2)Pex增強肝衛星細胞(HSCs)的活性
為了證實Pex的生物學功能,將原代小鼠肝細胞與Pex孵育,Pex被受體細胞吸收。然后使用免疫熒光染色對原發性肝細胞的類型進行表征,結果顯示,desmin+HSCs和F4/80+Kupffer細胞吸收了Pex(圖2A)。我們接下來研究了Pex對HSCs生物學行為的影響,發現Pex***增強了HSCs的增殖和遷移能力(圖2B和C)。Pex與Npex處理的HSCs的凋亡沒有***差異(圖2D)。westernblot和免疫熒光檢測結果顯示,Pex***上調α-SMA的表達,說明Pex能促進HSC的活化(圖2E和F)。我們觀察到Pex可以通過下調vitronectin和tenascinC的表達,上調collagenI和fibronectin的表達來調節HSCs中的ECM分泌(圖2G)。 英拜注重客戶的隱私。深圳成骨芯片科研
6、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化促進CRLM
將弱轉移的CRC細胞系SW480和RKO與miR-934mimics預處理的THP-1細胞的CM共培養。結果顯示,無論是體內還是體外,侵襲和轉移能力都隨著miR-934mimics外泌體處理而升高,隨著anti-miR-934外泌體處理而下降(Fig.6c–g)。這些結果表明,CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化可以增強CRC細胞的侵襲和肝轉移能力。
7、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化,通過***CRC細胞中的CXCL13/CXCR5軸促進CRLM
用HCT-8細胞來源的外泌體與陰性對照處理或PMA預處理的THP-1細胞孵育,分析趨化因子水平。如Fig.7a所示,CXCL13、IL-10和CCL22的表達水平遠遠高于其他趨化因子的水平。然后,PMA-pretreatedTHP-1細胞轉染miR-934mimics或NC,ELISA表明CXCL13的表達***增加(大約10倍)而CCL22和IL-10(二至三倍),這表明CXCL13可能在CRLM的進展扮演了一個重要的角色(Fig.7b)。此外,結果顯示,過表達miR-934或下調miR-934可部分增強或減弱HT29/HCT8細胞來源外泌體對M2巨噬細胞分泌CXCL13的增強作用(Fig.7c)。 免疫微環境科研服務兩年乳酸菌是益生菌在嘌呤代謝中發揮關鍵作用。
三、原始表型和染色質可及性
雖然基因表達反映了細胞身份的活躍狀態,但順式調節元件(cre),包括啟動子和增強子,是決定細胞命運的潛在因素。因此,我們研究了npm1突變的AML樣本是否也會根據其順式調控景觀分層為原始和committed的集群。使用轉座酶可達染色質測序(ATAC-seq)可達染色質區域,以CREAM方法鑒定的**為重點,根據表達譜對AML樣本進行聚類,但有一個例外(圖3A)。我們的研究結果表明,啟動子區形成了**(啟動子:FDR = 11%,基因間:FDR = 2%;圖3B、C及補充圖19)。RUNX和GATA家族成員HOXC9和CTCF的dna結合位點基模只富集在原始亞型的COREs中,提示可能存在調控原始亞型基因的因素(圖3D,補充數據3).對承諾亞型中***可獲得的**進行基序富集分析,確定了CEBP、ATF家族成員、OCT2、IRF2、NFkB-p65、ESRRB和EGR2識別的共識序列,提示它們在committed亞型中可能發揮的作用(圖3D)補充數據。
結果顯示,過表達miR-337-3p和miR-137抑制了HMGA2、TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達(圖6E和6F)。agomir-3373p/137處理和sh-MIR210HG-或sh- HMGA2處理Ishikawa和HEC-1A細胞中,b-catenin在細胞核中的分布減少,E-cadherin的表達增加。然后,我們研究了MIR210HG是否通過改變miR-337-3p/137-HMGA2軸來影響EMT進展。Western blotting和免疫熒光結果顯示,MIR210HG的下調降低了Ishikawa和HEC1A細胞中HMGA2蛋白的表達,而加入miR-337-3p/137抑制劑后,對HMGA2、b-catenin和E-cadherin表達的抑制作用被逆轉(圖6G和6H)。
MIR210HG通過miR-337-3p和miR-137促進**進展
為了確定MIR210HG下調對Ishikawa和HEC-1A細胞系惡性行為的抑制作用是否通過miR-337-3p/137介導,我們進行了功能挽救實驗。結果證實MIR210HG沉默對Ishikawa和HEC-1A細胞遷移和侵襲的惡性抑制作用被miR-337-3p/137敲低***逆轉(圖7A-7E)。這表明MIR210HG通過miR-337-3p/137調控Ishikawa和HEC-1A細胞的惡性生物學行為。 METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。
1)AKI伴有明顯的脂質積累,并與腎損傷的嚴重程度高度正相關根據脂質代謝組學分析結果,我們發現AKI組織中各類甘油三酯(TGs)含量***增加(圖1A)??紤]到AKI中的脂質積累,我們進行實驗來確定其臨床意義。我們對不同嚴重程度的AKI動物標本進行油紅O染色。結果顯示,隨著疾病進展的延長,小鼠腎組織脂質沉積逐漸增加(圖1B)。在體外也發現了類似的結果,即隨著細胞損傷的嚴重程度,脂質積累的程度增加(圖1C)。這些結果說明AKI中的脂質積累與疾病的嚴重程度呈正相關。尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。MMP科研省自然科學基金
英拜跟客戶形成產學研合作模式。深圳成骨芯片科研
3.分析突變的LIR基序(LAMs)在泛*中的作用
使用TCGA數據庫分析發現,STDB1在泛*中為抑制**;在膠質母細胞瘤中為促進**。
驗證LIR基序突變影響自噬
在HEK293T細胞中進行co-IP,結果表明STBD1LIR基序W203C是影響基因互作的重要結構。
進一步研究發現,STBD中W203C突變影響其與GABARAPL1的結合,進而影響自噬指標的表達。
5. 在臨床樣本中檢測STBD1的表達
在*組織、*旁中檢測STBD1的表達水平,結果表明STBD1在*組織中***下調,與之前的預測結果一致。
6.細胞實驗研究STBD1的功能
在多種*細胞中進行細胞功能實驗,STBD1抑制*細胞生長,突變W203C會部分回復STBD1的抑制作用。
7.動物實驗驗證STBD1的功能
裸鼠成瘤實驗表明,STBD1抑制**生長。
8.轉錄組、代謝組分析
在細胞中干擾STBD1,然后進行轉錄組測序,分析表達水平***改變的基因,并進行通路富集分析。分析發現,STBD1抑制**生長可能是通過改變基因轉錄和重塑糖酵解/糖異生途徑。
為了進一步驗證STBD1是否重塑代謝,進行代謝組分析。結果表明,STBD1敲除后糖酵解增強。
9.構建LIRCP調節網絡
將LAMs對應蛋白、自噬相關基因按照生物學功能聚類,構建調節網絡,將自噬與**聯系起來。
深圳成骨芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗