3)LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制糖酵解
由于PGK1是一種關鍵的糖酵解酶,而LINC00926被鑒定為負調控PGK1的lncRNA,我們想知道需氧糖酵解是否在LINC00926介導的乳腺*細胞增殖抑制中發揮作用。我們測試了LINC00926對葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成的調節作用。結果表明,LINC00926降低了葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成(圖3A)。在LINC00926轉染的細胞中,PGK1的表達逆轉了這些作用。LINC00926還顯示出細胞外酸化率下降(圖3B和3C)。PGK1在LINC00926轉染的細胞中重新表達挽救了這些效果。在PGK1敲低的MDA-MB-231或MCF-7細胞中敲低LINC00926對糖酵解表型沒有影響(圖3D-3F),表明LINC00926通過PGK1抑制糖酵解表型。綜上所述,LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制糖酵解。 阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配實驗設計課題基礎實驗外包
2、白樺素下調SREBP靶基因,降低細胞脂質水平
由于SREBP-2是其自身的直接靶標,因此白樺素將其表達下調40%(圖3A)。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉錄因子這一觀點一致,膽固醇合成途徑中的10個被測基因,例如HMGCR,HMG-CoA合酶(HMGCS)和角鯊烯環氧酶(SE),都被白樺素處理抑制了(圖3A)。類似地,與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關的所有9個基因,例如SREBP-1c,脂肪酸合酶(FAS)和乙酰輔酶A羧化酶α(ACC),都被白樺素顯著下調(圖3B)。與早期觀察結果一致(圖1A),包括ABCG5和ABCG8在內的LXR靶基因不受白樺素的影響(圖3C)。 課題整包課題課題設計ATM對PTEN的磷酸化驅動細胞周期進程。
7、CFL1/PLD1軸介導低氧誘導的HCC細胞中AKT途徑的***之前的一項研究表明,PLD1***AKT及其下游mTOR通路促進HCC細胞增殖、侵襲。與此一致,作者觀察到CFL1敲除降低了p-AKT水平,在HCCLM3細胞中通過PLD1恢復增強了p-AKT水平(圖7A,C)。此外,PLD1沉默逆轉了CFL1誘導的Hep3B細胞中AKT信號轉導通路的活化(圖7B,D)。值得注意的是,CFL1或PLD1敲除抑制了肝*細胞中缺氧誘導的AKT通路***和EMT過程(圖7E,F)。之后,進行拯救實驗探討HIF-1α-CFL1-PLD1軸中PLD1的功能。在HCCLM3細胞中過表達的PLD1可以逆轉低氧條件下CFL1-shRNA引起的對AKT磷酸化或EMT過程的抑制(圖7G,H)。總的來說,證實CFL1/PLD1軸在缺氧誘導的HCC進展中起重要作用。
總之,該研究表明HCC中過表達CFL1與較差的臨床病理學參數呈正相關。體外和體內實驗證實CFL1是HCC**生長和轉移的驅動因素。PDL1/AKT通路介導CFL1的致*功能。此外,CFL1是一個缺氧反應基因,通過***PLD1/AKT信號轉導參與缺氧誘導的HCC進展(圖8)。綜上所述,該研究表明CFL1是低氧微環境與HCC進展之間的一種新的連接體。
同時,circNDUFB2顯著增加了p-P65,p-IRF3,p-STAT1和p-STAT2。circNDUFB2還促進了IRF3和P65進入核內的易位。免疫熒光分析證實circNDUFB2促進了IRF3的磷酸化,并隨后觸發其轉移到細胞核中。更重要的是,RIG-1的敲除顯著消除了這些基因的蛋白質水平或磷酸化水平的上調以及由circNDUFB2誘導的A549細胞中IRF3和P65的核易位。ELISAs測量細胞培養上清液中的細胞因子水平,發現RIG-1敲低顯著消除了對CXCL10,CXCL11,CCL5和IFNβ的誘導。上述結果表明RIG-1在介導NSCLC細胞中circNDUFB2的免疫應答中起關鍵作用,而circNDUFB2引發的免疫應答不依賴于circNDUFB2中m6A的修飾。高通量分子實驗的后續標書申請指導服務。
二、腸道微生物群落動態變化
確定每個個體部位12個**豐富的科。HSCT后,在腸內第II期Lachnospiraceae的豐度減少,從檢查前的13%減少到第1周的4.7%,然后在第III期開始的第3個月恢復到27.5%(圖2A)。同時,腸球菌科在II期的擴張(檢查前:6.1%;第1周:22.8%)和第二階段的乳酸菌科(預檢:2%;第3個月后,第三階段分別減少到0.2%和0.6%(圖2A)。LDA在腸道中顯示了19個支系(共102個ASVs),這些支系在時間點上對樣品的分離效果比較好(圖2B)。兩個相當有鑒別能力且LDA系數為正的進化支系包括腸球菌科(Enterococcaceae)和乳酸桿菌科(Lactobacillaceae)的ASVs(圖2B)。從第3個月開始,它們的豐度再次下降到與預處理時間相當的水平(圖2C)。其中,ASV 78的數量**多,觀察頻率比較高(圖2D),其16S rRNA部分基因序列與wexlerae序列相似性較高。另一項PCA分析也支持這些發現(圖2E)。腸球菌科(Enterococcaceae)在II期樣品中更為豐富,Lachnospiraceae和Ruminococcaceae在I期和III期樣品中更為豐富(圖2E)。 阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配。納米顆粒課題產學研合作
caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細胞的標志物。實驗設計課題基礎實驗外包
隨后,通過進行spearman分析,研究了所有三組循環代謝產物豐度與腸道微生物群之間的聯系,以測試33個屬與52個代謝產物之間的關聯,其中有11個代謝物與各屬均無***相關(圖7A)。其余甘油磷脂類只與一兩種屬相關,而多不飽和脂肪酸(8-HETE, 8,9 - DiHETrE, 20-羥基二十甲酸)與至少7個屬***相關。此外,血清水蘇糖與瘤胃球菌1或2之間的相關性表明,PCOS大鼠血清水蘇糖水平降低與瘤胃球菌1豐度降低和瘤胃球菌2豐度增加有關(圖7B-C)。當tempol干預改變瘤胃球菌_1和_2的豐度時,PCOS大鼠血清水蘇糖水平升高。實驗設計課題基礎實驗外包
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗