奧沙利鉑耐藥是結直腸*(CRC)患者***中的一個挑戰。調節性T細胞(Treg)以其免疫抑制作用而聞名,靶向Treg是提高化療敏感性的有效途徑。Treg是一種提高化學敏感性的有效方法。外泌體遞送的miRNA被用作預測化療敏感性的潛在生物標志物。然而,Treg和外泌體miRNAs之間的關系仍然很大程度上是未知的。本研究結果表明,**分泌的miR-208b通過靶向PDCD4促進Treg擴增,這可能與CRC中奧沙利鉑化療敏感性的降低有關本。這些發現突出了外泌體miR-208b作為奧沙利鉑***反應的預測生物標志物的潛在作用,并且它們是免疫***的新靶點。本研究于2021年4月發表于《Molecular Therapy》IF: 8.986期刊上。英拜專注高通量測序行業的整體服務。深圳同源異形盒科研
3、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化
為了探索miR-934促進CRLM的分子和細胞基礎,通過Cytoscape軟件注釋了TCGAcohort中191個miR-934相關基因的細胞功能,發現miR-934***參與多種炎癥反應,提示miR-934可能參與了CRC免疫微環境(Fig.3a)。然后發現miR-934與巨噬細胞的基因信號特異性相關(Fig.3b)。為了研究在CRLM中TAM的浸潤與miR-934之間的相關性,我們在原發性結直腸*組織和CRLM組織樣本中采用免疫組化染色檢測TAM標記CD163。如圖3c所示,在CRLM組織中CD163+TAM浸潤豐富的區域觀察到miR-934表達升高。將THP-1細胞與PMA孵育,誘導分化為M0巨噬細胞,M0巨噬細胞具有適當的貼壁形態和巨噬細胞標志物CD68的高表達(Fig.3d)。接下來,研究了CRC細胞來源的外泌體對巨噬細胞M2極化的影響。如Fig.3e所示,當與巨噬細胞共培養時,標記有DiO(綠色)的CRC細胞來源的外泌體被未染色的巨噬細胞內化。相比于低表達miR-934的細胞的外泌體孵育的巨噬細胞或PBS孵育的細胞,M2標記物(CD206,arginase-1,IL10和CD163)的表達在高表達miR-934的CRC細胞的外泌體孵育的巨噬細胞中***增加,而M1標記物(iNOS和IL-1β)幾乎無差異(Fig.3f,g)。 深圳運動誘發定位科研上海英拜生物設有專業的武漢技術中心。
細胞周期蛋白依賴性激酶4和6(CDK4/6)的藥理學抑制劑是***受體陽性乳腺*的獲批***藥物,目前正在其他**類型的數百項臨床試驗中進行評價。這些抑制劑的臨床成功在很大程度上歸因于定義明確的**內在細胞抑制機制,而其作為免疫調節劑的新作用知之甚少。本研究利用整合的表觀基因組、轉錄組學和蛋白質組學分析,證明了CDK4/6抑制劑在促進免疫T細胞記憶的表型和功能獲得中的新作用。本文的機制見解拓寬了CDK4/6抑制劑作為增強抗**T細胞免疫的臨床工具的前瞻性效用。本研究于2021年5月14日發表在《Cancer Discovery》IF:29.497期刊上。
8.過表達Caspase-11加重MCD誘導的小鼠肝脂肪變性
由于缺乏Caspase-11減弱MCD誘導的肝脂肪變性,我們檢測肝臟中Caspase-11過表達對MCD誘導的肝脂肪變性的影響。我們在Alb-Cre小鼠肝細胞中過表達Caspase-11(圖8A)。正常情況下,對照組和過表達Caspase11的小鼠肝臟組織學形態正常。MCD處理導致對照和過表達Caspase11的小鼠肝臟出現明顯的脂質積聚(空泡)。此外,過表達caspase-11的小鼠肝臟中的空泡比對照小鼠肝臟中的大且多(圖8B)。相應的,與MCD處理的對照組相比,過表達Caspase-11的小鼠脂肪變性評分(圖8C)和膨脹評分(圖8D)***升高。 英拜提供生命科學內的一體化服務。
以上數據提示,miR-934異常高表達與結直腸***進展及肝轉移***相關。生存分析顯示,與miR-934表達較低的患者相比,miR-934表達較高的患者總生存期(OS)和無病生存期(DFS)較低(Fig.1f,g)。因此,在CRLM患者中,miR-934高表達與CRLM進展和預后不良呈正相關。
2、miR-934存在于CRC細胞衍生的外泌體中
miR-934在HCT-8和LoVo的CM中的表達***高于其它細胞(Fig.2a)。隨后,研究發現HCT-8和LoVo的CM中miR-934的表達***高于細胞核和細胞質(Fig.2b,c)。并且,miR-934在CM中的表達不隨RNaseA的處理而改變,而隨RNaseA+TritonX-100的處理***下降(Fig.2d),這表明細胞外的miR-934被膜包裹,而不是直接分泌。因此,推測miR-934可能是被外泌體傳輸。電鏡和納米顆粒追蹤分析表明,miR-934表達水平較高的CRC細胞分泌的外泌體比miR-934表達水平較低的CRC細胞分泌的外泌體更多(Fig.2e,f)。各組外泌體標志物CD9,ALIX,TSG101均被WB檢測到(Fig.2g)。 英拜的實驗室坐落在上海漕河涇園區浦江園區。上海NF-KB科研
大黃酸能緩解D。SS誘導的小鼠慢性結腸炎。深圳同源異形盒科研
二、胎兒造血過程中分化軌跡的推斷
接下來,研究者使用力導向圖繪制算法推斷了人類胚胎發育期間造血細胞的分化軌跡。結果顯示HSCs/MPPs位于軌跡頂端,并且在HSCs/MPPs下游,研究者鑒定了三個高度增殖的寡能祖細胞群,即MEMPs(紅系細胞、MKs和肥大細胞);GPs(粒細胞);LMPs(淋巴樣細胞、單核細胞和樹突狀細胞)(圖2A和2B)。并使用Scanpy的paga_path函數顯示了沿三條分化途徑(MEMPs、GPs和LMPs)的譜系特異性基因動態表達(圖2C)。MEMPs將hsc / mpp與MKs、紅細胞和肥大細胞連接起來。與此一致的是,HSC/MPP向MEMPs轉化的差異調控基因包括MK/紅系/肥大細胞譜系特異性基因,如GATA1、ITGA2B、PLEK、KLF1、HDC和MS4A3(圖2C)。 深圳同源異形盒科研
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗