結果顯示,敲低Mettl3降低了HCT116細胞中p53前體mRNA水平,而 Mettl3 過表達增加了p53前體mRNA水平而不影響hnRNPA2B1的蛋白質水平。使用針對 p53 3'UTR 和CDS區域的特異性引物進行MeRIP-qPCR以檢測 m6A水平,結果顯示沉默 Mettl3 導致3' UTR峰m6A甲基化水平降低,而過表達 Mettl3 具有相反的效果。接下來,RIP分析證實了hnRNPA2B1和p53前體 mRNA 之間的相互作用通過消耗Mettl3被抑制或通過過度表達Mettl3 增強。
p53 3'UTR 熒光素酶報告基因檢測發現hnRNPA2B1敲低降低了含有 p53 3'UTR的熒光素酶構建體的活性,而Mettl3過表達增加了由 hnRNPA2B1 敲低誘導的熒光素酶活性降低。建立了 p53 3'UTR mut 熒光素酶測定。發現p53 3'UTR mut的螢光素酶活性對hnRNPA2B1敲低或Mettl3過表達沒有反應。數據表明,p53前體mRNA的表達受hnRNPA2B1與p53 3'UTR上m6A位點的結合控制。 按照實驗設計路線和實驗結果進行文章的構思與潤色。海南課題技術指導
一、人胎肝和骨髓造血室的單細胞轉錄組
為獲取胚胎發育期間造血細胞的全部譜系,研究者從17 – 22 PCW的胚胎肝臟、股骨和髖骨中對表型確定的血液群體進行單細胞分類,并對15個胚胎的單個細胞進行scRNA-seq檢測(圖1)?;诓町惐磉_分析和標準化表達***性排名前20的標記基因,標注了23個不同的群體,發現在肝臟或股骨中檢測不到任何T細胞或先天淋巴細胞(ILCs),單細胞分析顯示在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在大量的轉錄異質性,其中一些表型祖細胞群體(如HSCs,MPPs,CMPs,GMPs,MEPs和CLPs)由10多個不同的轉錄表型定義群體組成,這進一步證明人類臍帶血的祖細胞室具有高度的異質性。此外,該研究分析表明當前使用的細胞表面標記物不能很好地預測人類胚胎造血祖細胞的轉錄狀態。 自噬醫學相關課題動物模型構建產生關于環境影響疾病的病因和分子機制的可測試的假設。
10.EVs介導的ELNAT1與BCa淋巴結轉移相關
確定EVs介導的ELNAT1在BCa淋巴結轉移中的臨床意義十分重要。首先,作者發現來自BCa患者的尿中EVs與配對BCa組織的ELNAT1表達呈正相關,這意味著EVs介導的ELNAT1是BCa中ELNAT1調控的重要參與者(Figure10A)。同時,BCa患者的尿中EV介導的ELNAT1過表達與BCa的淋巴結轉移呈正相關(Figure10B)。EV介導的ELNAT1表達較高的BCa患者總生存期(OS)和無病生存期(DFS)率較短(Figure10C-D)。ROC分析顯示尿液中EV介導的ELNAT1可有效區分BCa患者與健康志愿者(Figure10E)。與尿液細胞學和FISH檢查結果相比,尿液中EVs介導的ELNAT1診斷BCa-LN轉移的準確性很高(Figure10F)。BCa患者血清中EVs介導的ELNAT1表達水平高于健康對照組(Figure10G)。與無淋巴結轉移的BCa患者血清相比,伴有淋巴結轉移的BCa患者血清中EVs介導的ELNAT1表達上調(Figure10H)。
結論:EVs介導的ELNAT1促進了BCa的淋巴管生成和淋巴結轉移。充分闡明EVs介導的ELNAT1***hnRNPA1/UBC9/ SOX18軸誘導BCa淋巴結轉移的精確機制,不僅將增加我們對EVs介導的淋巴結轉移的認識,也將有助于開發一種***BCa的有效策略。
因為CXCL13是一種趨化劑,可以促進表達CXCR5的細胞趨化,使用IHC染色評估其在CRC中的表達,結果顯示CXCR-5在結直腸*組織中的染色強于正常組織,說明M2極化巨噬細胞分泌的CXCL13主要作用于CRC細胞(Fig. 7d)。PMA預處理后的THP-1細胞轉染miR-934 mimics,并與加入anti-CXCL13抗體或IgG的SW480細胞或RKO細胞共培養。此外,上述TPH-1細胞液與敲除CXCR5的細胞共培養。體外transwell實驗顯示,在與miR-934過表達PMA處理的THP-1細胞的CM共培養組中,anti-CXCL13抗體抑制了CRC細胞的遷移和侵襲;轉染了shCXCR5的SW480和RKO細胞與miR-934過表達PMA處理的THP-1細胞共培養時,遷移和侵襲能力降低(Fig. 7e, f)。此外,小鼠體內肝轉移檢測表明,與對照組相比,用anti-CXCL13抗體或敲除CXCR5的CRC細胞的肝轉移菌落減少(Fig. 7g–i)。高表達的外泌體CD44v6和C1QBP是預測PDAC患者預后和肝轉移的很有前途的生物標志物。
三、染色質可及性與細胞類型特異性轉錄因子活性和染色質相互作用網絡有關
HNF4A編碼驅動近端小管分化的關鍵轉錄因子。chromVAR檢測到近端小管DAR中HNF4A結合基序的富集(圖3b,基序活性),這是HNF4A中染色質可及性增強(圖3b,基因活性)和snRNA-seq數據集中HNF4A轉錄增強(圖3b,基因表達)所支持的。我們通過染色質免疫沉淀,然后定量PCR (ChIP-qPCR)驗證了HNF4A與腎近端小管上皮細胞(RPTEC,補充圖8a)中選定的靶基因位點(SLC34A1, SLC5A2, HNF4A) DAR中預測的HNF4A結合位點的結合。 然而,在RPTEC中可檢測到HNF4A的表達水平低于腎皮質,這表明HNF4A與該細胞類型中的這些位點具有強大的相互作用(補充圖8b)。 根據自身需要檢索相關基因或者化學品。內蒙古課題整體服務
提供分子生物以及到后續動物建模的一整套服務。海南課題技術指導
現今研究表明tRNA-derivedsmallnoncodingRNAs(sncRNAs)主要分為兩類:tRNAhalves(tiRNAs)和fragments(tRFs)。前者在人類實體**中的的生物學功能吸引了越來越多的關注,但是其在**發生中的生物學機制仍知之甚少。tiRNAs和剪切相關蛋白之間的相關作用更是為未可知。本研究***發現一個5’-tRNAhalves,即tiRNA-Gly通過與RBM17結合誘導可變剪切進而促進**狀甲狀腺*(PTC)的增殖和遷移。本文于2021年7月發表在影響因子7.068的《JournalofExperimentalandClinicalCancerResearch》期刊上。海南課題技術指導
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