功能機(jī)制研究科研國家自然科學(xué)基金

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-10-22

在人類中,**終的造血功能開始于懷孕27天后,造血干細(xì)胞出現(xiàn)在造血集群的背主動(dòng)脈內(nèi)。這些明確的造血干細(xì)胞在妊娠后4周(pcw)首先在胎兒肝臟定植,并在那里大量擴(kuò)張。在10.5 pcw時(shí),造血部位再次轉(zhuǎn)移到骨腔(即骨髓[BM]),成人造血在此處長(zhǎng)久建立。人們認(rèn)為,***批在骨髓中播種的造血干細(xì)胞在其增殖和分化特性發(fā)生戲劇性變化之前,會(huì)繼續(xù)快速增加數(shù)量,以適應(yīng)高產(chǎn)量分化子代的需要。

歷史上,造血系統(tǒng)的分化過程被描述為一系列中間步驟,由細(xì)胞表面標(biāo)記物(即分化簇[CD])定義。在這個(gè)模型中,造血干細(xì)胞通常表現(xiàn)為造血樹,造血干細(xì)胞產(chǎn)生了越來越多的譜系限制性細(xì)胞類型,**終導(dǎo)致成熟的血細(xì)胞。這種模式在過去的5年里發(fā)生了改變,一些研究報(bào)告了數(shù)千個(gè)單個(gè)造血細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組,這些細(xì)胞被細(xì)胞表面標(biāo)記物隔離,在小鼠模型和成人中。這些報(bào)告表明,以前被認(rèn)為是同質(zhì)的祖先種群,實(shí)際上在轉(zhuǎn)錄水平上是非常異構(gòu)的。 大黃酸導(dǎo)致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。功能機(jī)制研究科研國家自然科學(xué)基金

沉默MIR210HG可以通過miR-337-3p/137-HMGA2軸阻斷TGF-b和Wnt信號(hào)通路

之前的GSEA表明MIR210HG與TGFb/Smad3和Wnt/b-catenin信號(hào)通路相關(guān)。為了進(jìn)一步研究MIR210HG調(diào)控子宮內(nèi)膜*細(xì)胞進(jìn)展的機(jī)制,我們檢測(cè)了MIR210HG、HMGA2、miR-337-3p和miR-137對(duì)TGF-b、Wnt和EMT通路相關(guān)蛋白水平的調(diào)控作用。MIR210HG的下調(diào)降低了TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達(dá)以及b-catenin在細(xì)胞核中的分布(圖6A和6B)。基于這些結(jié)果,我們推測(cè)MIR210HG可能通過靶向miR-3373p/137-HMGA2調(diào)控軸抑制EMT、TGF-b和Wnt信號(hào)通路。干擾HMGA2***降低TGF-bII、p-Smad3和Snail的表達(dá),b-catenin在細(xì)胞核中的分布(圖6C和6D)。我們之前曾報(bào)道過HMGA2在Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞系中調(diào)節(jié)Snail、Slug、N-cadherin、MMP-2和MMP-9的表達(dá)。我們接下來研究了miR-337-3p/137表達(dá)的誘導(dǎo)是否影響TGF-b、Wnt和EMT通路相關(guān)蛋白的水平。 豐度科研國家自然科學(xué)基金英拜有一支高精尖的團(tuán)隊(duì)。

A.29名兒童在進(jìn)行異體造血干細(xì)胞移植前、移植時(shí)、移植后即刻以及后期隨訪時(shí)均進(jìn)行了監(jiān)測(cè)。監(jiān)測(cè)患者的基線特征、臨床結(jié)果、免疫細(xì)胞計(jì)數(shù)以及炎癥和***標(biāo)志物。表S1(附加文件1)詳細(xì)描述了患者特征。宿主免疫系統(tǒng)參數(shù)與腸道、口腔和鼻腔微生物群的縱向動(dòng)力學(xué)相關(guān),這些微生物群在指定的時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行了評(píng)估。

B.每個(gè)身體部位HSCT前、移植時(shí)和移植后的細(xì)菌α多樣性以log10變換后的y軸顯示。星號(hào)表示時(shí)間點(diǎn)間的中值逆Simpson指數(shù)存在***差異。C.相對(duì)于HSCT的時(shí)間點(diǎn)LDA分析。對(duì)于糞便樣本,HSCT后立即采集的樣本LDA評(píng)分為陽性。對(duì)于口腔和鼻腔樣本,在HSCT前和后期隨訪時(shí)間點(diǎn)樣本的LDA評(píng)分均為陽性

由于腸道微生物群在多囊卵巢綜合征的起始和發(fā)展中起著重要作用,作者還研究DHEA和tempol是否影響腸道的氧化還原狀態(tài)。腸道MDA、3-NT和AGEs水平在PCOS大鼠中***高于對(duì)照組和氧化生物標(biāo)記的增加被tempol處理消除(圖3K-M)。此外,tempol***增加PCOS大鼠的腸道SOD1和SOD2表達(dá)(圖3N)。因此,這些結(jié)果表明tempol能夠降低PCOS大鼠的腸道氧化應(yīng)激。

4.Tempol減輕PCOS大鼠腸道微生物失調(diào)

隨后,通過rarefaction和Shannon曲線(Fig.4A-B),以及4個(gè)α-多樣性指數(shù)(ACE)、Shannon、Simpson和Chao1來評(píng)估細(xì)菌群落的豐度和多樣性。當(dāng)序列增加到2000時(shí)多個(gè)樣本稀疏曲線往往是平坦的,這表明測(cè)序數(shù)據(jù)的數(shù)量是合理的(圖4C-F)。在多個(gè)樣本Shannon曲線也觀察到類似的結(jié)果(圖4g),表明大多數(shù)樣本多樣性被測(cè)序覆蓋。有趣的是,rarefaction和Shannon曲線以及4個(gè)α-多樣性指數(shù)的結(jié)果在不同組間沒有差異(圖4A-F),這表明DHEA處理或tempol干預(yù)對(duì)腸道微生物群α-多樣性沒有明顯影響。 英拜的實(shí)驗(yàn)室坐落在上海漕河涇園區(qū)浦江園區(qū)。

接下來為了證明,SUMOylation對(duì)BCas誘導(dǎo)的淋巴內(nèi)皮管的形成和遷移作用,通過其特異性抑制劑阻斷SUMOylation (2D-08)明顯抑制了該誘導(dǎo)過程(Figure 1 G-I)。以上數(shù)據(jù)表明,UBC9異常高表達(dá)與膀胱*進(jìn)展和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移正相關(guān),SUMOylation參與膀胱*的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。

2.EVs介導(dǎo)的ELNAT1過表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)

EVs介導(dǎo)的lncRNA轉(zhuǎn)運(yùn)是**細(xì)胞與TME之間通過信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)發(fā)生的一個(gè)關(guān)鍵過程。作者采集各5例的健康志愿者與BCas患者的尿液,通過NGS測(cè)序確定了EVs中l(wèi)ncRNA的整體表達(dá)譜,結(jié)合與SUMOylation途徑的相關(guān)性,**終篩選出EVs中異常高表達(dá)的lncRNAELNAT1(Figure2A,B)。結(jié)合BCa與LN轉(zhuǎn)移,ELNAT1在BCa與LN轉(zhuǎn)移中高表達(dá)(Figure2C,D),并且ELNAT1過表達(dá)與BCa患者預(yù)后不良相關(guān)(Figure2E,F)。另外,在瘤內(nèi)和瘤旁區(qū)域ELNAT1的表達(dá)與淋巴管密度正相關(guān)(Figure2G,H),提示ELNAT1***參與BCa的淋巴管生成。 大黃酸可以改變腸道菌群組成。代謝組學(xué)科研

血清或尿液中尿酸濃度的升高與痛風(fēng)腎臟和血管疾病密切相關(guān)。功能機(jī)制研究科研國家自然科學(xué)基金

作者進(jìn)行了PAR-CLIP實(shí)驗(yàn),以評(píng)估SLC7A11 mRNA-YTHDC2相互作用是否依賴于m6A甲基化。結(jié)果表明,在H1299細(xì)胞中,通過過表達(dá)METTL3來提高m6A的甲基化水平,促進(jìn)YTHDC2與SLC7A11 mRNA的結(jié)合(圖6D)。無論METTL3是否過表達(dá),YTH結(jié)構(gòu)域的缺失都阻斷了SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用(圖6D)。作者通過SLC7A11 3’-UTR探針進(jìn)行RNA-pull down實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)YTHDC2WT,優(yōu)先結(jié)合于含有m6A的SLC7A11 mRNA的3'UTR,而不是含有未甲基化腺苷的mRNA(圖6E)。此外,YTHDC2傾向于結(jié)合m6A共識(shí)基元GGAC (圖6E)。通過在H1299和H1975細(xì)胞中進(jìn)行METTL3的功能增加和丟失實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)SLC7A11 mRNA-YTHDC2的相互作用是由m6A水平?jīng)Q定的(圖6F和G)。這些數(shù)據(jù)表明YTHDC2優(yōu)先與m6A甲基化的SLC7A11 mRNA結(jié)合。功能機(jī)制研究科研國家自然科學(xué)基金

公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。

3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序

5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)

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