2021年，來自加拿大多倫多大學和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學等團隊合作在Nature communication雜志上發表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質性。基于rna-seq的基因表達譜分析，確定了兩種新亞型，稱為原始型和committed型。基于基因表達、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異，在**的AML隊列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態和患者生存聯系起來。此外，表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。可以上傳原始的fast文件。CRO課題第三方實驗室
這些研究導致了大量的流動敏感基因和microrna的發現，這些基因和microrna在內皮生物學和***中的作用已經被詳細描述和研究。我們還能夠從lca和rca中獲得大量DNA樣本，并通過減少代表性亞硫酸氫鹽測序(RRBS)方法進行分析。本研究表明，d-flow和s-flow差異調控ECs的表觀基因組DNA甲基化譜，鑒定了許多受流量調控的基因位點。
雖然這些使用大量RNA和DNA樣本的轉錄組和表觀基因組甲基組研究清楚地確定了d-流和s-流對體內ECs的差異影響，但這些研究的解釋有一些局限性。雖然我們的大塊RNA和DNA制劑中富含來自腔內沖洗的ec，但不可避免的是它們包含了一些存在于內膜中的其他細胞類型，尤其是PCL手術后的lca。例如，我們觀察到早在PCL后12小時，LCA樣本中與免疫細胞和間充質細胞相關的許多基因的表達增加;然而，我們不能確定這些改變是由于非內皮細胞浸潤內膜所致，還是由于內皮細胞的d-流所致。 鐵死亡課題分子生物學表達PTEN- 398A的細胞中上調的基因與G1/S檢查點的***有關。
目前，CTD中超過247000種化學-表型相互作用使用了870個解剖學術語。 用戶可以通過選擇門戶圖標向下鉆取可導航層次結構或使用 CTD 關鍵字搜索框中的“解剖”選擇列表選項，從主頁訪問 CTD Anatomy。CTD Anatomy 頁面組織和合并數據，允許用戶從解剖學角度探索交互；這可用于識別不同生理系統（例如腎臟、肝臟、大腦和心血管系統）獨有或共享的化學物質和表型，或發現例如影響影響的 1158 種化學物質 心臟中有 600 種表型。同樣，已經開始將 CTD 暴露與 CTD 解剖學相結合，使環境健康科學家能夠調查暴露研究和組織和系統暴露化學應激誘導表型的細節。***，為了幫助提高數據庫的互操作性。
六、原始亞型預示著對激酶抑制劑的敏感性增加
生成各化合物的藥物劑量響應曲線，并比較各亞型間曲線下面積(areaunderthecurve,AUCd)(單個藥物劑量響應曲線見圖6、)。體外藥物篩選顯示，原始聚類患者樣本對索拉非尼、舒尼替尼和魯索利替尼的敏感性高于合并亞型(Wilcoxon秩和檢驗p-value分別=2E5、0.02和0.01;在UHN患者樣本中，Quizartinib的亞型間差異反應較弱，而伊馬替尼和達沙替尼的亞型間無差異(補充圖27)。使用BeatAML33數據集，驗證原始和committed亞型對激酶抑制劑的反應之間的聯系，該數據集包含npm1突變AML患者樣本的體外藥物篩選。我們觀察到UHN和BeatAML數據集之間的良好一致性，原始聚類中的樣本對Sorafenib和Sunitinib表現出更高的敏感性(圖6)。有趣的是，Quizartinib在UHN隊列中有微弱的差異反應，但在BeatAML隊列中卻有統計學意義的差異。 高通量測序后續的機制實驗。
放線菌素D處理后的 qRT-PCR 和 RT-PCR 分析表明，circACTN4 在指定的時間點具有抗性。隨后，生物信息學預測上游轉錄因子2(USF2)可能與ACTN4的啟動子結合。因此，構建了攜帶全長野生型和突變型ACTN4啟動子的熒光素酶報告基因載體，結果表明USF2增強了熒光素酶野生型熒光素酶報告基因的活性。Chip-qPCR檢測進一步證明USF2可以與ACTN4基因啟動子結合并增強其轉錄活性。設計并構建了USF2過表達和敲低質粒，通過qRT-PCR檢測到轉染相應質粒的BC細胞中ACTN4的表達。結果表明，上調的 USF2 顯著增加了線性ACTN4和circACTN4的表達，而下調的USF2顯著降低了線性ACTN4和circACTN4的水平。這些結果表明ACTN4是轉錄因子USF2的靶基因。
促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。M6a甲基化課題產學研合作
課題CRO服務找上海英拜。CRO課題第三方實驗室
推測表達PTEN-398A的細胞對基因毒性脅迫的抗性可能是由于未能阻止細胞周期以應對DNA損傷。為了測試這種可能性，測量了表達野生型或突變PTEN的同步細胞在細胞周期阻滯在G1/S檢查點的能力，以應對DNA損傷。在表達PTEN-WT或PTEN-398A的正常周期細胞中，G1、S、G2/M期細胞比例沒有明顯差異(圖4A)。為了使細胞在G1/S檢查點同步，我們對它們施加雙胸腺嘧啶脈沖。這種處理有效地***了PTEN-WT和PTEN-398A細胞在G1/S邊界(圖4B)。然后在正常生長培養基中釋放細胞，在S期進展期間用IR處理，6小時后收集細胞，用流式細胞術分析細胞周期分布(實驗方案見補充圖7A)。大部分PTEN-WT細胞被阻滯在s期，而PTEN-398A細胞未能阻滯細胞周期，而是發展到G2/M期(圖4C)。通過測定表達磷酸化組蛋白H3(Ser10)的細胞比例，證實了這一觀察結果。磷酸化組蛋白H3。 CRO課題第三方實驗室
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關研究
4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗