**近有報(bào)道稱，ALS/FTD中TDP-43的聚集可以隔離核孔蛋白、轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白和其他因子，表明TDP-43的聚集強(qiáng)烈破壞核質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)(NCT)和核孔復(fù)合體。此外，在AD、ALS和亨廷頓氏病(HD)中NCT也被破壞，提示在這些神經(jīng)退行性疾病中有一個(gè)共同的功能失調(diào)途徑。然而，TDP-43在反復(fù)顱腦損傷致神經(jīng)退行性變中的病理機(jī)制尚不清楚。此報(bào)道之前曾證明，重復(fù)的創(chuàng)傷導(dǎo)致果蠅大腦中的泛素、p62和TDP-43包涵體以及應(yīng)激顆粒病理。在這里，我們對(duì)果蠅的大腦進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析，以確定創(chuàng)傷損傷后改變的分子通路。生命科學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的精細(xì)研究。結(jié)腸炎課題實(shí)驗(yàn)外包
RIG-I對(duì)circNDUFB2誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)至關(guān)重要
RIG-I樣受體（RLR）家族可識(shí)別病毒RNA 會(huì)通過產(chǎn)生IFN和促炎性細(xì)胞因子來(lái)觸發(fā)針對(duì)病毒***的先天免疫反應(yīng)。已經(jīng)報(bào)道外源circRNA有效刺激由RIG-1介導(dǎo)的免疫信號(hào)傳導(dǎo)。從qRT-PCR分析獲得的數(shù)據(jù)表明，RIG-1敲低消除了circNDUFB2過表達(dá)誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)，RIG-1被circNDUFB2上調(diào)。為了研究circNDUFB2和RIG-I之間的關(guān)聯(lián)，進(jìn)行RIP分析和RNA FISH免疫熒光實(shí)驗(yàn)。 結(jié)果表明circNDUFB2與RIG-1結(jié)合，并且它們共定位在細(xì)胞質(zhì)中。 circNDUFB2過表達(dá)后， circNDUFB2顯著上調(diào)了RIG-1，IRF7，IFNβ和TNF的蛋白水平，而circNDUFB2則不影響P65和IRF3的蛋白水平。 免疫組化課題第三方實(shí)驗(yàn)室小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細(xì)胞分離的外泌體呈現(xiàn)典型的外泌體結(jié)構(gòu)。
6）SsD抑制患者原代細(xì)胞
我們從吉林大學(xué)***醫(yī)院**組織/生物標(biāo)本庫(kù)獲取AML患者外周血，進(jìn)一步評(píng)估SsD對(duì)白血病進(jìn)展的影響。SsD***抑制了白血病細(xì)胞增殖(圖6A)、集落形成能力(圖6B)、誘導(dǎo)細(xì)胞周期阻滯(圖6C)。在機(jī)制上，這是由FTO介導(dǎo)的m6ARNA甲基化及其在SsD處理的原代細(xì)胞中的靶點(diǎn)調(diào)控的(圖6D-G)。當(dāng)我們使用“人-鼠”異種移植白血病模型來(lái)評(píng)估SsD在體內(nèi)對(duì)白血病進(jìn)展的影響時(shí)(圖6H)，與上述類似，使用SsD******抑制AML進(jìn)展，包括降低WBC，減少BM中的白血病母細(xì)胞，減少脾腫大，抑制肺轉(zhuǎn)移，延長(zhǎng)AML原代細(xì)胞異種移植小鼠的存活時(shí)間(圖6I-N)。因此，這些體內(nèi)研究結(jié)果表明SsD具有***FTO介導(dǎo)的AML的潛力。
2021年6月，***一篇發(fā)表在Microbiome（IF=11.607）的文章（Microbiotalong-termdynamicsandpredictionofacutegraft-versus-hostdiseaseinpediatricallogeneicstemcelltransplantation.）從共生功能體視點(diǎn)的角度對(duì)29名接受同種異體造血干細(xì)胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進(jìn)行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了口腔和鼻子中的細(xì)菌可能預(yù)測(cè)急性移植物抗宿主病(aGvHD)。監(jiān)測(cè)HSCT患者不同身體部位的微生物群，特別是通過移植前樣本的參與，可能具有預(yù)后價(jià)值，并有助于指導(dǎo)個(gè)性化***策略。識(shí)別具有預(yù)測(cè)移植后aGvHD潛力的獨(dú)特細(xì)菌，可能為改進(jìn)預(yù)防性臨床管理提供機(jī)會(huì)，包括對(duì)微生物群的調(diào)節(jié)。背景：在異種造血干細(xì)胞移植(allogeneichematopoieticstemcelltransplantation,allo-HSCT)中，供者來(lái)源的干細(xì)胞輸注被用于***各種類型的血液病和非血液病。在異種造血干細(xì)胞移植患者中，移植后人體腸道菌群發(fā)生變化，這可能部分歸因于******和調(diào)理方案。按照實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)路線和實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行文章的構(gòu)思與潤(rùn)色。
4、miR-208b直接靶向和抑制CD4+T細(xì)胞中PDCD4的表達(dá)
為了進(jìn)一步探究miR-208b的分子機(jī)制，探究了其下游靶基因機(jī)制，使用生信預(yù)測(cè)了其靶基因，**終挑選到PDCD4（圖5A）。熒光素酶進(jìn)一步證實(shí)了miR-208b和PDCD4之間的結(jié)合（圖5C-D）。研究發(fā)現(xiàn)，T細(xì)胞中PDCD4的表達(dá)在SW480外泌體處理組***下降，而這個(gè)抑制作用在SW480-OXA組更加明顯，PCD表達(dá)在miR-208b缺失組則***升高（圖5E）。此外，加入miR-208bmimics后，PDCD4蛋白***降低，而抑制miR-208b后，PDCD4蛋白的表達(dá)相對(duì)增強(qiáng),此外，PDCD4在mRNA水平的表達(dá)沒有明顯變化（圖5F）。然后，評(píng)估了miR-208b對(duì)CD4+T細(xì)胞擴(kuò)增的影響。研究表明，轉(zhuǎn)染miR-208bmimics***增強(qiáng)了Treg的擴(kuò)增，而抑制miR-208b水平則抑制了Treg的擴(kuò)增（圖5G-H）。這些結(jié)果表明miR-208b直接靶向抑制PDCD4的表達(dá)，導(dǎo)致Treg分化。
5、確認(rèn)PDCD4在調(diào)節(jié)Treg擴(kuò)增中的作用
隨后探究了PDCD4在調(diào)節(jié)Treg擴(kuò)增中的作用。如圖A-C所示，成功構(gòu)建了PDCD4的過表達(dá)和干擾表達(dá)細(xì)胞系。與對(duì)照組相比，PDCD4過表達(dá)***降低了Treg細(xì)胞的擴(kuò)增率，而干擾其表達(dá)則***提高了Treg細(xì)胞的擴(kuò)增率。表明PDCD4是負(fù)調(diào)節(jié)Treg細(xì)胞擴(kuò)增的關(guān)鍵基因。 外泌體CD44v6和C1QBP可能是預(yù)測(cè)PDAC患者預(yù)后的有前途的生物標(biāo)志物。SNP檢測(cè)課題整包服務(wù)
表達(dá)PTEN- 398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點(diǎn)的***有關(guān)。結(jié)腸炎課題實(shí)驗(yàn)外包
QKI促進(jìn)NSCLC細(xì)胞中circNDUFB2的生物發(fā)生
circNDUFB2和NDUFB2均來(lái)自NDUFB2 pre-mRNA，而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調(diào)。因此，推測(cè)circNDUFB2的下調(diào)在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生。我們?cè)赾ircNDUFB2中搜索與潛在QRE匹配的序列。接下來(lái)進(jìn)行了RIP分析，確認(rèn)QKI確實(shí)與NDUFB2 pre-mRNA中的假定QRE結(jié)合。在NSCLC細(xì)胞中QKI過表達(dá)可能會(huì)上調(diào)circNDUFB2。 這些數(shù)據(jù)表明，QKI與NDUFB2 pre-mRNA的circNDUFB2形成外顯子側(cè)翼的內(nèi)含子結(jié)合，從而促進(jìn)circNDUFB2的形成。 結(jié)腸炎課題實(shí)驗(yàn)外包
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7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)