克羅恩病科研地區科學基金

來源: 發布時間:2021-10-20

蛋白降解靶向嵌合體(Proteolysis-TargetingChimeras,PROTACs)是一種新的具有良好前景的藥物類型,其結構類似于啞鈴,通過一個連接子(linker)連接“靶蛋白的配體”以及“E3泛素連接酶的招募配體”,即泛素-蛋白酶體系統選擇性降解靶蛋白。已成為一種新型***技術,具有優于傳統抑制策略的潛在優勢。***講一篇浙江大學侯廷軍教授團隊發表在NucleicAcidsResearch期刊上的關于PROTAC在線數據庫的文章,文章提名為PROTAC-DB:anonlinedatabaseofPROTACs。PROTAC這項技術仍日趨成熟,但PROTAC的設計仍然是一個巨大的挑戰。為了促進PROTAC的合理設計,文章提出PROTAC-DB,這是一個基于Web的開放訪問數據庫,它集成了PROTAC的結構信息和實驗數據。英拜可解放您的雙手釋放您的時間??肆_恩病科研地區科學基金

二、染色質的可及性明確了細胞的類型

我們使用R包Signac來研究不同細胞類型間染色質可及性的差異。細胞類型可以根據差異開放區域(DARs)是開放的還是封閉的來區分(Fig.2a)。約20%(平均比例=0.2030.04)的DAR與各自細胞類型中的差異表達基因密切相關(補充表4)。例如,LRP2是一個表達在近端小管的譜系特異性基因,該區域的覆蓋圖顯示其啟動子和基因體內ATAC峰的數量和幅度增加(圖2a)。事實上,大部分DAR都位于距離**近的轉錄起始位點3kb內的啟動子區域(圖2b,補充圖7)。第二個**常見的位置是內含子,DAR在不同細胞類型中的分布相對保守(圖2c)。 炎癥因子科研實驗外包發現乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。

此外,ChIP分析顯示,過表達ELNAT1增加了hnRNPA1和組蛋白甲基化(H3K4me3)在UBC9啟動子上的富集,而通過刪除hnRNPA1的ELNAT1結合位點則抑制了富集(Figure 5 K, L)。同時,ELNAT1沉默***降低了UM-UC-3和T24細胞UBC9啟動子的hnRNPA1占用率和H3K4me3甲基化(Figure 5 M, N),這證明了hnRNPA1通過調節UBC9啟動子上的組蛋白甲基化,促進ELNAT1誘導UBC9的轉錄***。以上結果說明,ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯體,通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾。

三、ICICLE-seq聯合測量可及性和表位

A.在標準的scATAC-seq協議下,細胞膜的去除切斷了細胞表面和細胞染色質狀態之間的連接。為了測試我們在通透性細胞上同時測量細胞表面蛋白和染色質狀態的能力,我們修改了我們優化的通透性細胞scATAC-seq方法,將其納入使用商用條形碼抗體試劑的測量,我們將這種新方法稱為ICICLE-seq.ICICLE-seq協議利用定制的Tn5轉座復合體,其捕獲序列與基因組公司的10xscRNA-seq凝膠珠捕獲反應兼容,可同時捕獲ATAC片段和多聚腺苷化抗體條形碼序列.

B.UMAP投影和ATAC標記轉移在ICICLE-seq數據上的分辨率與scATAC-seq在死亡細胞和***碎片后的完整通透細胞上的分辨率相似.

C.然而,基于poly-based的捕獲方法和置換片段的單端讀出限制了數據質量。盡管如此,ICICLE-seq結果表明,通透細胞能夠同時捕獲細胞核染色質可達性和高質量的細胞表面表位定量。我們能夠利用額外的ADT數據聚集并根據細胞表面抗原識別細胞類型.

D.E.基于ADT數據的UMAP和JaccardLouvain聚類可以根據細胞類型特異性標記與聚類的明確關聯識別細胞類型特異性聚類。 外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化促進CRC肝轉移。

QKI促進NSCLC細胞中circNDUFB2的生物發生

circNDUFB2和NDUFB2均來自NDUFB2 pre-mRNA,而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調。因此,推測circNDUFB2的下調在轉錄后發生。我們在circNDUFB2中搜索與潛在QRE匹配的序列。接下來進行了RIP分析,確認QKI確實與NDUFB2 pre-mRNA中的假定QRE結合。在NSCLC細胞中QKI過表達可能會上調circNDUFB2。 這些數據表明,QKI與NDUFB2 pre-mRNA的circNDUFB2形成外顯子側翼的內含子結合,從而促進circNDUFB2的形成。 促進胰腺*的生長和轉移。骨質疏松癥科研分子生物學實驗

N6甲基腺苷(m6A)是一種常見的真核細胞mRNA修飾??肆_恩病科研地區科學基金

circRNA是一種新型的非編碼RNA,已被報道通過多種機制參與疾病的發生和發展。MAPK通路是一種常見的信號轉導通路,參與細胞增殖、炎癥和凋亡,在**中起著特別重要的作用。然而,與MAPK通路相關的circRNA在胃*中的作用尚未被探索。因此,小編為大家帶來一篇于2021年4月發表于影響因子為15.302的雜志Molecular Cancer上的文章“A novel protein encoded by circMAPK1 inhibits progression of gastric cancer by suppressing activation of MAPK signaling”。在本研究中,我們發現circMAPK1在胃*組織中較鄰近正常組織表達下調。重要的是,較低的circMAPK1表達預示著GC患者較差的生存。CircMAPK1在體內外均能抑制胃*細胞的增殖和侵襲。接下來,我們發現circMAPK1編碼了一個長度為109個氨基酸的新蛋白。通過一系列功能實驗,我們證實了circMAPK1通過編碼的蛋白MAPK1-109aa發揮了抑制**的作用。在機制上,**抑制因子MAPK1-109aa通過競爭性結合MEK1來抑制MAPK1的磷酸化,從而抑制MAPK1及其下游因子在MAPK通路中的***。克羅恩病科研地區科學基金

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