單細胞轉錄組學 (scRNA-Seq) 模塊
scRNA-seq 模塊系統地組織了基因表達隨年齡增長的組織和細胞類型特異性異質變化。該模塊提供不同細胞類型或亞型的高分辨率、綜合參考圖，以及它們的時空分布信息，以及在不同衰老相關或疾病條件下每種細胞類型或亞型的基因表達模式。該模塊目前包括來自大鼠、猴子和人類的 14 種衰老組織的單細胞 RNA 測序數據集。這些數據包括從單細胞轉錄組學圖譜中的多個哺乳動物組織中提取的細胞類型注釋和細胞類型特異性 DEG，用于衰老和熱量限制 (CR)。該模塊還包含單細胞轉錄組數據，涵蓋非人類靈長類動物的卵巢、胰島、主動脈、視網膜和心肺衰老，以及老年 COVID-19 患者中人類循環免疫細胞的單細胞轉錄組學景觀。 circNDUFB2觸發NSCLC細胞的免疫防御反應。大連細胞功能標書
野生型小鼠和Caspase11缺陷小鼠肝臟中pro-caspase-1(圖5A和F)和cleavedcaspase-1(圖5A和G)的蛋白水平相似。在野生型小鼠和Caspase-11缺陷小鼠中，MCD處理***降低了pro-caspase1的蛋白水平(圖5A和F)，而增加了活性Caspase-1的蛋白水平(圖5A和G)。此外，Caspase-11缺陷小鼠的活性caspase-1水平明顯低于野生型小鼠，說明MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟中Caspase-1的***較少。同樣，我們在MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的肝細胞中檢測到較少的Gsdmd-N表達(圖5H和I)。這些結果表明，Caspase-11缺失減弱了MCD誘導的Gsdmd和IL-1β的***。
6.Caspase-11缺乏抑制脂多糖誘導的肝細胞焦亡和體外損
傷我們在體外評價Caspase-11缺乏對肝細胞焦亡的影響。我們用脂多糖(LPS)處理野生型小鼠原代肝細胞，發現LPS誘導了pro-caspase-11和caspase-11的表達(圖6A和B)，表明LPS誘導了原代肝細胞中caspase-11的***。我們進一步處理來自野生型和Caspase-11缺陷小鼠的原代肝細胞，并監測Gsdmd的表達和***。如圖6C和D所示，LPS處理未在野生型和Caspase-11缺陷的原代肝細胞中誘導pro-Gsdmd的表達。我們檢測到LPS處理的野生型小鼠原代肝細胞中Gsdmd-N明顯增加。
褪黑素標書國家自然科學基金短鏈脂肪酸與運動恢復/腸屏障通透性的相關性。
為了研究鑒定出的lncRNAs是否下調了PGK1的表達，我們分別用這三個lncRNAs分別轉染了乳腺*細胞。我們的結果表明，在mRNA水平不變的情況下，只有LINC00926導致MCF-7和MDA-MB-231細胞中PGK1蛋白水平***下降(圖1E)，表明LINC00926下調了乳腺*細胞中PGK1的表達。此外，與非**組相比，13/14(92.9%)例乳腺*患者的LINC00926表達降低，12/14(85.7%)例乳腺*患者的PGK1表達上調。在乳腺*樣本中，LINC00926的表達與PGK1的表達呈負相關(圖1 F)。有趣的是，我們發現內源性PGK1蛋白水平和LINC00926水平在5種乳腺*細胞系(MCF-7、T47D、ZR75-1、MDA-MB-453、MDA-MB-231)中均呈負表達。在相對轉移性細胞系MDA-MB-231中PGK1表達量比較高，LINC00926表達量比較低；而惡性程度較低的細胞系MCF-7中PGK1表達量較低，LINC00926表達量較高(圖1G)。敲除LINC00926后，MCF-7細胞中PGK1的表達***增加，而過表達LINC00926后，MDA-MB-231細胞中PGK1的表達***降低(圖1H)。這些結果表明，LINC00926下調PGK1的表達，可能與PGK1介導的乳腺*發展呈負相
5）缺氧主要通過FOXO3A轉錄抑制LINC00926的表達，***PGK1的表達
由于缺氧是**的一個關鍵現象，我們確定了LINC00926/PGK1軸是否在缺氧下糖酵解的調節中發揮作用。缺氧刺激了PGK1在mRNA和蛋白水平上的表達，并降低了LINC00926的表達(圖5A)。為了確定缺氧如何抑制乳腺*細胞中LINC00926的表達，我們研究了缺氧后對LINC00926啟動子的抑制。對不同的LINC00926啟動子缺失報告基因的分析顯示，啟動子區域在300-200bp之間包含一個缺氧抑制元件(圖5B)。該區域假定的FOXO3A結合位點的突變會導致抑制的喪失。在常氧或缺氧條件下，FOXO3A影響LINC00926和PGK1的表達，說明FOXO3A是LINC00926調控的特異性轉錄因子(圖5C和5D)。ChIP分析表明，在常氧條件下，FOXO3A被募集到LINC00926啟動子內包含FOXO3A結合位點的區域，但沒有被募集到LINC00926啟動子上游的區域，在缺氧條件下募集減少(圖5E)。FOXO3A提高了LINC00926水平，降低了PGK1水平，而且重要的是，在正常或缺氧條件下，下調LINC00926均嚴重損害了FOXO3A調節LINC00926和PGK1表達的能力(圖5F)。此外，敲除LINC00926還**削弱了缺氧對PGK1上調的影響。這些數據表明，缺氧主要通過FOXO3A轉錄抑制LINC00926的表達，***PGK1的表達。 注射circSDHC敲低*細胞的小鼠比對照組表現出更少的惡病質.
三、在體內，tbi介導的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制
為了確定TBI是否會損害體內的核質運輸，我們在果蠅運動神經元中過表達了一個帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達nlsnes -GFP的大腦中，GFP信號分布在細胞核和細胞質中(圖3A)。然而，定量分析顯示，在nls - nes -GFP表達的vnc暴露于TBI中，核GFP信號減少的細胞百分比***增加，而核GFP強度***降低(圖3B和C)，說明GFP核進口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來，我們在運動神經元中表達了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標記的沒有核輸出活性的GFP蛋白。表達NLS的非創傷性腦損傷動物的腦細胞-ΔNES-GFP顯示了GFP在細胞核的強大定位(圖3A)，而創傷性腦損傷動物的vnc顯示了核GFP減少的細胞數量***增加，核GFP強度降低((圖3B和C)。果蠅幼蟲暴露于TBI，并在DMSO單獨、KPT-350(0.05、0.1或0.5 mM)或KPT-276(50、200或1000 nM)上飼養。對經歷過TBI的果蠅幼蟲的羽化試驗顯示，KPT-350處理的動物(圖3D)或KPT-276處理的動物(圖3E)具有***的劑量依賴性的致死抑制。kpt -350處理的果蠅核GFP信號***高于dmso處理的對照組(圖3G）。 circSDHC通過充當miR-127-3p的海綿促進ccRCC的進展和轉移.TRF標書北京
DHEA和tempol處理可影響腸道微生物的β-多樣性。大連細胞功能標書
氧化應激與阿爾茨海默病(AD)的發病機制有關。線粒體功能障礙與AD期間神經毒性中的氧化應激和活性氧(ROS)有關。線粒體代謝受損與AD腦損傷中的線粒體功能障礙有關。雖然已確定NOX4在腦損傷中的作用，但NOX4調控AD中星形膠質細胞鐵死亡的機制尚不清楚。因此，小編給大家介紹于2021年3月發表于影響因子為9.986的“Redox Biology”上的文章“NOX4 promotes ferroptosis of astrocytes by oxidative stress-induced lipid peroxidation via the impairment of mitochondrial metabolism in Alzheimer’s diseases”。我們的結果表明，NOX4通過脂質過氧化損傷AD中線粒體代謝，促進星形膠質細胞的鐵死亡。大連細胞功能標書
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7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗