2.TYRO3使**細胞對抗PD-1***耐藥
在同系BALB/c小鼠模型中比較了Tyro3過表達(Tyro3-OE)和4T1-P細胞對抗mPD-1***的反應。在荷4T1-P**的小鼠中，抗mPD-1******減少**的生長，并延長了生存期。這些結果表明，盡管4T1-P**對抗mPD-1***有反應，Tyro3的過表達促進了這些**的耐藥性。為進一步確定在4T1-R耐藥細胞中抗PD-1/PD-L1耐藥是否需要TYRO3，敲除4T1-R細胞(TYRO3–/–)中的TYRO3。荷瘤Tyro3敲低細胞的小鼠對抗mPD-1***敏感，**生長***減少，小鼠存活時間更長。這些結果證明TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的重要作用。 在786-O細胞中穩定轉染靶向circSDHC的shRNA.海南標書省自然科學基金
根據文獻報道KDM6B是巨噬細胞的***的關鍵分子，因此，作者首先檢測了乳腺*細胞系MB-MDA-231對巨噬細胞系TPH-1中KDM6B表達的影響，結果表明乳腺*細胞及其條件培養基都可***下調KDM6B的表達，表明存在一種乳腺*細胞來源的分泌因子產生此種影響。因此，通過生物信息學預測了KDM6B結合的miRNA，以及結合文獻，通過在乳腺*中上調的，同時符合條件的有3個。隨后將乳腺*細胞和巨噬細胞共培養，檢測三個miRNA的表達，如圖1B所示，只有miR-138-5p和miR-146a的表達在共培養后***上調。進一步檢測發現，只有miR-138-5p處理后KDM6B的表達***下降而非miR-146a（圖1C-D）。生信分析預測了miR-138-5p和KDM6B的結合位點，并進行了熒光素酶實驗檢測，證實了兩者間存在結合關系。 炎癥因子標書細胞實驗FMT處理對脊髓損傷后小鼠腸道屏障通透性有影響。
2、miR-138-5p介導*細胞誘導的巨噬細胞KDM6B表達抑制
構建了miR-138-5p過表達的乳腺*細胞系，取其培養基與巨噬細胞共培養，結果巨噬細胞中miR-138-5p表達***上調，同時KDM6B的表達***下降。證實miR-138-5p介導*細胞誘導的巨噬細胞KDM6B表達抑制。
3、*細胞來源的外泌體miR-138-5p下調KDM6B的表達
隨后為了判定上述巨噬細胞中miR-138-5p表達上調的原因，檢測了巨噬細胞中原代(pri-)和前體(pre-)miR-138的水平。結果顯示共培養和對照組間原代和前體miR-138的水平沒有差異，表明miR-138-5p是外源供應的（圖1A）。此外，使用RNaseA處理miR-138-5p水平不變，使用TritonX-100其水平***下降。提示miR-138-5p被膜狀結構包裹（圖1B）。進一步分析表明使用外泌體抑制劑GW4869處理組和外泌體刪除組的培養基中miR-138-5p的表達***下降（圖1C）。表明外泌體來源于乳腺*細胞。類似的，外泌體抑制劑GW4869處理導致共培養的巨噬細胞中miR-138-5p的水平***下降，而KDM6B的水平***上升（圖1D-E）。
4.篩選關鍵模塊（hubmodule）并進行富集分析分析發現，棕色模塊與CD8+T細胞***相關（R2=-0.05，P=9e-05），因此選擇棕色模塊為hubmodule進行富集分析。
5.在hubmodule中篩選出關鍵基因（hubgene）并驗證為了研究與樞紐模塊中CD8+T細胞浸潤相關的潛在樞紐基因，構建了蛋白質-蛋白質相互作用（PPI）網絡[臨界標準：reliability>0.7andconnectivity>15(node/edge)]將hubmodule中的基因識別為中心節點，并通過Cytoscape對其進行可視化;對hubmodule中所有基因進行基于TCGA數據的預后分析，八個基因（CLCN2，ERLIN2，F5，FAM107B，GFM1，HSPB3，METTL8和SYT3）與LSCC患者的預后相關，接下來對這8個基因進行差異表達分析，六個基因（GFM1，HSPB3，SYT3，ERLIN2，METTL8和CLCN2）在LSCC組織中顯著差異表達。
我們構建了生物素標記的circSDHC探針.
通過半定量分析，胃*組織中MAPK1-109aa水平較正常胃組織中降低。Kaplan-Meier生存分析顯示，MAPK1-109aa表達水平較高的胃*患者總生存期明顯長于MAPK1-109aa表達水平較低的胃*患者(圖4h)。一系列GC細胞系中MAPK1-109aa的含量也明顯低于正常胃粘膜細胞系GES-1。在內源性circMAPK1水平較低且幾乎沒有MAPK1-109aa表達的MKN45細胞中，轉染circMAPK1和MAPK1-109aa質粒均產生預測的MAPK1-109aa帶，而過表達circMAPK1IRES突變質粒則沒有產生預測的MAPK1-109aa帶(圖4i)。相反，在內源性circMAPK1和MAPK1-109aa更高表達的GES-1細胞中，發現兩種特異性靶向circMAPK1連接的shRNA***降低了MAPK1-109aa的表達(圖4j)。使用anti-flag抗體進行免疫熒光檢測，證實MAPK1-109aa-Flag位于過表達MAPK1-109aa-Flag質粒的MKN45細胞的胞質中，如圖4k所示。研究腸道微生物組和宿主循環代謝產物之間的關系。糖尿病標書技術指導
研究了所有三組循環代謝產物豐度與腸道微生物群之間的聯系.海南標書省自然科學基金
IGF2BPs是circNDUFB2的下游功能性蛋白
IGF2BPs是致*蛋白，circNDUFB2可降低IGF2BPs的穩定性，推測IGF2BPs介導circNDUFB2對NSCLC進展的影響。IGF2BPs過表達***增加了A549細胞的遷移和侵襲能力以及集落形成能力。IGF2BPs敲除***降低H1650細胞的遷移和侵襲能力以及集落形成能力。這些結果證實IGF2BPs是NSCLC的促瘤因子。隨后，觀察到IGF2BPs過度表達*部分恢復了circNDUFB2過度表達減少的遷移和侵襲能力以及集落形成能力，表明circNDUFB2部分通過降解IGF2BPs發揮**抑制作用。盡管circNDUFB2 MUT不影響IGF2BPs的蛋白質水平但它仍然對NSCLC細胞的進展具有抑制作用。這些數據表明circNDUFB2 MUT的抑制作用除了降解IGF2BPs外，還可能與circNDUFB2的其他機制有關。 海南標書省自然科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗