4）CircMAPK1編碼109個氨基酸的新蛋白MAPK1-109aa
根據在線數據庫circRNADb的預測結果，circMAPK1序列中包含一個開放閱讀框，起始密碼子為ATG，IRES位于274-327nt。這一觀察結果表明circMAPK1具有編碼109aa蛋白的潛能，本研究將其命名為MAPK1-109aa(圖4a)。為了驗證預測的IRES在circMAPK1中的活性，我們進行了雙熒光素酶檢測，結果顯示野生型IRES報告基因的熒光素酶活性明顯高于突變型IRES報告基因的熒光素酶活性(圖4b)。為了進一步證實MAPK1-109aa的存在，我們將circMAPK1IRES突變質粒和circMAPK1過表達質粒轉入HEK293T細胞。銀染色結果顯示，在分子量為13kDa時存在明顯的蛋白帶，與MAPK-109aa的預測大小一致。MS檢測到AMEIMLNSKLCL序列，與MAPK1-109aa含有特定C端序列LCL的氨基酸序列一致(圖4c)。 為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機制。凋亡芯片科研國家自然科學基金
NRF2是阻斷鐵死亡的關鍵介質，TYRO3過表達的293T細胞中NRF2轉錄活性增加。TAM激酶下游的PI3K/AKT信號通路可增加NRF2轉錄活性，TYRO3-OE介導的NRF2轉錄***被AKT抑制劑MK2206消除。這些結果表明TYRO3通過AKT/NRF2軸抑制鐵死亡。吞噬細胞對瀕死細胞的***依賴于對凋亡細胞暴露的“吃我信號”的識別。磷脂酰絲氨酸(PS)是一種關鍵的“吃我”分子，可與橋接分子結合，如TAM激酶配體蛋白S(Pros1)和Gas6。Pros1在與PS結合時同時***TYRO3。Pros1處理4T1和PY8119**細胞可抑制erastin誘導的脂質過氧化作用，表明凋亡細胞的Pros1“吃我”信號可以通過TYRO3抑制**細胞鐵死亡。武漢斷鏈脂肪酸科研英拜生物您隨身的科研小助手。
巨噬細胞中 PI3K-AKT ***促進 ADM 期后炎癥消退
基于 RNA-seq 數據，PI3K-AKT 信號在 ADM 期間在巨噬細胞中顯著富集。當觀察PI3K-AKT 通路中這些升高的基因時，發現80%的基因與細胞外基質 (ECM)-受體相互作用、生長因子/細胞因子-受體相互作用有關，表明它們參與了巨噬細胞與相鄰細胞之間的串擾。同時，在第 3 天在 CD11b + F4/80 + CD206 +胰腺巨噬細胞中觀察到更高的 AKT ***。在ADM 階段抑制巨噬細胞的 PI3K-AKT ***時，胰腺修復/再生明顯受到阻礙。通過流式細胞術分析，我們發現胰腺中 M2 樣巨噬細胞（CD11b + F4/80 + CD206 +）的數量變化較小，而未成熟巨噬細胞（CD11b + F4/80 mid）、炎性單核細胞（CD11b + Ly6C hi ) 和中性粒細胞 (CD11b + Ly6G + ) 顯著升高。總之，阻斷胰腺巨噬細胞中的 PI3K-AKT 信號將觸發促炎反應和組織損傷，表明這些巨噬細胞在 ADM 階段（第 3 天）具有***或促消退表型。
1.肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11表達上調和***
為了探討Caspase-11在肝脂肪變性中的作用，我們首先檢測了肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11的表達。如圖1A所示，與正常小鼠相比，MCD誘導的肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11mRNA明顯增加。相應的，在MCD誘導的肝脂肪變性小鼠的肝臟中，pro-caspase-11(圖1B和C)和cleaved-caspase-11(圖1B和D)的蛋白水平均***上調。這些結果提示Caspase-11與肝臟脂肪變性呈正相關。
2.Caspase-11缺乏減弱MCD誘導的小鼠肝脂肪變性
為了評估Caspase-11對肝脂肪變性的潛在影響，我們在Caspase-11缺陷小鼠中誘導肝脂肪變性并監測表型。正常野生型和Caspase-11缺陷小鼠肝臟組織學表現正常。野生型小鼠經MCD***后，肝臟出現明顯的脂肪變性和腫脹。與MCD處理的野生型小鼠相比，MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的脂肪變性和腫脹明顯減少(圖2A)。相應的，與MCD處理的野生型小鼠相比，MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟脂肪變性評分(圖2B)和膨脹評分(圖2C)***降低。
增加乳酸桿菌水平導致尿酸水平下降。
我們發現，在circMAPK1穩定下調的SGC7901和MGC803細胞中，與對照組相比，MAPK1-109aa與MEK1的結合明顯減少，而MAPK1與MEK1的結合增加(圖7f)。在MKN45和BGC823細胞中，IRES突變時MAPK1-109aa不翻譯。因此，MAPK1與MEK1的結合沒有明顯變化。然而，過表達circMAPK1后，MAPK1與MEK1的結合***減少，而MAPK1-109aa與MEK1的結合***增加(圖7g)。因此，以上結果表明MAPK1-109aa與MAPK1競爭結合MEK1。隨后的Western blot結果也證實，在過表達circMAPK1的細胞系中，MAPK1-109aa***升高，磷酸化的MAPK1/2降低，而在circMAPK1敲低的細胞中則相反(圖7h)。此外，MAPK1的下游效應因子，如p-ELK1、p-c-Fos、p-c-JUN和p-RSK，也被過表達的circMAPK1***抑制(圖7i)。這些結果表明，circMAPK1編碼的MAPK1-109aa通過抑制MAPK1信號通路發揮抑*作用。大黃酸能緩解D。SS誘導的小鼠慢性結腸炎。成都甲基化芯片科研
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質膜塑造并保護真核細胞免受周圍環境的影響，對細胞生命至關重要。盡管重新密封受損膜的初始修復機制已經很好地建立，但關于細胞如何在重建受損膜后恢復體內平衡知之甚少。今年7月發表于《SCIENCE ADVANCES》的一篇研究表明，細胞通過***與巨胞飲作用相關的蛋白質來響應質膜損傷，特別是在受損的膜上。在膜重新密封之后，細胞形成源自修復部位的、LC3B蛋白陽性的胞吞小體。此過程**于 ULK1、ATG13 和 WIPI2，但依賴于 ATG7、p62 和 Rubicon。內化的胞吞小體在細胞質中收縮，可能是通過滲透排出，并**終與溶酶體融合。這是一種與非經典自噬相結合的巨胞飲作用，研究者將其稱為 LC3 相關巨胞飲作用 (LAM)，其功能是從質膜上去除受損物質并在損傷時恢復膜的完整性。接下來我們來看一下具體研究方法及結果：凋亡芯片科研國家自然科學基金
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