RIG-I對circNDUFB2誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)至關(guān)重要
RIG-I樣受體（RLR）家族可識別病毒RNA 會通過產(chǎn)生IFN和促炎性細(xì)胞因子來觸發(fā)針對病毒***的先天免疫反應(yīng)。已經(jīng)報道外源circRNA有效刺激由RIG-1介導(dǎo)的免疫信號傳導(dǎo)。從qRT-PCR分析獲得的數(shù)據(jù)表明，RIG-1敲低消除了circNDUFB2過表達(dá)誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)，RIG-1被circNDUFB2上調(diào)。為了研究circNDUFB2和RIG-I之間的關(guān)聯(lián)，進(jìn)行RIP分析和RNA FISH免疫熒光實驗。 結(jié)果表明circNDUFB2與RIG-1結(jié)合，并且它們共定位在細(xì)胞質(zhì)中。 circNDUFB2過表達(dá)后， circNDUFB2顯著上調(diào)了RIG-1，IRF7，IFNβ和TNF的蛋白水平，而circNDUFB2則不影響P65和IRF3的蛋白水平。 上海英拜生物提供可靠可信可參觀的實驗平臺。細(xì)胞因子芯片科研實驗外包
此外，ChIP分析顯示，過表達(dá)ELNAT1增加了hnRNPA1和組蛋白甲基化（H3K4me3）在UBC9啟動子上的富集，而通過刪除hnRNPA1的ELNAT1結(jié)合位點則抑制了富集（Figure 5 K, L）。同時，ELNAT1沉默***降低了UM-UC-3和T24細(xì)胞UBC9啟動子的hnRNPA1占用率和H3K4me3甲基化（Figure 5 M, N），這證明了hnRNPA1通過調(diào)節(jié)UBC9啟動子上的組蛋白甲基化，促進(jìn)ELNAT1誘導(dǎo)UBC9的轉(zhuǎn)錄***。以上結(jié)果說明，ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯(lián)體，通過招募hnRNPA1增強(qiáng)H3K4me3修飾。基因組研究服務(wù)科研地區(qū)科學(xué)基金**近科研技術(shù)的開發(fā)。
有趣的是，我們發(fā)現(xiàn)內(nèi)源性PGK1蛋白水平和LINC00926水平在5種乳腺*細(xì)胞系(MCF-7、T47D、ZR75-1、MDA-MB-453、MDA-MB-231)中均呈負(fù)表達(dá)。在相對轉(zhuǎn)移性細(xì)胞系MDA-MB-231中PGK1表達(dá)量比較高，LINC00926表達(dá)量比較低；而惡性程度較低的細(xì)胞系MCF-7中PGK1表達(dá)量較低，LINC00926表達(dá)量較高(圖1G)。敲除LINC00926后，MCF-7細(xì)胞中PGK1的表達(dá)***增加，而過表達(dá)LINC00926后，MDA-MB-231細(xì)胞中PGK1的表達(dá)***降低(圖1H)。這些結(jié)果表明，LINC00926下調(diào)PGK1的表達(dá)，可能與PGK1介導(dǎo)的乳腺*發(fā)展呈負(fù)相關(guān)。
特色lncRNA基因
LncExpDB 表征了在特定細(xì)胞系/組織中特異性表達(dá)、在**或病毒***背景下差異表達(dá)、在特定細(xì)胞器中富集、在細(xì)胞分化或胚胎/***發(fā)育過程中動態(tài)表達(dá)或隨晝夜節(jié)律周期性表達(dá)的特征 lncRNA 基因韻律。基于大量RNA-seq數(shù)據(jù)，共鑒定出25191個特征lncRNA，其中***發(fā)育7922個，正常組織/細(xì)胞系7498個，亞細(xì)胞定位5292個，植入前胚胎4343個，*細(xì)胞系2907個，1740個晝夜節(jié)律，外泌體中為 1538，細(xì)胞分化中為 1232，病毒***中為 985。
LncRNA-mRNA相互作用
為了促進(jìn)對特征 lncRNA 分子機(jī)制的深入研究，LncExpDB 通過共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測 lncRNA-mRNA 相互作用。LncExpDB 總共包含 28 443 865 個預(yù)測的 lncRNA-mRNA 相互作用；這些相互作用中的大多數(shù) (96.4%) 存在于一種生物環(huán)境中，并且在五種環(huán)境中發(fā)現(xiàn)了 12 種相互作用。 N6甲基腺苷（m6A）是一種常見的真核細(xì)胞mRNA修飾。
OARSI分級(圖6E)進(jìn)一步提示小鼠SHAM+載體和DMM+circPde4b組軟骨降解較少，而DMM+載體和DMM+circPde4b+RIC8A組軟骨降解情況相反。熱板試驗、膝關(guān)節(jié)伸展試驗和電擊刺激跑步機(jī)試驗顯示，DMM+載體組和DMM+circPde4b+RIC8A組的不適和膝關(guān)節(jié)疼痛多于SHAM+載體組和DMM+circPde4b組(圖6F)。小鼠膝關(guān)節(jié)的三維微CT重建顯示，DMM+NC組和DMM+circPde4b+RIC8A組比SHAM+載體和DMM+circPde4b組有更多的骨贅(圖6G)。此外，四組中RIC8A和p-p38標(biāo)記的免疫組化染色顯示過表達(dá)circPde4b下調(diào)了RIC8A和p-p38的表達(dá)，從而抑制了DMM手術(shù)引起的OA進(jìn)展(圖6H，I)。綜上所述，在小鼠中，circPde4b和RIC8A參與了OA的發(fā)病機(jī)制（圖6J）。
結(jié)論：我們的研究描述了一種新的circRNA在OA中的機(jī)制。我們發(fā)現(xiàn)circPDE4B可以作為蛋白質(zhì)降解的支架，在OA的進(jìn)展中發(fā)揮重要作用。在臨床前動物模型中，CircPDE4B被發(fā)現(xiàn)調(diào)節(jié)細(xì)胞外基質(zhì)代謝，阻止軟骨基質(zhì)的形成，證實了其對OA發(fā)生的潛在***作用。機(jī)制上，circPDE4B可作為促進(jìn)RIC8A-MID1結(jié)合的支架，降低RIC8A依賴的p38信號通路的***，從而調(diào)節(jié)OA的進(jìn)展。 文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(jié)(MLN)中的Th17細(xì)胞（與結(jié)腸炎癥密切相關(guān)）。轉(zhuǎn)錄組科研實驗外包
英拜的實驗室坐落在上海漕河涇園區(qū)浦江園區(qū)。細(xì)胞因子芯片科研實驗外包
急性髓系白血病(AML)的靶向***的實施一直具有挑戰(zhàn)性。FTO是一種m6A去甲基酶，作為一種致*基因，促進(jìn)白血病*基因介導(dǎo)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和白血病發(fā)生。因此為大家介紹于2021年3月發(fā)表于影響因子為8.579的Theranostics上文章“Saikosaponin D exhibits anti-leukemic activity by targeting FTO/m6A signaling”。在這里，我們研究了Saikosaponin-d (SsD)在AML中***的抗增殖作用中的作用，并通過靶向SsD的FTO來評估m(xù)6A去甲基化活性。SsD在體外和體內(nèi)均能***抑制AML細(xì)胞增殖，促進(jìn)細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期阻滯。機(jī)制上，SsD直接靶向FTO，從而增加了m6A RNA的甲基化，降低了下游基因轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性，導(dǎo)致相關(guān)通路的抑制。重要的是，SsD還克服了FTO/m6A介導(dǎo)的白血病對酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性。總之，F(xiàn)TO依賴的m6A RNA甲基化介導(dǎo)了SsD的抗白血病作用，使SsD成為一種***白血病的藥物。細(xì)胞因子芯片科研實驗外包
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗