二、YTHDF1缺乏可抑制胃*進展和轉移
YTHDF1在不同胃*細胞株中的蛋白表達水平,遠高于正常胃腺細胞GES-1。為了進一步探討YTHDF1在胃*中的作用,采用了胃*細胞系、細胞系來源的異種移植(CDX)和PDX模型(圖2A)。首先,通過產生兩種穩定的shRNA表達人胃*細胞株MGC-803和HGC-27,研究了YTHDF1的抑制作用,這兩種細胞株在所有被檢測的胃*細胞株中YTHDF1的表達相對較高(補充圖S2B)。YTHDF1基因敲除確實降低了胃*細胞的增殖(圖2B)。此外,在MGC-803和HGC-27細胞中YTHDF1敲除降低細胞的遷移和侵襲能力(圖2C)。隨后通過皮下注射YTHDF1敲除的MGC-803細胞到免疫缺陷裸鼠,研究YTHDF1的抑制是否會影響體內胃*的發生。 m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。生理節律芯片科研實驗外包
為了驗證MAO-A缺乏是否直接有助于減輕Maoa KO巨噬細胞的免疫抑制極化,進行拯救實驗。構建MIG-Maoa逆轉錄病毒載體,利用該載體轉導Maoa KO BMDMs,并在這些巨噬細胞中實現了MAO-A的過表達(圖3l-n)。MAO-A過表達***加劇了IL-4/ IL-13刺激的Maoa KO BMDMs的免疫抑制表型(圖3o-p)。綜上所述,這些結果表明,MAO-A作為一種自主因子,在***刺激下促進巨噬細胞免疫抑制極化。
4、MAO-A通過ROS上調促進巨噬細胞免疫抑制極化
接下來,研究調控MAO-A促進巨噬細胞免疫抑制極化的分子機制。據報道,細胞內活性氧(ROS;氧化應激)會引起巨噬細胞的免疫抑制特征。MAO-A催化單胺的氧化脫氨,從而產生過氧化氫(H2O2)作為副產物,可以增加細胞內ROS水平。因此,推測MAO-A可能通過上調TAM中的ROS水平,促進TME中TAM的免疫抑制極化(圖4a)。為了驗證這一假設,測量了從攜帶B16-OVA**的MaoaWT和KO小鼠中分離的TAMs中的ROS水平,并檢測到MaoaKOTAMs中ROS水平***降低(圖4b-c)。 湖北行為絕望抑郁BDD科研大黃酸處理改變腸道菌群組成。
MAD2和p31conmet調節SAC的持續時間,反過來,也調節有絲分裂的持續時間。這促使我們研究RIT1是否通過與MAD2和p31conmet的直接關聯來影響SAC。通過RNAi或crispr介導的敲除去除RIT1可延長有絲分裂進程(圖3A和S3A S3E)。此外,SAC的藥理抑制挽救了RIT1耗盡的作用,表明RIT1以SAC依賴的方式影響有絲分裂。此外,RIT1的缺失增加了染色體分離錯誤的發生率(圖3B),這表明RIT1不僅對有絲分裂的及時進展至關重要,而且RIT1蛋白水平的失調也破壞了正常的SAC功能。LZTR1或RIT1M90I表達的缺失加速了異步生長細胞的有絲分裂進程,這一效應依賴于PM釋放RIT1(圖3C、S3H和S3I)。同樣,RIT1 WT或M90I的過表達部分覆蓋了藥物誘導的SAC反應(圖3D和S3J)。RIT1M90I的異位表達以依賴MAD2-和p31come結合的方式***增加了有絲分裂錯誤的發生率,包括滯后染色體和橋接染色體(圖3G和S3O)。因此,我們觀察到在表達RIT1M90I的細胞中非整倍體率增加,但在表達不能結合MAD2/p31conmet的突變體的細胞中卻沒有(圖3H和S3P)。這些結果表明,RIT1水平的增加會導致與MAD2和p31conmet的直接相互作用,從而降低有絲分裂的保真度。
2)UCP1在AKI中***下調,且與腎損傷嚴重程度呈高度負相關
UCPs超家族與能量代謝密切相關,并在多種疾病中介導脂質消耗?;赨CPs的功能,我們通過westernblot和免疫組化方法對正常C57小鼠腎組織中UCP1、UCP2和UCP3的表達進行了表征。結果顯示,UCP1和UCP2表達較好,而UCP3幾乎未檢測到(圖2A-B)。在UCPs中,UCP1被認為是脂質降解**關鍵的基因,而UCP2與之沒有直接關系。因此,我們選擇UCP1進行進一步分析,證實其在皮質小管中高表達,在髓質中部分表達,C57小鼠、Sprague-Dawley大鼠、Wistar大鼠腎小球、**幾乎無表達(圖2C-D)。為了進一步確認UCP1在腎臟中的表達位點,我們用凝集素染色顯示腎臟的形態,然后對UCP1進行染色。結果顯示,UCP1主要表達于腎小管以上結果提示,UCP1可能在腎小管的結構和功能中發揮著潛在的重要作用。 Caspase-11介導的肝細胞焦亡促進非酒精性脂肪性肝炎的進展。
7)在體外,上調UCP1減少AKI期間的脂質積累可通過AMPK/ULK1途徑促進自噬
自噬已被證實在AKI中發揮重要作用。因此,自噬已經成為我們關注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉染過表達UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細胞模型中,自噬相關指標顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示,上調UCP1消除AKI中的脂質積累后,細胞自噬得到促進(圖7C)?;谶@些發現,為了驗證自噬在UCP1功能中的重要性,我們進行了功能恢復實驗。如圖7D-F所示,氯喹抑制自噬***逆轉了順鉑組UCP1引起的炎癥指標下降。同樣,TUNEL染色顯示,使用氯喹抑制自噬,可以明顯逆轉UCP1促進的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結果表明,脂質積累通過作用于AKI細胞自噬,在調節細胞功能方面發揮著重要作用。 乳酸菌是益生菌在嘌呤代謝中發揮關鍵作用。成都熱休克蛋白科研
總體生存率低與m6A水平增高***相關。生理節律芯片科研實驗外包
HoxBlinc直接與靶基因結合,介導染色質相互作用,驅動HSPC中的基因調控網絡
CTCF邊界促進了受限拓撲相關域(TADs)內增強子/啟動子的相互作用。作者之前報道了后HOXA位點的CTCF邊界建立和維持活躍的TAD,以驅動后HOXA基因表達。為了研究HoxBlinc過表達是否會影響CTCF定義的HoxB位點前TAD域和增強子/啟動子調控網絡,使用高通量測序捕捉環狀染色體構象(4C-seq)使用HoxB位點CTCF結合位點(cbs)作為HoxBlincTg與WTLin?c-Kit+細胞(圖5a)。有趣的是,HoxBlinc過表達增強了這些由CBS5/5和/或+43CBS介導的HoxB前位點內的長程相互作用(圖5b)。而+73KbCBS(+73CBS)和HoxB13CBS(CBS13)與前HoxB基因不互作,盡管+73CBS與CBS5/6和CBS8/9存在交互作用,但不受HoxBlinc過表達的影響(圖5b)。此外,HoxBlinc過表達也誘導了CBS4/5和/或+43CBS與HoxBlinc靶基因如Stat1、Crd2和后HoxA基因啟動子區域的長程相互作用,而非HoxBlinc靶基因HoxD(圖5c)。這些數據表明,HoxBlinc與CBS4/5和+43CBS協調,促進并維持與NPM1c+標記基因位點的長期染色質相互作用,從而***它們。 生理節律芯片科研實驗外包
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗