2、白樺素下調SREBP靶基因,降低細胞脂質水平
由于SREBP-2是其自身的直接靶標,因此白樺素將其表達下調40%(圖3A)。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉錄因子這一觀點一致,膽固醇合成途徑中的10個被測基因,例如HMGCR,HMG-CoA合酶(HMGCS)和角鯊烯環氧酶(SE),都被白樺素處理抑制了(圖3A)。類似地,與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關的所有9個基因,例如SREBP-1c,脂肪酸合酶(FAS)和乙酰輔酶A羧化酶α(ACC),都被白樺素顯著下調(圖3B)。與早期觀察結果一致(圖1A),包括ABCG5和ABCG8在內的LXR靶基因不受白樺素的影響(圖3C)。 Pex調節HSC的ECM分泌。山西課題服務兩年
1)DRD2通過啟動子甲基化在轉錄上下調
為了研究新的潛在TSGs,采用BrCa組織和正常組織進行RNA-seq篩選。與正常乳腺組織相比,BrCa組織中DRD2mRNA表達明顯下調(圖1A)。免疫組化染色發現,與BrCa組織相比,正常乳腺組織中DRD2蛋白水平也較高(圖1B)。同樣,基于TCGA,在BrCa中也觀察到DRD2mRNA的下調,并且在BrCa中DRD2啟動子甲基化也更頻繁(圖1C)。根據Kmplot,DRD2的高表達促進了BrCa患者的更長的生存期,這也在HER2陽性基因型患者中可見。但這一優勢在LuminalA患者中未見(圖1D)。根據RT-PCR和MSP結果,幾乎所有的BrCa細胞系與永凍的正常乳腺細胞系相比,都可以看到DRD2mRNA表達下調或缺失以及啟動子甲基化(圖1E)。因此,DRD2的高甲基化頻率可能有助于其下調BrCa。Aza藥物去甲基化恢復了兩種沉默的BrCa細胞系MDA-MB231和BT549中DRD2的表達(圖1F)。 單細胞相關課題課題創新服務有肝轉移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉移的PDAC患者。
CircACTN4促進體內異種移植**的發生和轉移
為了評估circACTN4在體內的致*作用,通過皮下注射和尾靜脈注射在裸鼠中建立人BC細胞**模型。用過表達 circACTN4 慢病毒或 circACTN4 shRNA 慢病毒及其對照***的 MCF-7 細胞接種雌性裸鼠。結果表明,circACTN4過表達組異種移植**的體積和重量明顯大于對照組,而circACTN4敲低顯著抑制了**生長。與對照組相比,circACTN4的上調明顯增加了轉移性肺結節的數量,而circACTN4沉默顯著抑制了自發性肺轉移,侵襲性**細胞較少。此外,circACTN4 的過表達可以顯著促進**血管生成,而 circACTN4 敲低顯著降低**微血管密度。WB結果顯示,與對照組相比,過表達或沉默circACTN4組的異種移植**組織中MYC的蛋白質水平分別顯著增加或減少。
接下來,評估circACTN4的表達與臨床病理特征的關聯。circACTN4的表達與年齡(P ?= 0.036)、T(P ?= 0.001)、N(P ?= 0.001)和TNM分期(P < 0.001)呈正相關,但與分級無關。利用ISH檢測包含240個 BC組織的組織芯片確定circACTN4的表達。Kaplan-Meier生存分析顯示,circACTN4高表達患者的總生存期比circACTN4低表達患者的總生存期短。circACTN4的表達與T分期、N分期和TNM分期呈正相關。Cox 比例風險模型評估 circACTN4 的預后價值。結果顯示circACTN4的過表達是BC患者預后不良的**預測因子(HR = 4.566,P <0.001)。circACTN4 可以發揮致*作用,circACTN4 的高表達可以預測 BC 患者的不良預后。英拜生物對整體實驗實施的全局把控。
PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩定性有關。此外,小鼠胚胎成纖維細胞(mef)中PTEN基因的缺失導致了未修復的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認為通過至少兩種分子機制促進了基因組的完整性。在細胞核中,PTEN與著絲粒結合蛋白CENP-C結合,促進著絲粒組裝和中期到后期的轉變。此外,作為轉錄因子E2F1的輔助因子,核PTEN似乎調節Rad51的表達,Rad51是DNA修復機制的關鍵組成部分。然而,后續的研究得出了不一致的結果,表明PTEN在轉錄水平上對RAD51的調控可能***于特定的細胞環境。
PTEN缺陷改變了多個細胞周期檢查點,可能留下更少的時間進行DNA損傷修復和/或染色體分離。細胞周期的進展需要幾個分子過程的完美執行,以確保一個熟練的,無錯誤的,細胞分裂。這些事件發生的速度由周期蛋白依賴激酶(CDKs)的活性決定,CDKs磷酸化關鍵底物以促進DNA合成和有絲分裂進程。CDKs的催化活性受細胞周期檢查點的調控,這些檢查點監測細胞周期中主要事件的有序執行。檢查點**了故障安全機制,它確保只有在滿足的比較好情況下才允許細胞分裂。 生命科學領域內的精細研究。黑龍江課題歡迎咨詢
TIMEOR是***個基于 Web 的自適應時間序列多組學管道方法。山西課題服務兩年
胰管腺*(PDAC)有明顯的肝轉移傾向。促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。2021年4月發表于Gut(IF=19.819)的文章“Exosome-delivered CD44v6/C1QBP complex drives pancreatic cancer liver metastasis by promoting fibrotic liver microenvironment”對此進行了探究。本研究旨在探討PDAC來源的外泌體(Pex)調控肝臟微環境、促進轉移的潛在機制。Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物對于肝纖維化微環境和PDAC肝轉移的形成是必不可少的。高表達的外泌體CD44v6和C1QBP是預測PDAC患者預后和肝轉移的很有前途的生物標志物山西課題服務兩年
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗