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METTL3降低APC表達(dá)，促進(jìn)β-catenin介導(dǎo)的下游基因表達(dá)、有氧糖酵解、ESCC細(xì)胞增殖和**發(fā)展

APC功能的喪失使β-連環(huán)蛋白穩(wěn)定，從而誘導(dǎo)下游基因（CCND1和MYC）的表達(dá)。CCND1促進(jìn)細(xì)胞周期，c-Myc增強(qiáng)有氧糖酵解。正如預(yù)期的那樣，METTL3缺失增強(qiáng)了KYSE180細(xì)胞中APC的表達(dá)，降低了β-連環(huán)蛋白、細(xì)胞CCND1、c-Myc和PKM2的表達(dá)。此外，METTL3缺失降低了葡萄糖攝取、乳酸產(chǎn)生、細(xì)胞增殖和細(xì)胞集落數(shù)。值得注意的是，這種METTL3缺失引起基因表達(dá)（圖6a）、糖酵解（圖6b，c）、細(xì)胞增殖（補(bǔ)充圖6f）和集落形成的抑制在很大程度上被這些細(xì)胞中的APC缺失所消除。相反，METTL3過度表達(dá)引起葡萄糖消耗和乳酸產(chǎn)生的增加，這被YTHDF2消耗所消除。這些結(jié)果表明METTL3降低APC表達(dá)，促進(jìn)β-catenin介導(dǎo)的下游基因表達(dá)、有氧糖酵解和ESCC細(xì)胞增殖。

為了確定METTL3誘導(dǎo)的APC表達(dá)下調(diào)在小鼠**生長中的作用，將KYSE180細(xì)胞皮下注射到裸鼠體內(nèi)。發(fā)現(xiàn)通過APC去除，METTL3去除使**大小、體積和重量減小，并且**組織中的乳酸量恢復(fù)。IHC染色顯示，METTL3缺失增加AP的表達(dá)，相應(yīng)地減少了**組織中β-連環(huán)蛋白、cyclind1、c-Myc和PKM2的表達(dá)。這些結(jié)果表明METTL3抑制APC的表達(dá)可以促進(jìn)**的發(fā)展。 了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。北京課題一站式

CircACTN4促進(jìn)體內(nèi)異種移植**的發(fā)生和轉(zhuǎn)移

為了評估circACTN4在體內(nèi)的致*作用，通過皮下注射和尾靜脈注射在裸鼠中建立人BC細(xì)胞**模型。用過表達(dá) circACTN4 慢病毒或 circACTN4 shRNA 慢病毒及其對照***的 MCF-7 細(xì)胞接種雌性裸鼠。結(jié)果表明，circACTN4過表達(dá)組異種移植**的體積和重量明顯大于對照組，而circACTN4敲低顯著抑制了**生長。與對照組相比，circACTN4的上調(diào)明顯增加了轉(zhuǎn)移性肺結(jié)節(jié)的數(shù)量，而circACTN4沉默顯著抑制了自發(fā)性肺轉(zhuǎn)移，侵襲性**細(xì)胞較少。此外，circACTN4 的過表達(dá)可以顯著促進(jìn)**血管生成，而 circACTN4 敲低顯著降低**微血管密度。WB結(jié)果顯示，與對照組相比，過表達(dá)或沉默circACTN4組的異種移植**組織中MYC的蛋白質(zhì)水平分別顯著增加或減少。 WNT課題設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)zVAD預(yù)處理也略微增加了IR后PTEN-398A細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量。

通過半定量分析，胃*組織中MAPK1-109aa水平較正常胃組織中降低。Kaplan-Meier生存分析顯示，MAPK1-109aa表達(dá)水平較高的胃*患者總生存期明顯長于MAPK1-109aa表達(dá)水平較低的胃*患者(圖4h)。一系列GC細(xì)胞系中MAPK1-109aa的含量也明顯低于正常胃粘膜細(xì)胞系GES-1。在內(nèi)源性circMAPK1水平較低且?guī)缀鯖]有MAPK1-109aa表達(dá)的MKN45細(xì)胞中，轉(zhuǎn)染circMAPK1和MAPK1-109aa質(zhì)粒均產(chǎn)生預(yù)測的MAPK1-109aa帶，而過表達(dá)circMAPK1IRES突變質(zhì)粒則沒有產(chǎn)生預(yù)測的MAPK1-109aa帶(圖4i)。相反，在內(nèi)源性circMAPK1和MAPK1-109aa更高表達(dá)的GES-1細(xì)胞中，發(fā)現(xiàn)兩種特異性靶向circMAPK1連接的shRNA***降低了MAPK1-109aa的表達(dá)(圖4j)。使用anti-flag抗體進(jìn)行免疫熒光檢測，證實(shí)MAPK1-109aa-Flag位于過表達(dá)MAPK1-109aa-Flag質(zhì)粒的MKN45細(xì)胞的胞質(zhì)中，如圖4k所示。

5）上調(diào)UCP1緩解AKI期間的脂質(zhì)積累，***抑制疾病進(jìn)展

為了在體內(nèi)驗(yàn)證脂質(zhì)對AKI功能的影響，我們通過在腎臟多點(diǎn)注射過表達(dá)UCP1腺病毒，構(gòu)建過表達(dá)UCP1動(dòng)物模型，以消除脂質(zhì)在AKI中的堆積。在UCP1過表達(dá)動(dòng)物模型中，腎損傷指標(biāo)NGAL明顯降低(圖5A)。HE和PAS染色顯示腎臟形態(tài)有很大改善，腎小管損傷評分顯示，在UCP1介導(dǎo)的脂質(zhì)消耗增加后，腎小管損傷程度明顯降低(圖5B-C)。順鉑刺激后腎小管呈空泡變性，細(xì)胞扁平，管腔擴(kuò)張，而UCP1過表達(dá)明顯改善了病理改變。血清肌酐(SCr)和尿素氮(BUN)這兩項(xiàng)腎臟損傷指標(biāo)也出現(xiàn)了類似的***下降(圖5D-E)。利用UCP1激動(dòng)劑CL316243在AKI動(dòng)物模型中緩解脂堆積，進(jìn)一步驗(yàn)證了上述結(jié)果。***后NGAL***降低(圖5F)，腎臟形態(tài)、腎小管損傷評分、SCr、BUN均***改善(圖5G-J)。因此，在體內(nèi)，上調(diào)UCP1以緩解AKI脂質(zhì)積累可以抑制AKI進(jìn)展。 高通量測序后續(xù)的機(jī)制實(shí)驗(yàn)。

我們接下來試圖識別circPDE4B上游調(diào)節(jié)器。我們首先對circPDE4B側(cè)翼序列進(jìn)行RNA pull-down-MS檢測，發(fā)現(xiàn)兩個(gè)與RNA剪接相關(guān)的RBP，包括DExH-box helicase 9和FUS(圖1G)。RT-qPCR結(jié)果顯示，F(xiàn)US敲除后，HCs中circPDE4B表達(dá)下調(diào)，而pPDE4B和mPDE4B沒有明顯變化(圖1H)。此外，***兩種FUS shRNA慢病毒只降低了circPDE4B的表達(dá)(圖1I)，而過表達(dá)FUS則上調(diào)了circPDE4B的表達(dá)(圖1I)。接下來，RIP分析顯示FUS與外顯子相鄰的位點(diǎn)結(jié)合，而其他遠(yuǎn)端位點(diǎn)則可以忽略(圖1J，K)。我們還尋找了可能的FUS響應(yīng)元素，發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)可能的motifs，A位于上游，B位于下游。我們進(jìn)一步設(shè)計(jì)了兩個(gè)短的circPDE4B微基因，包括circPDE4B-s和circPDE4B-s-del(圖1L)。RIP顯示FUS與circPDE4B-s之間存在明顯的相互作用，但與circPDE4B-s-del之間沒有相互作用(圖1M)，表明FUS需要周圍內(nèi)含子中的假定位點(diǎn)來結(jié)合。我們接下來在表達(dá)circPDE4B-s/del的HCs中敲除FUS，發(fā)現(xiàn)與circPDE4B-del相比，circPDE4B-s***減少了FUS敲除的circPDE4B轉(zhuǎn)錄本(圖1N)。值得注意的是，在HCs中FUS被TNF-α下調(diào)(圖1O)。綜上所述，在OA中circPDE4B的下調(diào)至少部分是由FUS的抑制引起的。提供***科研設(shè)計(jì)咨詢及輔助實(shí)驗(yàn)。免疫熒光課題設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)

英拜生物對整體實(shí)驗(yàn)實(shí)施的全局把控。北京課題一站式

LncExpDB提供101293個(gè)人類lncRNA基因（對應(yīng)于331244個(gè)轉(zhuǎn)錄本）***且高質(zhì)量的**。它包含了這些lncRNA在337個(gè)生物學(xué)條件下的豐富表達(dá)譜，這些條件屬于九個(gè)重要的生物學(xué)背景，涉及正常組織/細(xì)胞系、*細(xì)胞系、亞細(xì)胞定位、外泌體、細(xì)胞分化、植入前胚胎、***發(fā)育、晝夜節(jié)律和病毒***.此外，LncExpDB識別了25191個(gè)特征lncRNA基因，并表征了24508個(gè)lncRNA基因和17345個(gè)mRNA基因之間的28443865個(gè)共表達(dá)相互作用。

基于跨多個(gè)生物環(huán)境的綜合表達(dá)譜，LncExpDB具有增值管理和分析功能，可提供可靠轉(zhuǎn)錄的lncRNA基因。因此，我們發(fā)現(xiàn)92016個(gè)lncRNA基因（90.8%）得到可靠轉(zhuǎn)錄證據(jù)的支持（表達(dá)值閾值為1TPM），在九個(gè)生物學(xué)背景中分布不均。在可靠轉(zhuǎn)錄的基因中，大多數(shù)(82.6%)在至少兩種生物環(huán)境中表達(dá)，3318個(gè)lncRNAs(3.6%)在所有9種環(huán)境中表達(dá)。 北京課題一站式

公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。

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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)