急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學(xué)上的異質(zhì)性疾病,其特征是克隆擴(kuò)增和突變的造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞分化受損。在AML**常見的驅(qū)動突變中,NPM1基因第12外顯子的4堿基對插入是穩(wěn)定的,在20%-30%的病例中發(fā)生。由于其生物學(xué)意義和預(yù)后影響,NPM1突變在世界衛(wèi)生組織(WHO)的髓性白血病分類中**了一個(gè)獨(dú)特的白血病實(shí)體,并在預(yù)后和***決策中發(fā)揮重要作用。NPM1突變通常與誘導(dǎo)和鞏固化療后患者生存的良好影響相關(guān)。在NPM1突變的AML中,F(xiàn)LT3-ITD突變經(jīng)常與DNMT3A突變同時(shí)發(fā)生,這本身與接受標(biāo)準(zhǔn)誘導(dǎo)***的患者預(yù)后更差有關(guān)。大多數(shù)關(guān)于NPM1突變的AML的研究都集中在其他突變的同時(shí)發(fā)生,而突變型NPM1患者基因表達(dá)水平的異質(zhì)性及其生物學(xué)意義尚未得到***研究。這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強(qiáng)。成都胃腸道消化科研
我們已經(jīng)進(jìn)行了snATAC-seq和snRNA-seq來研究染色質(zhì)可及性如何改善我們對成熟人類腎臟中細(xì)胞狀態(tài)和功能的理解。我們生成了一個(gè)包含轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組數(shù)據(jù)的交互式多模態(tài)圖譜(/SingleCell/)。結(jié)合snRNA-seq和snATAC-seq分析提高了檢測近端小管和厚升肢內(nèi)獨(dú)特細(xì)胞狀態(tài)的能力,并重新定義了可能有助于腎臟再生和細(xì)胞特異性離子通透性的細(xì)胞異質(zhì)性。一、人類成年腎臟的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄和染色質(zhì)可及性分析1)成人腎臟中的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄和染色質(zhì)可及性分析snRNA-seq基于譜系特異性標(biāo)記的表達(dá)(圖1c,補(bǔ)充圖1b),鑒定了腎皮質(zhì)內(nèi)所有主要細(xì)胞類型(圖1b,補(bǔ)充圖1a)。檢測了近端小管(PT)、壁上皮細(xì)胞(PEC)、粗升肢(TAL)、遠(yuǎn)端小管(DCT1、DCT2)、連接小管(CNT)、**管(PC、ICA、ICB)、內(nèi)皮細(xì)胞(ENDO)、腎小球細(xì)胞類型(MES、PODO)、成纖維細(xì)胞(FIB)和少量白細(xì)胞(LEUK)(補(bǔ)充表2、補(bǔ)充數(shù)據(jù)1)。值得注意的是,近端小管亞群中VCAM1表達(dá)增加(PT_VCAM1)。該亞群還表達(dá)了HAVCR1,這是一種急性損傷后近端小管上調(diào)的基因,是長期腎臟預(yù)后的預(yù)測因子。 北京蛋白組學(xué)科研上海英拜生物提供可靠可信可參觀的實(shí)驗(yàn)平臺。
miRNA質(zhì)量檢測PCR芯片用于評估通過miScriptIIRTKit(usingmiScriptHiSpecBufferprovidedinthekit)制備的多個(gè)cDNA的質(zhì)量。miScriptmiRNAQCPCR芯片包括96孔、384孔和100孔板。96孔和100孔板可以做8個(gè)cDNA對照樣本,384孔可做32個(gè)cDNA對照樣本使用miScriptmiRNAQCPCR芯片可以檢測使用miScriptIIRTKit制備的cDNA的質(zhì)量,確保只使用***的樣品在后續(xù)實(shí)驗(yàn)中可以節(jié)省時(shí)間和試劑。miScriptmiRNAPCR芯片*用于分子生物學(xué)應(yīng)用。本產(chǎn)品不用于疾病的診斷、預(yù)防和***。
點(diǎn)擊該基因的名稱,將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻(xiàn)中的更多詳細(xì)信息。***,在“詳細(xì)信息”部分中總結(jié)了有關(guān)疾病,細(xì)胞類型和基因的詳細(xì)信息。SC2disease還提供了從基于單細(xì)胞的結(jié)果和基于GWAS的結(jié)果得出的疾病的易感基因。所有GWAS數(shù)據(jù)均從GWAS目錄獲得。以2型糖尿病為例,將通過單擊“可視化”顯示由scRNA-seq和GWAS檢測到的易感基因列表。此外,可通過單擊“可視化”以可視方式顯示結(jié)果。在所得圖中,x軸是從GWAS結(jié)果獲得的基因中SNP的**小P值。y軸是從scRNA-seq結(jié)果獲得的疾病的重疊敏感性基因的細(xì)胞類型。條的顏色顯示基因表達(dá)的log 2倍變化。上海英拜生物的動物建模實(shí)驗(yàn)。
RIG-I對circNDUFB2誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)至關(guān)重要
RIG-I樣受體(RLR)家族可識別病毒RNA 會通過產(chǎn)生IFN和促炎性細(xì)胞因子來觸發(fā)針對病毒***的先天免疫反應(yīng)。已經(jīng)報(bào)道外源circRNA有效刺激由RIG-1介導(dǎo)的免疫信號傳導(dǎo)。從qRT-PCR分析獲得的數(shù)據(jù)表明,RIG-1敲低消除了circNDUFB2過表達(dá)誘導(dǎo)的免疫反應(yīng),RIG-1被circNDUFB2上調(diào)。為了研究circNDUFB2和RIG-I之間的關(guān)聯(lián),進(jìn)行RIP分析和RNA FISH免疫熒光實(shí)驗(yàn)。 結(jié)果表明circNDUFB2與RIG-1結(jié)合,并且它們共定位在細(xì)胞質(zhì)中。 circNDUFB2過表達(dá)后, circNDUFB2顯著上調(diào)了RIG-1,IRF7,IFNβ和TNF的蛋白水平,而circNDUFB2則不影響P65和IRF3的蛋白水平。 英拜跟客戶形成產(chǎn)學(xué)研合作模式。浙江細(xì)胞周期科研
上海英拜生物有經(jīng)驗(yàn)豐富的科研團(tuán)隊(duì)。成都胃腸道消化科研
這些基因的體細(xì)胞突變狀態(tài)如圖所示。平均突變頻率比較高的基因是TP53(31.4%)、PTEN(5.7%)、NOTCH1(3.6%)、CTNNB1(3.6%)、XIST(3.4%)和MALAT1(3.4%)。還觀察到在子宮內(nèi)膜體*(UCEC)中有相對較高的突變頻率(7.6%)。
在泛*中構(gòu)建 m6A 亞型和特征
我們使用K-means算法分別將患者分為不同的m6A亞型。Elbow法確定了三種亞型。對數(shù)秩檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在排除死亡比例的**后,27種**中有24種**的定義亞型與總生存率***相關(guān)?<?10%。具體來說,我們定義了按中位生存時(shí)間(MST)排序的聚類。MST**長的組定義為第1組,MST**短的組定義為第3組,中間組定義為第2組。與第1組相比,第2組和第3組在27種**中有22種的生存率***降低。此外,當(dāng)臨床結(jié)果為無進(jìn)展間期(PFI)時(shí),分類在大多數(shù)**類型中仍然***(16/26)或疾病特異性生存率(DSS)(18/26)。在總體人群的KM生存率分析中,m6A亞型在調(diào)整**類型后可***分層患者的生存率。四個(gè)體細(xì)胞突變在不同m6A亞型中的分布有***性差異,包括TP53、NOTCH1、CTNNB1和PTEN。 成都胃腸道消化科研
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺,提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)