過表達(dá)(Nup62 OE)蠅線，并對(duì)內(nèi)源性Tbph進(jìn)行染色。在eGFP對(duì)照(以下稱為對(duì)照)表達(dá)的果蠅幼蟲VNC中，Tbph的分布以細(xì)胞核為主，而Nup62 OE幼蟲VNC***改變了Tbph的定位，出現(xiàn)細(xì)胞質(zhì)聚集(圖4A)。定量分析顯示，與對(duì)照組相比，Nup62 OE果蠅幼蟲或成年大腦中斑點(diǎn)Tbph***增加(圖4B）。與對(duì)照組相比，Nup62 OE vnc的核Tbph強(qiáng)度***降低(圖4C)。此外，核細(xì)胞質(zhì)(N/C)分割進(jìn)一步證實(shí)，與對(duì)照組相比，Nup62 OE動(dòng)物的Tbph N/C比值***降低(圖4D和E)，表明Nup62的上調(diào)改變了Tbph在體內(nèi)的亞細(xì)胞定位。Nup62表達(dá)引起的Tbph的錯(cuò)位和聚集也讓我們檢測(cè)了Nup62表達(dá)是否影響Tbph的溶解度。 完善的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)提供可視化的建模服務(wù)。肝脂肪變性課題整包服務(wù)
7）在體外，上調(diào)UCP1減少AKI期間的脂質(zhì)積累可通過AMPK/ULK1途徑促進(jìn)自噬
自噬已被證實(shí)在AKI中發(fā)揮重要作用。因此，自噬已經(jīng)成為我們關(guān)注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉(zhuǎn)染過表達(dá)UCP1或UCP1激動(dòng)劑CL316243的AKI細(xì)胞模型中，自噬相關(guān)指標(biāo)顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示，上調(diào)UCP1消除AKI中的脂質(zhì)積累后，細(xì)胞自噬得到促進(jìn)(圖7C)?；谶@些發(fā)現(xiàn)，為了驗(yàn)證自噬在UCP1功能中的重要性，我們進(jìn)行了功能恢復(fù)實(shí)驗(yàn)。如圖7D-F所示，氯喹抑制自噬***逆轉(zhuǎn)了順鉑組UCP1引起的炎癥指標(biāo)下降。同樣，TUNEL染色顯示，使用氯喹抑制自噬，可以明顯逆轉(zhuǎn)UCP1促進(jìn)的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結(jié)果表明，脂質(zhì)積累通過作用于AKI細(xì)胞自噬，在調(diào)節(jié)細(xì)胞功能方面發(fā)揮著重要作用。 circRNA課題協(xié)同創(chuàng)作產(chǎn)生關(guān)于環(huán)境影響疾病的病因和分子機(jī)制的可測(cè)試的假設(shè)。
確實(shí)，MMTVneu**的caspase-3陽性細(xì)胞比相應(yīng)的Pten+/+少;綜上所述，這些結(jié)果表明，PTEN不能被ATM磷酸化的細(xì)胞對(duì)基因毒性應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡具有抗性。為了評(píng)估表達(dá)PTEN-398A且DNA損傷未解決的細(xì)胞在輻照(圖2B, C和補(bǔ)充圖4B, C)后的持續(xù)存在是否是誘導(dǎo)凋亡反應(yīng)失敗的結(jié)果，我們?cè)贗R之前先用泛caspase抑制劑z-VAD-FMK (zVAD)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行預(yù)處理。與DMSO處理相比，zVAD增加了PTEN-WT細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量，其水平與DMSO處理的PTEN-398A細(xì)胞相當(dāng)(補(bǔ)充圖5F)。然而，需要注意的是，zVAD預(yù)處理也略微增加了IR后PTEN-398A細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量。
轉(zhuǎn)錄組學(xué) (RNA-Seq) 模塊
RNA-seq 模塊對(duì)與衰老相關(guān)的全基因組轉(zhuǎn)錄組變化進(jìn)行編目。RNA-seq 模塊中收集的數(shù)據(jù)集來自與衰老研究相關(guān)的已發(fā)表文章。該模塊收集在特定基因干預(yù)（過表達(dá)、敲除等）時(shí)觀察到的轉(zhuǎn)錄組變化，該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過程中基因表達(dá)譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個(gè)可能與衰老有關(guān)的差異表達(dá)基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中，可以通過基因名稱輕松搜索 DEG，并且每個(gè) DEG 條目都包含潛在的實(shí)驗(yàn)條件和基因表達(dá)的倍數(shù)變化及其發(fā)布的來源?？梢韵螺d每篇文章中的所有搜索結(jié)果和相應(yīng)的DEG數(shù)據(jù)庫。 了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。
2）M1-BMDMs來源的外泌體加重了bEnd.3細(xì)胞的EndoMT
我們?cè)u(píng)估了M1-BMDMs對(duì)bEnd.3細(xì)胞的影響。結(jié)果表明，M1-BMDMs條件培養(yǎng)基(M1-CM)***降低了bEnd.3細(xì)胞TEER值(圖2A)，并增加通透性(圖2B)。此外，TJs蛋白熒光染色顯示，M1-CM處理***降低了bEnd.3細(xì)胞膜ZO-1和Occludin的表達(dá)(圖2C和D)。為了進(jìn)一步研究M1-BMDMs是否通過外泌體破壞血管內(nèi)皮細(xì)胞的TJs，我們使用外泌體分泌抑制劑GW4869預(yù)處理M1-BMDMs。我們發(fā)現(xiàn)，加入GW4869部分逆轉(zhuǎn)了M1-CM誘導(dǎo)的TEER值的下降(圖2A)，滲透率增加(圖2B)；GW4869也逆轉(zhuǎn)了TJs蛋白熒光強(qiáng)度下降的趨勢(shì)(圖2C和D)。相應(yīng)的，TJs蛋白表達(dá)水平也出現(xiàn)了類似的結(jié)果(圖2E)。有趣的是，通過對(duì)脊髓切片中的α-SMA和CD31進(jìn)行共染色，我們發(fā)現(xiàn)損傷部位的共定位比未損傷部位更多(圖2F和G)。M1-CM***改變bEnd.3細(xì)胞形態(tài)，分枝減少，胞體拉長(zhǎng)(圖2H)。此外，M1-CM暴露***降低了CD31的表達(dá)，并強(qiáng)烈增強(qiáng)了EndoMT標(biāo)記物膠原I、III和α-SMA在bEnd.3細(xì)胞中的表達(dá)(圖2I)。然而，GW4869可以部分扭轉(zhuǎn)這些影響。綜上所述，外泌體可能介導(dǎo)巨噬細(xì)胞和血管內(nèi)皮細(xì)胞之間的相互作用，并可能是巨噬細(xì)胞誘導(dǎo)血管內(nèi)皮細(xì)胞EndoMT的原因。 caspase-3抗體是一種***用于檢測(cè)凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。轉(zhuǎn)運(yùn)RNA 課題產(chǎn)學(xué)研合作
表達(dá)PTEN- 398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點(diǎn)的***有關(guān)。肝脂肪變性課題整包服務(wù)
上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)促進(jìn)**發(fā)生和轉(zhuǎn)移，增加**對(duì)***干預(yù)的耐受性。TGF-b和Wnt通路的異常***誘導(dǎo)EMT。lncRNAs***影響EMT調(diào)控。2021年6月發(fā)表于Molecular Therapy-Nucleic Acids（IF=8.886）的文章“l(fā)ncRNA MIR210HG promotes the progression of endometrial cancer by spongingmiR-337-3p/137 via the HMGA2-TGF-b/Wnt pathway”對(duì)此展開了研究。在此，我們發(fā)現(xiàn)MIR210HG在子宮內(nèi)膜*組織中過表達(dá)，與不良預(yù)后相關(guān)。MIR210HG的沉默在體外***抑制了細(xì)胞增殖、遷移、侵襲和EMT表型的形成以及在體內(nèi)的**發(fā)生。生物信息學(xué)分析、RIP分析和熒光素酶分析表明，MIR210HG作為miR-337-3p和miR-137的分子海綿，調(diào)節(jié)HMGA2的表達(dá)。此外，MIR210HG過表達(dá)***增強(qiáng)了Wnt/b-catenin和TGF-b/Smad3信號(hào)通路基因，而MIR210HG或HMGA2下調(diào)抑制了Wnt/b-catenin和TGF-b/Smad3信號(hào)通路基因。我們?cè)贛IR210HG-miR-337-3p/137-HMGA2軸上的發(fā)現(xiàn)說明了其作為子宮內(nèi)膜****發(fā)展的靶點(diǎn)的潛力。肝脂肪變性課題整包服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)