然后利用SCENIC通過分化軌跡識別出HSPCs和成熟血細胞中162個調節子，其中HLF和HOXA9是HSCs/MPPs中的主要調節子，且HSC/MPPs簇在轉錄上為高度未成熟的細胞群(圖2D)。鑒定了一個增殖的MEMPs- cycle群體，92%的MEMPs處于G2M/S期，而65%的MEMPs處于G2M/S期(圖2E)。此外，研究者對HSCs/MPPs- cycle和HSCs/MPPs進行DE分析，結果顯示HSCs/MPPs- cycle增加了糖酵解相關基因的表達，除了HSCs/MPPS-Cycle簇中存在轉錄啟動外，HSCs/MPPs和HSCs/MPPs-Cycle之間沒有其它轉錄差異。英拜是您身邊的科研小助手。成都骨折鼠模型科研
現今研究表明tRNA-derived small noncoding RNAs（sncRNAs）主要分為兩類：tRNA halves (tiRNAs)和fragments (tRFs)。前者在人類實體**中的的生物學功能吸引了越來越多的關注，但是其在**發生中的生物學機制仍知之甚少。tiRNAs和剪切相關蛋白之間的相關作用更是為未可知。本研究***發現一個5’-tRNA halves，即tiRNA-Gly通過與RBM17結合誘導可變剪切進而促進**狀甲狀腺*（PTC）的增殖和遷移。本文于2021年7月發表在影響因子7.068的《Journal of Experimental and Clinical Cancer Research》期刊上.SCI科研國家自然科學基金英拜提供生命科學內的一體化服務。
piRNA-30473在DLBCL中升高，是DLBCL患者的不良預后因素
作者首先研究小RNA的表達水平與DLBCL患者的臨床相關性。通過分析微陣列數據，與預后不良組(PP)比較，在預后良好(FPP)的病例中發現了4個***下調或上調的piRNAs(圖1A)。在這四個差異表達RNA的基礎上，作者進一步發現與預后良好(FPP)的患者相比，預后不良患者(PP)的piRNA-30473表達水平***升高(圖1B)，且DLBCL患者高水平的piRNA-30473與較差的總生存率相關(圖1C)。綜上所述，piRNA-30473可作為預后的生物標志物，并可用于DLBCL患者的預后分層。
在s-flow條件下，KLF4的TF結合基元在E2中富集，而NRF1在E3和E4中富集(所有流條件下)(圖6B)。相比之下，暴露于d-flow條件下的E5 E8中，TEF、ETV3、RELA、FOS::JUN、TEAD1和STAT1的TF基序富集(圖6C)。對一些眾所周知的流量敏感tf的基模的鑒定，KLF4(與KLF2基模相同)，FOS:JUN (AP1)， RELA和TEAD1證實了我們分析的有效性。為了進一步確定新發現的TF結合基序是否也與流量依賴反應相關，我們檢測了phospho -STAT1水平是否對流量敏感，作為STAT1***的標記。pcl術后2周，與RCA相比，CDH5+ LCA的ECs中phosphoSTAT1水平***升高(圖6D和6E)。文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(MLN)中的Th17細胞（與結腸炎癥密切相關）。
在整個細胞群中，2D-R和2W-R樣本之間沒有明顯的差異，這表明暴露在s-flow條件下2天或2周的細胞基本沒有變化。S-flow條件下(2D-R和2W-R)很少發現SMC，而急性d-flow條件下(2D-L)SMC數量增加至2.3%，慢性d-flow條件下(2W-L)SMC數量進一步增加至18.2%。四種情況下都有成纖維細胞，其中在急性d-flow情況下**多(2D-L時為17%)(圖1D)對2D-R、2D-L、2W-R、2W-L4個樣本的序列reads使用R軟件包進行分析。UMAP分析將總核群劃分為13個細胞群，它們以流量和時間依賴的方式分布(圖1E和1F)。通過Signac將scATAC-seq數據轉換為基因活性指數，并使用上述scRNA-seq研究中描述的相同標記基因確定細胞身份。在13個簇中，8個是內皮簇(E1E8)，其次是SMCs、Fibro、巨噬細胞、dc、T細胞和未定義(ND)(圖1G)。細菌可能是導致小鼠腸道尿酸降低的主要原因。單細胞科研地區科學基金
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2、miR-138-5p介導*細胞誘導的巨噬細胞KDM6B表達抑制構建了miR-138-5p過表達的乳腺*細胞系，取其培養基與巨噬細胞共培養，結果巨噬細胞中miR-138-5p表達***上調，同時KDM6B的表達***下降。證實miR-138-5p介導*細胞誘導的巨噬細胞KDM6B表達抑制。
3、*細胞來源的外泌體miR-138-5p下調KDM6B的表達
隨后為了判定上述巨噬細胞中miR-138-5p表達上調的原因，檢測了巨噬細胞中原代(pri-)和前體(pre-)miR-138的水平。結果顯示共培養和對照組間原代和前體miR-138的水平沒有差異，表明miR-138-5p是外源供應的（圖1A）。此外，使用RNaseA處理miR-138-5p水平不變，使用TritonX-100其水平***下降。提示miR-138-5p被膜狀結構包裹（圖1B）。進一步分析表明使用外泌體抑制劑GW4869處理組和外泌體刪除組的培養基中miR-138-5p的表達***下降（圖1C）。表明外泌體來源于乳腺*細胞。 成都骨折鼠模型科研
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