2021年,來自加拿大多倫多大學(xué)和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學(xué)等團(tuán)隊合作在Nature communication雜志上發(fā)表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質(zhì)性。基于rna-seq的基因表達(dá)譜分析,確定了兩種新亞型,稱為原始型和committed型。基于基因表達(dá)、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異,在**的AML隊列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態(tài)和患者生存聯(lián)系起來。此外,表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。表達(dá)PTEN- 398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點的***有關(guān)。肥胖因子
褪黑素可挽救TBI后皮層的鐵蓄積和神經(jīng)元損傷
為了進(jìn)一步研究褪黑素在TBI后鐵蓄積和神經(jīng)元損傷中的假定作用,在TBI后第3天,在受傷的皮層中觀察到了Fe2 +,F(xiàn)e3+,總鐵含量顯著增加。而褪黑素或Lip-1抑制TBI誘導(dǎo)的血清和同側(cè)皮層中鐵含量的上調(diào)的。Perls的藍(lán)色染色表明,TBI后第7天鐵陽性細(xì)胞的數(shù)量顯著增加,褪黑素或Lip-1***組的鐵陽性細(xì)胞少于對照組。鑒于TBI誘導(dǎo)的鐵超載伴隨著Fth表達(dá)的上調(diào),使用免疫熒光染色觀察了TBI后神經(jīng)元中Fth的表達(dá)。發(fā)現(xiàn)與假手術(shù)組相比,模型組中Fth陽性神經(jīng)元的***增加,而褪黑素和Lip-1處理顯著降低了Fth陽性神經(jīng)元。與假手術(shù)組相比,受傷的神經(jīng)元的細(xì)胞體在TBI后7天出現(xiàn)胞質(zhì)萎縮或核固縮。褪黑素和Lip-1處理可減輕這些組織病理學(xué)變化。TBI后第7天, FJB染色測定腦部神經(jīng)元變性,發(fā)現(xiàn)TBI導(dǎo)致大腦皮層變性神經(jīng)元的數(shù)量增加,但是褪黑素和Lip-1給藥明顯減少了變性神經(jīng)元的數(shù)量。這些數(shù)據(jù)表明褪黑素可防止TBI誘導(dǎo)的鐵蓄積并防止同側(cè)皮質(zhì)的神經(jīng)元損傷。 激酶和磷酸酶拷貝數(shù)阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配
在FENDRR/PITX2陽性對照組中也有類似的發(fā)現(xiàn)(Figure5G,H)。FRET技術(shù)分析顯示,與ELNAT1/UBC9TTS1組相比,熒光強度發(fā)生了巨大的變化:從520nm到570–580nm,熒光強度控制單鏈RNA/UBC9ssRNA/UBC9TTS1集團(tuán),這與FENDRR/PITX2陽性對照組類似(Figure5I,J)。
此外,ChIP分析顯示,過表達(dá)ELNAT1增加了hnRNPA1和組蛋白甲基化(H3K4me3)在UBC9啟動子上的富集,而通過刪除hnRNPA1的ELNAT1結(jié)合位點則抑制了富集(Figure5K,L)。同時,ELNAT1沉默***降低了UM-UC-3和T24細(xì)胞UBC9啟動子的hnRNPA1占用率和H3K4me3甲基化(Figure5M,N),這證明了hnRNPA1通過調(diào)節(jié)UBC9啟動子上的組蛋白甲基化,促進(jìn)ELNAT1誘導(dǎo)UBC9的轉(zhuǎn)錄***。以上結(jié)果說明,ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯(lián)體,通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾。
接下來,我們合成了野生型HuR蛋白(WT)和HuR蛋白的截短突變體(即分別為單獨HuR的RNA識別基序(RRM)1的突變體B1、單獨HuRRRM2的突變體B2和單獨HuRRRM3的突變體B3)(圖4C)。同時,我們設(shè)計并合成了生物素標(biāo)記的或未標(biāo)記的探針,分別特異性靶向lnc-PMIF的中心-莖環(huán)和生物素標(biāo)記的或未標(biāo)記的探針,特異性靶向之前報道的與HuR蛋白相互作用的β-actinmRNA的序列。RNA電泳遷移率變動分析(EMSA)發(fā)現(xiàn)只有當(dāng)生物素標(biāo)記的lnc-PMIF探針與WTHuR或截短突變體B3共孵育時,才能檢測到lnc-PMIF-HuR復(fù)合物,這表明HuR的RRM3可介導(dǎo)HuR和lnc-PMIF之間的相互作用。lnc-PMIF與β-actinmRNA競爭與HuR相互作用。過表達(dá)HuR-RRM3后細(xì)胞中β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)下降***上調(diào),遷移活性增強。所有這些表明lnc-PMIF可與HuR的RRM3結(jié)合,中斷HuR-β-actin的相互作用,抑制β-actin的表達(dá),抑制OPC的遷移。zVAD預(yù)處理也略微增加了IR后PTEN-398A細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量。
類似的,外泌體抑制劑GW4869處理導(dǎo)致共培養(yǎng)的巨噬細(xì)胞中miR-138-5p的水平***下降,而KDM6B的水平***上升(圖1D-E)。乳腺*細(xì)胞外泌體增加TPH-1細(xì)胞中miR-138-5p的表達(dá)但抑制KDM6B的表達(dá),但這種作用被miR-138-5p抑制劑處理廢除(圖3F-G)。轉(zhuǎn)染miR-138-5p mimic的乳腺*細(xì)胞增加了外泌體miR-138-5p的水平(圖3H)。過表達(dá)miR-138-5p的乳腺*細(xì)胞外泌體增加了miR-138-5p水平,抑制了THP-1細(xì)胞中KDM6B的表達(dá)(圖3I-J)。總之,這些結(jié)果表明,*細(xì)胞分泌的外泌體miR-138-5p被傳遞到巨噬細(xì)胞中,并抑制KDM6B。阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細(xì)胞再分配。表觀遺傳
小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細(xì)胞分離的外泌體呈現(xiàn)典型的外泌體結(jié)構(gòu)。肥胖因子
5)SsD可***抑制AML在體內(nèi)的進(jìn)展
為了研究SsD在體內(nèi)對白血病的***效果,我們建立了C1498和FLT3+白血病小鼠模型(圖5A)。對照組小鼠的白細(xì)胞生長較快。0.1mg/kg或0.5mg/kg劑量的SsD***抑制WBC生長(圖5B)。與對WBC的抑制作用一致,SsD也有效地?fù)p害了骨髓(BM)克隆原性潛能(圖5C和5D)。此外,與對照組相比,接受SsD***組的小鼠的脾臟更輕,表明SsD處理***逆轉(zhuǎn)了脾腫大,抑制了脾臟轉(zhuǎn)移性**細(xì)胞(圖5C和5E)。與病理表型一致,SsD處理小鼠的生存時間也明顯延長(圖5F)。機制上,SsD在體內(nèi)的抗白血病作用是通過其m6ARNA甲基化活性介導(dǎo)的(圖5G);因為SsD處理小鼠的BM增加了m6ARNA甲基化,從而調(diào)節(jié)靶基因(圖5H)。 肥胖因子
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗