凋亡課題實驗外包

來源: 發布時間:2021-12-02

進一步檢測S100A4的功能,結果顯示敲除S100A4***降低高轉移性HCC細胞系的遷移和侵襲能力,過表達S100A4則***增強低轉移性HCC細胞系的遷移和侵襲能力(圖3d)。然后作者收集了S100A4敲除和S100A4過表達的HCC細胞的外泌體,結果得到了類似的結論,S100A4過表達外泌體***增強HCC細胞的遷移和侵襲,以及體內肺部轉移的能力(圖3e-f)。這些結果證實了外泌體S100A4具有增強HCC細胞轉移潛力的功能。

4、外泌體S100A4通過STAT3磷酸化***OPN轉錄

接下來探究了S100A4的作用機制,首先選擇了21個**干性相關基因,然后下載了GEO數據進行相關性分析,結果顯示S100A4主要和11個基因正相關(圖4a)。隨后檢測了不同HCC細胞系中敲除和過表達S100A4后11個基因的表達水平的改變,結果顯示只有OPN是S100A4的下游基因,其表達受到S100A4的調控(圖4b-f)。OPN是促進HCC轉移和干性的關鍵因子,但外泌體S100A4調節OPN的機制仍不清楚。 提供***科研設計咨詢及輔助實驗。凋亡課題實驗外包

一、上傳數據

可以上傳原始的fast文件,也可以上傳時序count表達文件。按照數據情況填寫以下6個問題,然后點擊“Run”開始進行質控

二、初級分析

數據質控合格后,進行初級分析,包括:差異表達量計算、基因簇分析。差異計算方法包括ImpulseDE2、NextmaSigPro、DESeq2,可以根據實際情況自由選擇。

三、次級分析

次級分析用于評估豐富度、因子結合和時間關系。我們可以選擇不同類型的分析來分析初級分析中獲得的基因簇,即Enrichment,用于識別基因簇中高表達的基因;FactorBinding,使用motif和CHIP-seq預測影響基因簇表達的轉錄因子;TemporalRelations,識別轉錄因子調控網絡(GRN)。 TBI課題分子生物學促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。

核型生物標志物

MarkerDB共有154個核型標記或核型圖,與47種不同的疾病/狀況相關。MarkerDB中的所有核型生物標記物數據都是從原始文獻中提取的,包括**學和血液學中的遺傳學和細胞遺傳學圖譜,以及人類不平衡染色體畸變目錄。目前,MarkerDB中的所有核型標記都有一個或多個疾病xiang關聯,以及MarkerDB ID、標記的獨特圖譜或核型圖(顯示與疾病核型相鄰的正常核型)、核型的簡短描述、疾病關聯、一個或多個相關基因的文獻參考和超鏈接。


作為一種典型的G蛋白偶聯受體, DRD2的內化誘導其受體β-arrestin2在質膜上的募集,并增加其與β-arrestin2的親和力。LPS和CM刺激了DRD2和β-arrestin2的蛋白-蛋白結合(圖5F-G)。同時,通過IF染色觀察到,經過LPS處理后,DRD2似乎在細胞質中與p-p65結合(圖5A), Co-IP和IB進一步證實了這種結合(圖5F)。據報道,β-arrestin2信號的***會破壞星形膠質細胞中TAK1-Tab1的結合,而這種結合對于TAK1的***至關重要。本研究還證實,內化的DRD2可以促進TAB1與β-arrestin2的結合,削弱TAB1與TAK1的結合(圖5H)。綜上所述,DRD2***的β-arrestin2通過競爭性地結合TAB1來拮抗TAK1的磷酸化。TIMEOR用于推斷基因調控事件之間的關系。

。CDKs的催化活性受細胞周期檢查點的調控,這些檢查點監測細胞周期中主要事件的有序執行。檢查點**了故障安全機制,它確保只有在滿足的比較好情況下才允許細胞分裂。所有生物體都需要通過細胞分裂周期進行適當的基因組維護,以確保正常生殖、發育和預防包括**在內的各種疾病。DNA損傷可由內源性過程引起,如DNA復制過程中偶爾引入的DNA不匹配,拓撲異構酶I和拓撲異構酶II活性失效導致的DNA鏈斷裂,或由正常代謝副產品產生的ROS攻擊DNA。外源性來源主要包括誘變化學品、紫外線和電離輻射(IR)。細胞周期檢查點能夠檢測DNA損傷,提示其存在,并***延緩細胞周期進程的通路,修復DNA損傷,或通過誘導細胞死亡來消除基因不穩定細胞。哺乳動物細胞DNA損傷反應(DDR)信號的**是共濟失調***擴張癥突變(ATM)和ATM-和rad3相關(ATR)蛋白激酶。ATM和ATR磷酸化并***另外兩個激酶CHK1和CHK2,CHK1和CHK2與ATM和ATR一起,是細胞周期檢查點[24]的主調節器。通過調節CDKs的活性,這些分子在細胞周期G1S期、S內期和G2M期減緩或阻止細胞周期進程,使DNA損傷得以修復。ATM和ATR通過控制不同因子在DNA損傷位點的表達、活性或招募來促進DNA修復高表達的外泌體CD44v6和C1QBP是預測PDAC患者預后和肝轉移的很有前途的生物標志物。CRO課題整包服務

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在野生型小鼠和Caspase-11缺陷小鼠中,MCD處理***降低了pro-caspase1的蛋白水平(圖5A和F),而增加了活性Caspase-1的蛋白水平(圖5A和G)。此外,Caspase-11缺陷小鼠的活性caspase-1水平明顯低于野生型小鼠,說明MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟中Caspase-1的***較少。同樣,我們在MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的肝細胞中檢測到較少的Gsdmd-N表達(圖5H和I)。這些結果表明,Caspase-11缺失減弱了MCD誘導的Gsdmd和IL-1β的***。

6.Caspase-11缺乏抑制脂多糖誘導的肝細胞焦亡和體外損傷

我們在體外評價Caspase-11缺乏對肝細胞焦亡的影響。我們用脂多糖(LPS)處理野生型小鼠原代肝細胞,發現LPS誘導了pro-caspase-11和caspase-11的表達(圖6A和B),表明LPS誘導了原代肝細胞中caspase-11的***。我們進一步處理來自野生型和Caspase-11缺陷小鼠的原代肝細胞,并監測Gsdmd的表達和***。如圖6C和D所示,LPS處理未在野生型和Caspase-11缺陷的原代肝細胞中誘導pro-Gsdmd的表達。 凋亡課題實驗外包

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