隨后,作者研究了YTHDC2是否通過SLC7A11抑制胱氨酸攝取。當YTHDC2在H1299細胞中過表達時,并過表達SLC7A11完全恢復了受損的胱氨酸攝取(圖4E-G)。ATF4是SLC7A11轉錄的關鍵轉錄因子,ATF4在H1299細胞中上調SLC7A11(圖4H、I)。過表達YTHDC2仍然拮抗ATF4的作用(圖4H-J)。因此,YTHDC2損害依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取。結合臨床分析,YTHDC2表達下調,而SLC7A11表達上調(圖4K、L),并且它們在**中呈負相關(圖4M)。
5.YTHDC2以m6A依賴的方式使SLC7A11mRNA不穩定
作者為研究YTHDC2是否在轉錄被阻斷后調控SLC7A11mRNA的穩定性,通過泛轉錄抑制劑ActD處理H1299和H1975細胞,發現YTH結構域對于YTHDC2縮短H1299細胞中SLC7A11mRNA的半衰期至關重要(圖5A)。在H1975細胞中,CRISPR/Cas9技術使YTHDC2功能喪失,然后YTHDC2重構,進一步證實YTHDC2加速了SLC7A11mRNA的衰變(圖5B)。EXOSC10是一種外切酶,負責3’-5’外切酶活性。EXOSC10的缺失,減弱了YTHDC2縮短SLC7A11mRNA半衰期的作用(圖5C、D)。在藥理學水平上,用兩種泛-RNase抑制劑DEPC和RNasin***H1299細胞,也阻斷了YTHDC2的功能(圖5D)。 **近科研技術的開發。細胞遺傳學科研中標率高
一、在pik3a突變的ER+乳腺*中,INPP4B的表達增加
INPP4B被確定為人類乳腺*er陽性標記物.INPP4B在三陰性乳腺*中表達缺失,然而,它作為其他**中潛在的致*基因的出現,促使我們檢測其在ER+乳腺*中的相對表達和功能。INPP4B蛋白表達缺失與三陰性乳腺*相關(圖1a, b) 增加INPP4B蛋白表達在14 40%的乳腺*相對于正常組織與ER / PR-positivity和腔內(ER +和/或PR+)乳腺*亞型(圖1 a, b和補充圖1 b, c)。在mRNA表達數據不能用于這些cohorts使用組織掃描乳腺*cDNA陣列I IV (OriGene)檢測130例原發人類乳腺*和16例正常乳腺組織的INPP4B mRNA表達(圖1c)。INPP4B表達降低與三陰性乳腺*相關,而***增加的INPP4B表達在25%的乳腺*中與ER/ propositivity和luminal亞型相關(圖1c, d和補充圖1d, e)。使用METABRIC和TCGA數據集,我們發現只有1%的乳腺*表現出INPP4B基因改變,如突變、截斷、擴增或缺失。INPP4B mRNA表達與PTEN或AKT1突變無關,但與pik3a突變狀態正相關(圖1e和補充圖1f)。在PIK3CA多突變的乳腺*中,INPP4B的表達也***升高(補充圖1g)。進一步分層研究發現,INPP4B高表達與pik3c突變ER+乳腺*亞型特異性相關(圖1f)。 牙周病科研實驗外包METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。
四、原始和committed亞型的免疫表型
我們采用質譜耦合流式細胞儀(CyTOF)分析,在單細胞水平上探討9例原始AML npm1突變和8例committed npm1突變的患者的免疫表型差異。我們使用細胞術(diffcyt)27管道來計算定義具有相似高維表型的細胞群(免疫表型簇)。每個免疫表型聚類映射到二維t-隨機近鄰嵌入(t-SNE)圖上的離散區域(圖4A;補充圖20、21),證實它們表達不同的免疫表型。分析顯示,七種不同水平的CD45和造血祖細胞標記物(CD34, CD38)或骨髓單核細胞分化標記物(CD33, CD14, CD11c, CD16, HLA-DR)的惡性免疫表型集群在這兩種亞型之間差異豐富(圖4B,C)。確診病例中也包含較高豐度的非白血病免疫表型集群,包括CD45hi T (CD3+)、B (CD19+)和NK (CD3 CD56+ CD16+)細胞(補充圖20)。
微生物群對宿主的適應性免疫系統如T細胞發揮免疫調節功能。例如,與擬桿菌屬和梭狀芽胞桿菌相關的人類共生腸道菌株可以在無菌小鼠中誘導T調節(Treg)細胞。**近的研究表明,功能不同的T細胞亞群,如輔助T細胞17 (TH17)和Treg細胞參與了aGVHD的發病機制。除腸道外的身體部位的微生物群,如口腔和鼻腔,也被認為參與免疫調節。我們之前曾提出,腸道微生物群與同種異體造血干細胞移植后的免疫細胞重建有關。然而,其他粘膜部位的微生物群是否受同種異體造血干細胞移植的影響,是否與aGvHD相關,是否與患者免疫系統的恢復相關,目前尚不清楚。文章使用FMT(糞微生態移植)來確定大黃酸改變的腸道菌群是否對結腸炎有療效。
piRNA-30473在DLBCL中升高,是DLBCL患者的不良預后因素
作者首先研究小RNA的表達水平與DLBCL患者的臨床相關性。通過分析微陣列數據,與預后不良組(PP)比較,在預后良好(FPP)的病例中發現了4個***下調或上調的piRNAs(圖1A)。在這四個差異表達RNA的基礎上,作者進一步發現與預后良好(FPP)的患者相比,預后不良患者(PP)的piRNA-30473表達水平***升高(圖1B),且DLBCL患者高水平的piRNA-30473與較差的總生存率相關(圖1C)。綜上所述,piRNA-30473可作為預后的生物標志物,并可用于DLBCL患者的預后分層。 英拜是您身邊的科研小助手。細胞遺傳學科研中標率高
上海英拜生物有經驗豐富的科研團隊。細胞遺傳學科研中標率高
褪黑素可減輕TBI引起的鐵死亡
為了確定褪黑素是否可以挽救TBI引起的鐵死亡,在相應的高峰表達(例如1天和3天)進行了與鐵死亡相關蛋白的蛋白質印跡分析。發現褪黑素給藥在TBI后1天抑制了TBI誘導的xCT,Cox2,Tfr1,Fpn和Nox2蛋白表達的上調。同樣,褪黑素***在TBI后3天阻止了Fth,Ftl和4HNE蛋白的表達。用促鐵蛋白抑制劑liproxstatin-1(Lip-1)也獲得了相似的結果。此外,免疫組化染色顯示,與對照組相比在TBI后第7天,褪黑素和Lip-1的處理減少了神經元中4HNE陽性細胞的數量,表明褪黑素對TBI誘導的脂質具有神經保護作用過氧化。褪黑素和Lip-1均抑制TBI誘導的皮質GSH水平降低。褪黑素和Lip-1抑制TBI誘導3天后損傷皮層中MDA含量的上調。這些數據表明,TBI導致了與鐵死亡相關蛋白表達的時間變化,以及同側皮層中某些受推定的鐵死亡生物標志物的變化,但是用褪黑素有效地挽救了TBI誘導的鐵死亡。 細胞遺傳學科研中標率高
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗