為了確定METTL3促進(jìn)**細(xì)胞增殖的機(jī)制，檢測(cè)了METTL3在ESCC細(xì)胞上轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中的作用。METTL3缺失降低了KYSE180細(xì)胞中m6A的總豐度。甲基化RNA免疫沉淀（MeRIP）和m6A特異性抗體，然后進(jìn)行RNA測(cè)序（MeRIP-seq），發(fā)現(xiàn)KYSE180的mRNA中鑒定的m6A位點(diǎn)與RRACH序列一致。m6A信號(hào)在mRNAs的終止密碼子和3′-非翻譯區(qū)富集。在MeRIP-seq中METTL3缺失減少了1101個(gè)基因的mRNAs中1199個(gè)m6A峰。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)METTL3缺失調(diào)節(jié)2973個(gè)基因的表達(dá)。二者取交集發(fā)現(xiàn)共有93個(gè)基因重疊。MeRIP-seq中細(xì)胞成分（CC）項(xiàng)的基因本體（GO）富集分析表明，在METTL3缺失的KYSE180細(xì)胞中，β-連環(huán)蛋白降解復(fù)合物（的基因組（包括APC）中m6A水平***降低。英拜的員工福利待遇很好。甘肅科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
我們鑒定出了幾個(gè)可能與LINC00926相互作用的蛋白，包括兩個(gè)E3連接酶，STUB1和E6AP(圖4F)。免疫印跡進(jìn)一步證實(shí)，只有STUB1與LINC00926相互作用，而E6AP則沒(méi)有(圖4G)。此外，RIP分析也表明，PGK1和STUB1免疫沉淀中，LINC00926***富集(圖4H)。此外，LINC00926增強(qiáng)了STUB1介導(dǎo)的PGK1泛素化(圖4I)。敲低STUB1**減弱了LINC00926對(duì)PGK1泛素化的影響(圖4J)。這些數(shù)據(jù)表明，STUB1在LINC00926調(diào)控PGK1泛素化過(guò)程中起著關(guān)鍵作用。與LINC00926對(duì)STUB1介導(dǎo)的PGK1泛素化的影響一致，LINC00926增加了STUB1和PGK1之間的相互作用(圖4K)。而敲低STUB1**減弱了LINC00926對(duì)PGK1降解的影響(圖4L)。項(xiàng)目科研實(shí)驗(yàn)可參觀這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強(qiáng)。
一、CRPC細(xì)胞中AR的染色體
散點(diǎn)圖顯示在VCaP細(xì)胞的兩個(gè)生物重復(fù)中由AR ChIP-SICAP鑒定的染色質(zhì)相關(guān)蛋白。在暴露于R1881(合成AR激動(dòng)劑）中使用差異的silac標(biāo)記。在190個(gè)ChIP-SICAP定量蛋白中，87個(gè)形成了r1881誘導(dǎo)的AR染色體，從而發(fā)現(xiàn)了可能與受體功能相互作用的蛋白。r1881誘導(dǎo)的AR chromatome被分為不同的功能蛋白組(圖1b)。DNA和rna結(jié)合蛋白，組蛋白，DNA修復(fù)和mRNA加工相關(guān)蛋白形成了大部分(~50%)的網(wǎng)絡(luò)。
二、SMARCA4共占據(jù)了大多數(shù)ar結(jié)合位點(diǎn)，但對(duì)其染色質(zhì)可及性的影響有限
SMARCA4和AR共同占據(jù)的位點(diǎn)，以及雄***如何影響共同占據(jù)。SMARCA4(61534)的大多數(shù)染色質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)沒(méi)有受到DHT的影響(簇C1，圖2a），在C2位點(diǎn)，AR和SMARCA4與結(jié)合高度相關(guān)。DHT增強(qiáng)了SMARCA4在這些位點(diǎn)的招募(集群C1，圖2b)。基序分析顯示，與C1位點(diǎn)相比，C2位點(diǎn)具有更高的雄***響應(yīng)元件(AREs)富集，進(jìn)一步支持雄***誘導(dǎo)的SMARCA4到染色質(zhì)上的募集。FOXA1、ERG和HOXB13的基序依次在C1和C2位點(diǎn)上同樣富集(圖2c)。ChIP-seq數(shù)據(jù)集顯示，F(xiàn)OXA1和ERG的結(jié)合隨著***暴露在C2位點(diǎn)而增加，而在C1位點(diǎn)則不增加(圖2d和e)。然而，HOXB13似乎在C1位點(diǎn)結(jié)合更多(圖2f)。
3、外泌體S100A4是HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)移潛力的關(guān)鍵增強(qiáng)子
為了探究通過(guò)HMH-exo增強(qiáng)HCC轉(zhuǎn)移能力的關(guān)鍵，作者對(duì)LMH-exo和HMH-exo進(jìn)行了iTRAQ質(zhì)譜篩選。結(jié)果從HMH-exo中鑒定到116個(gè)***上調(diào)和43***下調(diào)的蛋白質(zhì)；結(jié)果發(fā)現(xiàn)了4個(gè)蛋白家族的聚類：Apo、PSM、EEF/EIF和S100鈣結(jié)合蛋白家族（圖3a-b）。經(jīng)過(guò)文獻(xiàn)分析，作者主要關(guān)注了S100鈣結(jié)合蛋白家族，并以其中*****差異表達(dá)的4個(gè)蛋白為主：依次是S100A4，S100A6，S100A10，和S100A11。作者檢測(cè)了這4個(gè)蛋白在5個(gè)HCC細(xì)胞系外泌體中的表達(dá)豐度，結(jié)果發(fā)現(xiàn)依然是S100A4的表達(dá)水平比較高（圖3c）。因此，初步選擇S100A4進(jìn)行下一步分析。 Th1/Th2細(xì)胞失衡也是結(jié)腸炎的一個(gè)重要特征。
為了確定EVs介導(dǎo)的ELNAT1在體內(nèi)促進(jìn)LN轉(zhuǎn)移，首先構(gòu)建一個(gè)小鼠腘窩的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移模型。小鼠隨機(jī)分為2組（n=12），每3天接受由載體（UM-UC-EVVector）或ELNAT1（UM-UC-3-EVELNAT1）轉(zhuǎn)染的UM-UC-3細(xì)胞分泌的EVs瘤內(nèi)注射，當(dāng)原發(fā)**大小達(dá)到200mm3時(shí)采集**和腘窩的LNs（Figure3D）。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，通過(guò)體內(nèi)成像系統(tǒng)（IVIS）發(fā)現(xiàn)，與UM-UC-EVVector相比，UM-UC-3-EVELNAT1促進(jìn)了UM-UC-3細(xì)胞向腘窩LNs的轉(zhuǎn)移，LNs體積更大（Figure3E-I）。
由于淋巴管生成是淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵步驟，因此進(jìn)一步評(píng)估了EVs介導(dǎo)的ELNAT1在體內(nèi)對(duì)淋巴管生成的影響。結(jié)果顯示，UM-UC-3-EVELNAT1組***增加了小鼠足底**瘤內(nèi)和瘤旁區(qū)域的淋巴管內(nèi)皮透明質(zhì)酸受體1陽(yáng)性（LYVE-1positive）（Figure3J,K）。以上結(jié)果表明，EVs介導(dǎo)的ELNAT1促進(jìn)BCa體內(nèi)淋巴管生成和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。 英拜可解放您的雙手釋放您的時(shí)間。醫(yī)學(xué)科研科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
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細(xì)胞間的相互作用在**進(jìn)展和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關(guān)鍵作用。目前關(guān)于這些**細(xì)胞是如何與其他細(xì)胞相互交流的仍有很多是未知的。**釋放的外泌體被認(rèn)為是**進(jìn)行細(xì)胞間溝通的有效介質(zhì)。Dong等探索了肝細(xì)胞*（HCC）外泌體在其轉(zhuǎn)移和預(yù)后價(jià)值中的功能。本文于2021年6月發(fā)表在《Signal Transduction and Targeted Therapy》期刊上，IF：13.493。
1、外泌體的分離與鑒定以及HCC細(xì)胞的釋放和吸收
使用投射電子顯微鏡觀察了外泌體的形態(tài)和形狀；納米粒子**分析發(fā)現(xiàn)外泌體直徑在40-200nm之間，并且在6個(gè)HCC細(xì)胞系外泌體中都檢測(cè)到了外泌體標(biāo)志物CD63，CD9，和Alix的表達(dá)；然后使用DIO標(biāo)記高轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞的外泌體（HMH-exo）和低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞外泌體（LMH-exo），在激光掃描共焦顯微鏡下觀察到綠色標(biāo)記的HMH-exo和LMH-exo都可以被低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞細(xì)胞系有效吸收（圖1）。這些結(jié)果表明已經(jīng)成功分離和純化HCC來(lái)源的外泌體并且他們可以被其它HCC細(xì)胞吸收。 甘肅科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
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5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)