轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和,主要包括mRNA和非編碼RNA。轉錄組研究是基因功能及結構研究的基礎和出發點,通過新一代高通量測序,能夠***快速地獲得某一物種特定組織或***在某一狀態下的幾乎所有轉錄本序列信息,已曠泛應用于基礎研究、臨床診斷和藥物研發等領域。技術優勢：任意物種的全轉錄組分析:無需預先設計特異性探針,因此無需了解物種基因或基因組信息,能夠直接對任何物種進行*****的轉錄組分析。覆蓋度高:數字化信號,直接測定幾乎所有轉錄本片段的序列;。檢測閾值寬:跨越6個數量級的寬檢測閾值,從幾個到數十萬個拷貝精確計數;●分辨率高:可以檢測基因家族中相似基因及可變剪接造成的單堿基差異;。檢測范圍廣:從幾個到數十萬個拷貝精確計數，可同時鑒定及定量正常和稀有的轉錄本。降低了測序過程中的GC偏向性,提高了測序覆蓋度和均一性,測序數據更加準確、可靠。服務實驗服務實驗可參觀
lluminaHuman甲基化450K芯片服務每張芯片包含45萬個CpG位點,24846個基因來自于CCDS,2000多個**相關基因、400個miRNA基因啟動子區,300個甲基化熱點區。***覆蓋基因的啟動子區域、5°UTR.***-個exon.基因內部、3'UTR,***覆蓋CpGisland.CpGshores.CpGshelves;并且覆蓋了科學家們研究發現的一些其它重點區域,如:CpGisland以外的CpG位點在人類干細胞中觀察到的非CpG島甲基化位點多種**樣品與正常樣品以及不同組織之間有差異的甲基化位點miRNA啟動子區域以及GWAS項目發現的疾病相關區域位點、FANTOM4啟動子等。實驗流程:1基因組DNA;2.亞硫酸氫鹽轉化;3.VCA方式擴增、片股化;4.芯片雜交、洗脫、延伸、成像;5.數據分析.江西實驗服務推薦咨詢CpG甲基化焦磷酸測序檢測法通過將鏈合成過程中釋放出的焦磷酸(PPi)轉化成光信號來監測鏈的合成過程。
佩土物多性性位測環境微生物多樣性檢測,是以樣品中的微生物群落作為整體進行研究,通過對核糖體RNA高變區域(比如16S/18S/1TS等序列)或功能基因(如古菌的氨氧化基因等)進行PCR擴增和測序,然后分析相應環境下微生物群落的多樣性和分布規律。生物信息分析1.原始數據整理、過濾及質量評估2.OTU生成和注釋3.基于物種豐度分析:◆稀釋曲線◆豐度分布曲線+Alpha多樣性分析◆物種豐度差異分析4.基于群落結構分析:◆單樣品物種分布餅圖多樣品物種分布柱圖+含進化關系的物種豐度+Beta多樣性分析5.根據客戶需求進行個性化分析
circRNA是通過特殊的選擇性剪切產生封閉環狀結構的非編碼RNA。circRNA不受RNA外切酶的影響。比線性RNA表達更穩定。研究表明,某些特殊的circRNA分子富含miRNA結合位點,在細胞中起到miRNAsponges的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用。ciRS-7(CDR1a)包含63個保守的miR-7結合位點,該circRNA在細胞中能夠有效吸附miR-7。而miR-7作為關鍵調節因子***參與**途徑,如抑制在乳腺*、膠質瘤等**中表達***上調的Pak1的表達;miR-7也能通過結合a-synuclein抑制其表達。這些研究暗示ciRS-7通過ceRNA機制調節miR-7的功能,是神經系統疾病和*****的潛在靶點。宏基因組測序是對特定環境樣品中的微生物群體基因組,進行序列測定和功能基因的發掘。
piRNA的預測識別:通過高通量smallRNA測序數據預測piRNA;piRNA全基因組分布特征分析:解析piRNA在全基因組范圍內的具體定位和簇分布特征piRNA臨近序列特征提取:采用motif短序列模式比配算法識別piRNA臨近調控區域加工區域特征，5"U端和10nt位置權重矩陣分析等計算調控序列的非隨機性概率,預測其序列調控功能。全基因組TE轉座子元件預測與重新注釋:針對物種基因組內的轉座子序列,將轉座子識別為若干類別,包括longterminalrepeat(LTR),longinterspersednuclear(LINE),andinvertedrepeat(R)elements。并結合piRNA的生成來源進行座位的富集度分析和聚類;全基因組特征區域的覆蓋度分析:針對rRNA,tRNA,miRNA,codinggene,repeat,transposon,Su(Ste),AT-ChX等特殊基因組功能區域進行序列的覆蓋度分析;piRNA全基因組ORF與CDS注釋:結合piRNA定位進行功能基因的分布分析;piRNA表達量計算與piRNA簇表達相關性分析:計算樣本之間的piRNA表達量,計算樣本之間piRNA簇之間的表達相關系數。統計重復序列內piRNA表達量分布.基因區piRNA表達量分布。甲基化特異性的PCR是-種靈敏度高且操作相對簡單的甲基化研究方法。服務實驗服務實驗可參觀
英拜生物公司在多年miRNA表達譜芯片服務的基礎上,推出基于lluminaGAllx的smallRNA測序服務。服務實驗服務實驗可參觀
三、高分辨率熔解曲線(HRM)法高分辨率熔解曲線分析技術(HighResolutionMelting),簡稱HRM，是近年來興起的一種檢測基因突變、進行基因分型而及甲基化檢測的新方法。基本原理是基于核酸分子由于片段長短、GC含量、GC分布及單個堿基差異等物理性質不同而造成DNA分子在加熱變性時都會有不同的熔解曲線的形狀和位置,并配合運用高濃度的飽和熒光染料,可以迅速的檢測出核酸片段中GC含量和單堿基的突變。近年來,公司引進了RocheLightCycler@480I1和ABIVIIA7全自動熒光定量PCR系統，為客戶提供專業化個性化的甲基化HRM檢測服務。操作流程:.待測基因序列片段或位點甲基化引物設計(300p以內)。.利用甲基化轉移酶修飾的DNA和非甲基化修飾的DNA制備標準品(0%，1%，5%。10%,20%,50%,100%梯度HRM標準曲線)●亞硫酸氫鹽處理樣品DNA.上機檢測●數據處理,形成報告(包括實驗過程、試劑耗材、熒光PCR儀原始文件、測序文件等)。服務實驗服務實驗可參觀
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關研究
4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗