河南科研國家自然科學基金

來源: 發布時間:2021-10-19

靶向**相關巨噬細胞(TAMs)是一種很有前途的策略,可以改變免疫抑制**微環境,改善**免疫***。單胺氧化酶A (MAO-A)是一種因其在大腦中的功能而***的酶,小分子MAO抑制劑(MAOIs)用于臨床***神經系統疾病。這里作者發現MAO-A誘導人和小鼠的TAMs進而可用于**的免疫***。該文2021年6月發表于《nature communications》IF:14.919期刊上。

主要實驗結果:1、MAO-A缺陷小鼠顯示與TAM極化改變相關的**生長減少

將同基因B16-OVA黑色素瘤接種給C57BL/6J小鼠,分離出TAM并評估TAM基因表達譜。除了參與調節巨噬細胞免疫應答的經典基因的變化,還觀察到一個Maoa基因在TAMs中的上調表達(圖1a),這表明MAO-A可能參與了TAM活性的調節。 總體生存率低與m6A水平增高***相關。河南科研國家自然科學基金

并同年在同期刊中發表,遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態發生,Tspan4a和Tspan7(遷移體生成相關基因)突變體斑馬魚的***形態發生受損,并闡明遷移體誘導胚胎細胞至正確的位置,從而影響***形態發生[5]。2019年俞立團隊還發表了關于遷移體標志物的文章[6],該文章闡明了人血清中存在遷移體;與外泌體相比,遷移體中存在四種特異性蛋白:NDST1、EOGT、PIGK和CPQ。

2021年5月,俞立團隊在Cell期刊(IF=38.637)上發表文章,文章主要講述在外界刺激下,細胞中受損的線粒體外排至遷移體中[7]。同年6月,俞立團隊利用斷層成像技術研究不同物種的大規模細胞遷移和神經活動,并觀察了哺乳動物在中性粒細胞遷移和**細胞循環過程中的各種亞細胞動力學[8],該研究成果亦發表于Cell期刊中。 內分泌科研贈送提供技術路線英拜生物提供生物科學內的專業的技術咨詢,技術合作。

1)脊髓損傷后,BSCB隨著巨噬細胞浸潤和TJs破壞而破壞

脊髓損傷后,BSCB的完整性被破壞,如圖1A和B所示,在脊髓損傷中可見EB染色明顯,而假手術組未見EB染色,脊髓中EB染色含量也明顯增加。此外,在BSCB破壞的同時,我們發現大量巨噬細胞浸潤損傷區血管周圍(圖1C),以M1極化為主,表現為CD68+和iNOS+(圖1C,1D)。此外,脊髓損傷后的病變區域可見明顯的血管新生,這可能是缺氧微環境所致;然而,TJs和血管的熒光染色顯示,與非損傷區相比,損傷區ZO-1和Occludin與CD31的共位較少(圖1E和F)。脊髓損傷后TJs蛋白水平隨時間***降低(圖1G)。考慮到脊髓損傷后浸潤的M1極化巨噬細胞與病變區域的血管存在相互干擾,我們推測M1極化巨噬細胞可能對脊髓損傷后的血管內皮細胞發揮重要作用,損害BSCB的完整性。

二、偽時間軌跡,染色質可及性和基因表達分析揭示Flow-Dependent內皮細胞重新編程

我們的分析明確了3種主要的分化細胞類型:(1)ec,(2)免疫細胞(巨噬細胞,樹突狀細胞和T細胞),以及(3)SMCs和纖維細胞(圖3A)。此外,在每一細胞類型走向的軌跡路徑上,還有許多其他細胞出現,表明它們響應d-flow的過渡性去分化狀態。為了更好地理解軌跡結果,我們將分析分為四種實驗條件(圖3B)。在s-flow條件下(2D-R和2W-R),大部分細胞分化良好,少數細胞處于過渡狀態。相反,d-flow條件誘導許多ec進入過渡狀態,潛在地向smc和纖維轉化分化,表明EndMT。令人驚訝的是,我們還發現許多ec在急性d-flow條件下(2D-L)向免疫細胞轉移,在慢性d-flow條件下(2W-L)進一步增加。 英拜提供分子生物學以及免疫病理相關實驗。

將A375-A2-ESO人黑色素瘤細胞、ESO-T細胞和IL-4/IL-13極化的MDMs以2:2:1的比例混合,放置在模擬TME的3D**類***培養物中(圖6k)。IL-4/IL-13極化MDMs有效抑制ESO - T細胞介導的A375-A2-ESO**細胞的殺傷;在MDM極化過程中,苯乙肼的***在很大程度上緩解了這種免疫抑制作用(圖6l)。因此,與苯乙肼處理的MDMs共培養的ESO-T細胞相比,與非苯肼處理的MDMs共培養的ESO-T細胞顯示了T細胞活化的增強(圖6m)。總的來說,這些數據表明MAOI誘導的人類TAM重編程具有改善抗**T細胞反應的潛力。此外,人和小鼠的TAM都高表達MAOA基因(圖6n),證實MAO-A可作為人類TAMs的有效藥物靶點。評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調節因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達。吉林科研服務價格

FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉移。河南科研國家自然科學基金

自噬“貨物”是有選擇性裝載的,其中主要依靠LIR基序與LC3互作,形成自噬體。隨后,自噬體進行運輸、溶解。研究表明,自噬異常會影響疾病進程。**中的自噬具有雙重作用:一方面自噬的發生會增強*細胞的生存能力;另一方面,抑制自噬會造成“廢物”的積累、基因突變等,誘發**。本研究旨在探索人類**中是否有某些突變通過影響LIR基序來改變自噬選擇性,進而影響疾病進程。

1.構建LIR預測模型pLAM

收集人、釀酒酵母、其他物種LIR,并獲取相應蛋白,確定了LIR的序列信息。

驗證算法的可靠性,然后用于泛*LIR基序預測,并對預測到的LIR基序對應的基因進行GO、Pathway富集分析。

2.LIR基序突變預測

收集TCGA、ICGC和COSMIC數據庫突變數據并進行整合,獲得2,963,952個獨特的SNV。提取其中LIR基序的突變信息。分析發現STBD1蛋白,參與糖原代謝,在之前尚未報道過與**自噬有關。 河南科研國家自然科學基金

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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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