外泌體microRNAs (miRNAs)與多種**的發展和進展有關；然而，它們是否于髓母細胞瘤(MB)的發生仍有待闡明。在此，有研究發現外泌體miR-101-3p和miR-423-5p在兒童MB的發病中起重要作用，該研究于2021年7月發表在《Cell Death and Differentiation》，IF：15.828。
MB患者血漿來源的外泌體中miR-101-3p和miR-423-5p水平上調，這些miRNA可通過外泌體轉移到**細胞中在初步篩選中，使用超離心法從MB患者和年齡匹配的健康對照組(n=4)的血漿中分離出外泌體。通過透射電子顯微鏡分析分離出的外泌體，以確定外泌體的平均大小和形態，顯示出典型的直徑為150nm的雙層球形結構。通過westernblot檢測了外泌體標志物CD9、CD63和GM130的表達。分離的顆粒外泌體**蛋白標記CD9和CD63陽性，順式高爾基標記GM130陰性。 環狀RNA（circRNA）是一類共價閉合的單鏈RNA.項目標書服務兩年
二、阻斷atm依賴的PTEN磷酸化導致基因組
為了確定ATM介導的PTEN磷酸化如何調節DDR，構建Pten398A/398A和Pten+/+littermatesMEFs細胞模型。PTEN蛋白水平不受398A突變的影響(補充圖3A,B)。此外，磷酸化AKT(PI3K通路活性的標記物)水平在Pten398A/398A和PTEN+/+MEFs中相似(補充圖3B)。構建人乳腺上皮細胞系(MCF10A)，穩定表達野生型PTEN(PTEN-wt)，或PTEN的突變形式，不能被ATM磷酸化(PTEN-398a)。在這些細胞中，內源性的PTEN基因被CRISPR/Cas9編輯刪除，創建了PTEN空細胞，然后用野生型或突變型的蛋白質穩定轉導重組。在表達PTEN-wt和PTEN-398a的MCF10A細胞中，PTEN蛋白和磷酸化AKT水平相似(補充圖3A)，使這些細胞成為ATM磷酸化PTEN分子作用研究的合適替代模型。Pten+/+和Pten398A/398Amef在10gyIR作用下，通過測定每個細胞的γH2AX和53bp1病灶數量來評估其修復DNA損傷的能力。在Pten+/+mef中，我們觀察到在照射后4小時，每個細胞的病灶數量達到峰值，24小時后恢復到接近基線水平(圖2AC)。Pten+/+和Pten398A/398A在ir后4小時，每個細胞聚集的病灶數量相似。然而，Pten398A/398Amef在24小時時間點比Pten+/+mef保留了更多的病灶數，表明DNA修復能力降低(圖2C)。 泌尿標書技術指導circNDUFB2作為一個支架增強IGF2BP蛋白與TRIM25的結合。
細胞周期蛋白依賴性激酶4和6(CDK4/6)的藥理學抑制劑是***受體陽性乳腺*的獲批***藥物，目前正在其他**類型的數百項臨床試驗中進行評價。這些抑制劑的臨床成功在很大程度上歸因于定義明確的**內在細胞抑制機制，而其作為免疫調節劑的新作用知之甚少。本研究利用整合的表觀基因組、轉錄組學和蛋白質組學分析，證明了CDK4/6抑制劑在促進免疫T細胞記憶的表型和功能獲得中的新作用。本文的機制見解拓寬了CDK4/6抑制劑作為增強抗**T細胞免疫的臨床工具的前瞻性效用。本研究于2021年5月14日發表在《Cancer Discovery》IF:29.497期刊上。
對snATAC-seq數據集使用97%置信閾值對細胞類型分配進行過濾，以去除異型雙重體。通過標簽轉移獲得的snATAC-seq細胞類型預測(圖1d)與無監督簇的編輯注釋(圖1e, f)的比較表明，所有主要的細胞類型都存在于這兩個數據集中，并且在檢測和分配細胞身份方面，snATAC-seq與snRNA-seq具有可比性(補充圖3)。使用基于基因活性的細胞類型分配進行下游分析，這是通過對snatc -seq數據集的無監督聚類獲得的。有趣的是，snATAC-seq能夠檢測到近端小管簇內的兩個亞群，這可能**近端曲小管(圖1e, PCT)和近端直小管(圖1e, PST)。PCT顯示編碼SGLT2的SLC5A2具有更強的染色質可及性;而PST在編碼SGLT1的SLC5A1(圖1f，補充圖4)中表現出更強的可達性。SGLT2在近端小管S1和S2段重新吸收葡萄糖，SGLT1位于S3。circSDHC來源于第1染色體上的SDHC基因.
3.分析突變的LIR基序（LAMs）在泛*中的作用
使用TCGA數據庫分析發現，STDB1在泛*中為抑制**；在膠質母細胞瘤中為促進**。
驗證LIR基序突變影響自噬
在HEK293T細胞中進行co-IP，結果表明STBD1LIR基序W203C是影響基因互作的重要結構。
進一步研究發現，STBD中W203C突變影響其與GABARAPL1的結合，進而影響自噬指標的表達。
5. 在臨床樣本中檢測STBD1的表達
在*組織、*旁中檢測STBD1的表達水平，結果表明STBD1在*組織中***下調，與之前的預測結果一致。
6.細胞實驗研究STBD1的功能
在多種*細胞中進行細胞功能實驗，STBD1抑制*細胞生長，突變W203C會部分回復STBD1的抑制作用。
7.動物實驗驗證STBD1的功能
裸鼠成瘤實驗表明，STBD1抑制**生長。
8.轉錄組、代謝組分析
在細胞中干擾STBD1，然后進行轉錄組測序，分析表達水平***改變的基因，并進行通路富集分析。分析發現，STBD1抑制**生長可能是通過改變基因轉錄和重塑糖酵解/糖異生途徑。
為了進一步驗證STBD1是否重塑代謝，進行代謝組分析。結果表明，STBD1敲除后糖酵解增強。
9.構建LIRCP調節網絡
將LAMs對應蛋白、自噬相關基因按照生物學功能聚類，構建調節網絡，將自噬與**聯系起來。
在786-O細胞中穩定轉染靶向circSDHC的shRNA.服務標書
circRNAs在腎細胞*(RCC)中的表達模式和生物學功能.項目標書服務兩年
Pur-α降低AD患者Aβ負荷，防止認知功能下降**近研究表明，Pur-α在硬化癥和額顳葉癡呆中起重要作用。但對Pur-α在AD中的作用知之甚少。由于Pur-α是CircCwc27的直接靶點，研究中通過注射與腺*病毒相關的、攜帶flag標記物的Flag-AAV9-Control和Flag-AAV9-Pur-α到APP/PS1小鼠海馬體中，觀察Pur-α對AD病理的影響。注射兩個月后，在小鼠海馬體中出現明顯的綠色熒光，說明存在有效轉導 。然而，CircCwc27在Pur-α過表達的大腦中表達沒有變化。與對照組相比，Pur-α過表達***減少APP/PS1小鼠海馬區Aβ沉積和促炎因子。注射Flag-AAV9-Pur-α在很大程度上保護APP/PS1小鼠免于嚴重的記憶缺陷。綜上所述，Pur-α可減少Aβ沉積，挽救空間記憶損傷。項目標書服務兩年
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗