蛋白質生物標志物
MarkerDB中142個蛋白質生物標志物覆蓋了160多種疾病。MarkerDB中的所有蛋白質生物標記物數據都是從OncoMX、CBD和UPBD原始文獻中提取的，結構數據從蛋白質數據庫PDB收集。目前，MarkerDB中的所有蛋白質標記都有一個或多個疾病關聯，以及MarkerDB ID、序列、結構、詳細的蛋白質描述、蛋白質名稱/同義詞、蛋白質理化數據、疾病濃度、正常濃度、性別、年齡范圍，生物流體、一個或多個文獻參考和其他在線數據庫的外部超鏈接。 英拜提供一年三節的購物卡津貼。上海股骨損傷FD科研
**近的研究表明INPP4B可能在與化療耐藥性相關的急性髓系白血病(AML)中起致*作用，以及在黑素瘤和結腸*中起致*作用。而且可能與環境有關。例如，在乳腺*中，SGK3被擴增，它的激酶活性依賴于致*的PI3K和INPP4B。**近，INPP4B被確定為與ER+乳腺*和**分級相關的前列基因。
2021年5月，在Naturecommunications雜志上發表了文章“INPP4BpromotesPI3Kα-dependentlateendosomeformationandWnt/β-cateninsignalinginbreastcancer”。此報道探討了INPP4B在ER+乳腺*中的作用，揭示了一組pik3c突變ER+乳腺*表現出INPP4B表達增加。盡管同時抑制AKT信號，但過表達INPP4B可以促進pik3a突變ER+乳腺*細胞系的增殖和**生長。為了研究這一明顯的悖論，使用了蛋白質組學、轉錄組學和先進的細胞成像的綜合方法來闡明INPP4B促進pik3a突變ER+乳腺*發生的分子機制。結果顯示INPP4B刺激晚期核內體上pi3kα依賴的信號樞紐，指導Wnt/β-catenin的***。這些研究揭示了促進細胞增殖和**生長的兩種致*信號通路之間的串擾機制。 微生物科研服務兩年Caspase-11介導的肝細胞焦亡促進非酒精性脂肪性肝炎的進展。
目前，PROTAC-DB包括1662個PROTAC，202個彈頭（靶向目標蛋白質的小分子），65個E3配體（能夠募集E3連接酶的小分子）和806個接頭，以及它們的化學結構，生物學活性和理化性質。除了彈頭和E3配體的生物活性外，PROTAC-DB還提供PROTAC的降解能力，結合親和力和細胞活性。
數據庫的查詢和瀏覽為了方便對PROTAC-DB中的數據進行檢索，作者提供了檢索和瀏覽工具。在檢索工具上，PROTAC-DB可以進行基于文本的檢索和基于結構的檢索。基于文本的搜索是在整個PROTAC-DB中進行搜索的一種簡單方式，只需輸入單個術語，如目標名稱、化合物名稱或ID。對于基于結構的搜索，用戶可以在ChemDoodle編輯器中輸入SMILES字符串、上傳MO***F文件或繪制分子草圖。導入自編輯的分子后，可以從三個搜索選項(similarity、substructure或exact)中選擇一個。在相似性搜索中，利用類FCFP指紋中的位向量Morgan指紋來計算兩個分子之間的Tanimoto相似度。可以選擇數據集(PROTAC、彈頭、E3配體或Linker)進行搜索。
在野生型小鼠和Caspase-11缺陷小鼠中，MCD處理***降低了pro-caspase1的蛋白水平(圖5A和F)，而增加了活性Caspase-1的蛋白水平(圖5A和G)。此外，Caspase-11缺陷小鼠的活性caspase-1水平明顯低于野生型小鼠，說明MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟中Caspase-1的***較少。同樣，我們在MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的肝細胞中檢測到較少的Gsdmd-N表達(圖5H和I)。這些結果表明，Caspase-11缺失減弱了MCD誘導的Gsdmd和IL-1β的***。
6.Caspase-11缺乏抑制脂多糖誘導的肝細胞焦亡和體外損傷
我們在體外評價Caspase-11缺乏對肝細胞焦亡的影響。我們用脂多糖(LPS)處理野生型小鼠原代肝細胞，發現LPS誘導了pro-caspase-11和caspase-11的表達(圖6A和B)，表明LPS誘導了原代肝細胞中caspase-11的***。我們進一步處理來自野生型和Caspase-11缺陷小鼠的原代肝細胞，并監測Gsdmd的表達和***。如圖6C和D所示，LPS處理未在野生型和Caspase-11缺陷的原代肝細胞中誘導pro-Gsdmd的表達。 METTL14是其***的潛在靶點。
使用測量細胞一致性的活細胞成像作為細胞生長和擴散的代理，來測試SMARCA4消耗的影響是否轉化為VCaP細胞生長的改變。如圖5所示，在沒有雄***的情況下，SMARCA4刪除并不影響細胞的生長，而在有雄***的情況下，它降低了細胞的相對融合，盡管程度低于去除AR。SMARCA4刪除同樣會降低LNCaP細胞的相對融合。
四、SIM2沉默改變了arb亞群的染色質可及性
SIM2沉默降低了2434個arb染色質可及性，三分之二受siSIM2影響的arb在雄***暴露前可及(圖6a c中可獲得)，而其余在雄***暴露后可及(圖6a c中重新獲得)。根據ChIP-SICAP數據，siim2受影響的位點中**富集的motif是ARE，盡管其在這些位點的富集程度低于未受siim2影響的位點(NC位點，圖6d）。AR、FOXA1、ERG和HOXB13在sisim2影響的位點的標簽密度與NC位點相比均呈上升趨勢(圖6e)，表明SIM2是一種與AR協同的TF。 巨噬細胞表型協調急性胰腺炎損傷后的炎癥和修復再生。上海代謝組學科研
嘌呤在細胞中執行許多重要的功能。上海股骨損傷FD科研
5）MAPK1-109aa對胃*有抑制作用
為了進一步研究MAPK1-109aa的生物學功能，我們將circMAPK1ATG突變質粒、circMAPK1IRES突變質粒和circMAPK1過表達質粒轉染到MKN45和BGC823細胞中。如預期的那樣，當轉染ATG突變質粒和IRES突變質粒時，沒有出現circMAPK1編碼的MAPK1-109aa13-kDa帶(圖5a)。CCK8實驗(圖5b)、集落形成實驗(圖5c，d)和EdU實驗(圖5e，f)顯示過表達circMAPK1明顯抑制了細胞的增殖能力。流式細胞術顯示，處于S期的GC細胞數量也明顯減少(圖5g)。然而，當circMAPK1的ATG或IRES序列發生突變時，MKN45和BGC823細胞的增殖能力沒有明顯變化。 上海股骨損傷FD科研
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗