由于p65轉(zhuǎn)位到細(xì)胞核并促進(jìn)其靶向基因的轉(zhuǎn)錄，假設(shè)NFκB/p65信號通路的***可通過p65的轉(zhuǎn)錄活性上調(diào)miR-934表達(dá)。在p65和miR-934啟動子之間發(fā)現(xiàn)了5個(gè)潛在的轉(zhuǎn)錄結(jié)合區(qū)域和2個(gè)特異性結(jié)合位點(diǎn)（Fig. 8d）。隨后，用miR-934啟動子中含有p65結(jié)合區(qū)域的載體轉(zhuǎn)染SW480和RKO細(xì)胞；ChIP實(shí)驗(yàn)證明p65對miR-934的轉(zhuǎn)錄在-2002和-1500 bp（區(qū)域1）之間的區(qū)域內(nèi)***增高，在其他四個(gè)結(jié)合區(qū)域中未觀察到明顯變化（Fig. 8e）。這些數(shù)據(jù)表明，區(qū)域1可能在調(diào)節(jié)CRC細(xì)胞中p65介導(dǎo)的miR-934轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)中起關(guān)鍵作用。熒光素酶報(bào)告基因檢測證實(shí)p65對SW480和RKO細(xì)胞中miR-934啟動子的轉(zhuǎn)錄影響（Fig. 8f）。作者發(fā)現(xiàn)只有突變結(jié)合位點(diǎn)1可以下調(diào)p65的熒光素酶報(bào)告基因活性，抑制miR-934的轉(zhuǎn)錄表達(dá)，這證明p65可以通過結(jié)合位點(diǎn)1正向直接調(diào)節(jié)miR-934的表達(dá)(Fig. 8f)。此外，作者證明了SW480和RKO細(xì)胞中的突變結(jié)合位點(diǎn)1可以消除CXCL13的促進(jìn)作用和NFκB/p65信號對miR-934表達(dá)的抑制作用(Fig. 8g,h)。綜上所述，這些結(jié)果證明CXCL13/CXCR5/NFκB/p65信號通路促進(jìn)CRC細(xì)胞中miR-934的轉(zhuǎn)錄，形成一個(gè)正反饋回路，參與持續(xù)的M2巨噬細(xì)胞極化和CRC細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。NSCLC中circNDUFB2下調(diào).寧夏標(biāo)書動物模型構(gòu)建
2）SsD響應(yīng)相關(guān)基因和通路的鑒定
為了進(jìn)一步確定可能與白血病細(xì)胞中SsD敏感性相關(guān)的潛在靶點(diǎn)，我們對SsD處理過的NB4細(xì)胞進(jìn)行了RNA測序。我們共發(fā)現(xiàn)3732個(gè)上調(diào)基因和3442個(gè)下調(diào)基因(圖2A)。為了揭示SsD的潛在機(jī)制，我們進(jìn)行了富集分析并研究了差異基因相關(guān)的通路。我們篩選了上調(diào)和下調(diào)基因富集的**個(gè)通路(圖2B)。此外，我們使用GSEA研究SsD處理影響的信號通路(圖2C)。我們的數(shù)據(jù)顯示，SsD處理導(dǎo)致MYC靶點(diǎn)、E2F靶點(diǎn)和G2M檢查點(diǎn)信號級聯(lián)受到抑制。有趣的是，這些發(fā)現(xiàn)與FTO抑制劑和內(nèi)源性FTO的下調(diào)抑制的信號通路相一致。因此，SsD的抑制作用可能有助于FTO抑制細(xì)胞周期和增殖(圖2D-E)。此外，絕大多數(shù)通過FTO敲低而上調(diào)的信號通路對SsD富集，同樣，絕大多數(shù)被SsD抑制的信號通路也被FTO敲低而抑制(圖2F)。更重要的是，SsD介導(dǎo)的m6A相關(guān)基因的變化具有***的一致性(圖2G)。綜上所述，SsD可能參與了FTO介導(dǎo)的m6ARNA甲基化途徑。 海南標(biāo)書地區(qū)科學(xué)基金FMT處理可能導(dǎo)致SCI后胃腸道消化活力變快。
Il4ra缺陷小鼠的M2樣巨噬細(xì)胞減少和再生失調(diào)
為了探索再生過程中胰腺巨噬細(xì)胞的調(diào)節(jié)機(jī)制，我們進(jìn)行了基因集富集分析(GSEA)以比較第3天和第1天巨噬細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組譜。巨噬細(xì)胞的M2***和IL4刺激特征從第3天開始富含巨噬細(xì)胞。我們發(fā)現(xiàn)，表達(dá)IL-4和IL-13分別提高在第1天，和表達(dá)Il4ra自第1天升高，達(dá)到峰值在第3天。為了進(jìn)一步確定受體和配體的細(xì)胞來源，在AP損傷后***從胰腺中分離并比較了CD45.2+和CD45.2-細(xì)胞，有趣的是，Il4ra1被顯性免疫細(xì)胞上表達(dá)（CD45.2+），而IL4和IL13中主要表達(dá)于實(shí)質(zhì)細(xì)胞（CD45.2-）。此外，通過使用Il4ra缺陷小鼠，我們證明了IL4Rα信號在AP損傷后胰腺修復(fù)/再生過程中介導(dǎo)了M2巨噬細(xì)胞的極化。值得注意的是，與它們的對應(yīng)物相比，來自Il4ra-/-小鼠的胰腺在第3天和第5天具有更多的ADM結(jié)構(gòu)。總的來說，這些發(fā)現(xiàn)表明IL4/IL4Rα軸是AP恢復(fù)過程中胰腺巨噬細(xì)胞M2極化所必需的，發(fā)揮***功能來控制ADM形成的程度。
意味著先前接受過CAR-T細(xì)胞***的小鼠的**控制***增強(qiáng)(Fig.5H-I)。值得注意的是，第30天的**大小與**侵襲前血液中CD3+T細(xì)胞的數(shù)量呈***負(fù)相關(guān)(Fig.5J)，表明CDK4/6i處理的CAR-T細(xì)胞的持久性增強(qiáng)是驅(qū)動**控制的關(guān)鍵因素。事實(shí)上，**接種后40天，接受預(yù)處理的CAR-T細(xì)胞的小鼠浸潤C(jī)D4+和CD8+CAR-T細(xì)胞的數(shù)量***增加(Fig.5K)。接下來通過將未處理或預(yù)處理的抗LeYCAR-T細(xì)胞轉(zhuǎn)移到OVCAR-3荷瘤小鼠體內(nèi)，檢測了CDK4/6i預(yù)處理對CAR-T細(xì)胞急性療效的影響。用CDK4/6i預(yù)處理CAR-T細(xì)胞可***增強(qiáng)其抗**活性（Fig.5L-M)。與此一致，轉(zhuǎn)移后數(shù)周發(fā)現(xiàn)接受預(yù)處理細(xì)胞的小鼠血液中CD4+和CD8+細(xì)胞以及**中CD8+細(xì)胞數(shù)量***增高（Fig.5N-O)。總之，這些數(shù)據(jù)證明CDK4/6i體外***是增強(qiáng)CAR-T細(xì)胞表型和長期療效的穩(wěn)健策略。circNDUFB2可能在NSCLC的進(jìn)展中起***作用。
在TYRO3-OE 4T1**細(xì)胞中，阻斷鐵死亡的基因上調(diào)（Slc40a1、Slc7a11、Slc3a2、Gpx4、Fth1和Blvrb），而增強(qiáng)鐵死亡的基因下調(diào)（Slc5a1、Tfrc）。在接受抗PD-1***的黑色素瘤患者中，阻止脂質(zhì)過氧化和鐵死亡的分子SLC3A2與TYRO3***共表達(dá)。抗PD-1***后，Tyro3-OE CD45-**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS水平低于4T1-P CD45-**細(xì)胞，而加入抗PD-1***增加4T1-P**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS，但不增加Tyro3-OE**細(xì)胞的脂質(zhì)ROS，表明Tyro3抑制抗PD-1誘導(dǎo)的**細(xì)胞鐵死亡。在體外用鐵死亡誘導(dǎo)劑erastin和鐵死亡抑制劑ferrostatin 1(Fer-1)處理4T1-P和Tyro3-OE 4T1細(xì)胞。與親代細(xì)胞相比，Tyro3過表達(dá)抑制了鐵死亡誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡。當(dāng)Fer-1阻斷鐵死亡時(shí)，Tyro3過表達(dá)抑制誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)的脂質(zhì)ROS。Tyro3缺失增加了誘導(dǎo)劑誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡和脂質(zhì)過氧化，F(xiàn)er-1消除了這些作用。這些結(jié)果表明TYRO3對于保護(hù)**細(xì)胞免受鐵死亡至關(guān)重要。FMT可能通過***IL-1β/ NF-κB信號通路來緩解神經(jīng)炎癥。陜西標(biāo)書歡迎咨詢
與未接受FMT***的受傷小鼠相比接受FMT***的小鼠表現(xiàn)出相對更大的運(yùn)動恢復(fù)。寧夏標(biāo)書動物模型構(gòu)建
2.Lnc-PMIF抑制OPCs遷移到骨形成表面
在成骨細(xì)胞分化過程中，lnc-PMIF在早期增加，在礦化啟動后減少，表明lnc-PMIF可能在成骨分化的早期階段發(fā)揮作用。過表達(dá)/敲低lnc-PMIF不影響OPCs的增殖和成骨分化。敲低lnc-PMIF的細(xì)胞遷移減弱，敲低組細(xì)胞處理的小鼠脛骨中Dil標(biāo)記細(xì)胞數(shù)量升高，小鼠中l(wèi)nc-PMIF表達(dá)更高。這些表明lnc-PMIF可抑制OPCs向骨形成表面的遷移，而不干擾其增殖和成骨潛能。
3.Lnc-PMIF與HuR相互作用抑制β-actin的表達(dá)以抑制OPC遷移
為探索Lnc-PMIF介導(dǎo)的OPC遷移的調(diào)節(jié)機(jī)制。RNApulldown-MS實(shí)驗(yàn)尋找lnc-PMIF的相互作用蛋白，鑒定出一種RNA結(jié)合蛋白HuR，WB證實(shí)HuR在生物素標(biāo)記的lnc-PMIF細(xì)胞裂解的下拉組分中富集，RNA免疫沉淀(RIP)試驗(yàn)lnc-PMIF與HuR的結(jié)合。 寧夏標(biāo)書動物模型構(gòu)建
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)