一、腦損傷改變了果蠅的大腦蛋白質(zhì)組,擾亂了NCT蛋白和Nup蛋白水平
為了研究創(chuàng)傷性腦損傷的機(jī)制,我們使用了一個具有良好特征的創(chuàng)傷性腦損傷果蠅模型,該模型顯示了強(qiáng)大的表型,如TDP-43同源物(Tbph)、p62、應(yīng)激顆粒和泛素病理,以識別和研究創(chuàng)傷性腦損傷后大腦蛋白質(zhì)組的變化(圖1A)。對暴露于重復(fù)TBI的三齡果蠅幼蟲大腦中的2000個蛋白質(zhì)進(jìn)行了無偏性蛋白質(zhì)組學(xué)分析(w1118),發(fā)現(xiàn)361個蛋白質(zhì)在創(chuàng)傷損傷后發(fā)生了***變化(p 0.05,學(xué)生t檢驗)。基于基因本體論(GO)的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析在BiNGO (Cytoscape 3)中對tbi相關(guān)腦蛋白質(zhì)組與非tbi對照進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析,確定了不同類別的改變蛋白,其中大多數(shù)上調(diào)(圖1B和C;圖1圖補(bǔ)充1A-E;補(bǔ)充文件1和3)。TBI后上調(diào)的比較高類別是微管細(xì)胞骨架、蛋白質(zhì)折疊和蛋白酶體。此外,我們還鑒定了涉及**白復(fù)合體和剪接體的蛋白質(zhì)。核孔復(fù)合體(NPC)和NCT通路的組成部分是tbi后上調(diào)的主要蛋白子集(圖1圖補(bǔ)充1F)。 英拜潤色的標(biāo)書的中標(biāo)率**提高。細(xì)胞核仁科研地區(qū)科學(xué)基金
熒光原位雜交和核胞質(zhì)RNA分?jǐn)?shù)實(shí)驗結(jié)果顯示,MIR210HG在Ishikawa細(xì)胞和HEC-1A細(xì)胞中均位于核和細(xì)胞質(zhì)內(nèi)(圖3D和3E)。我們假設(shè)MIR210HG對miRNAs起海綿作用。為了探究MIR210HG是否參與了一個新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調(diào)控網(wǎng)絡(luò),我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫來預(yù)測與HMGA2結(jié)合的mirna(圖3F)。選擇3個軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過將野生型雙熒光素酶載體介導(dǎo)的HMGA2構(gòu)建物共轉(zhuǎn)染HEK293T細(xì)胞,共鑒定和篩選了110個miRNAs。轉(zhuǎn)染后,23個miRNA轉(zhuǎn)染細(xì)胞的熒光素酶活性***降低(圖3G)。在上述23種miRNAs中,轉(zhuǎn)染miR-3373p、miR-137、let-7c-5p和miR-98-5p時,熒光素酶活性***降低,其中轉(zhuǎn)染miR-337-3p和miR-137時,熒光素酶活性降低**多。利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫TargetScan預(yù)測miR-337-3p和miR-137中與HMGA2結(jié)合的位點(diǎn)。雙熒光素酶基因報告基因檢測結(jié)果顯示,miR-337-3p和miR-137在其預(yù)測的結(jié)合位點(diǎn)上結(jié)合HMGA2(圖3H)。染色科研省自然科學(xué)基金METTL14的上調(diào)可以通過m6A修飾降低PERP水平。
9)M1-Exos通過miR-155/SOCS6/p65軸加重了bEnd.3細(xì)胞的EndoMT
為了探討外泌體miR-155/SOCS6/p65軸在M1-Exos誘導(dǎo)的EndoMT中的作用,我們在體外進(jìn)行了一系列功能喪失和功能獲得實(shí)驗。我們發(fā)現(xiàn),SOCS6過表達(dá)部分逆轉(zhuǎn)了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos誘導(dǎo)的TEER值降低和通透性增加(圖9A和B)。ZO-1和Occludin的熒光強(qiáng)度進(jìn)一步顯示SOCS6過表達(dá)***逆轉(zhuǎn)了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos在bEnd.3細(xì)胞中引起的TJs破壞(圖9C)。此外,EndoMT標(biāo)記物的蛋白水平與這些結(jié)果一致,SOCS6上調(diào)可消除miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos介導(dǎo)的p65上調(diào)(圖9D)。值得注意的是,當(dāng)miR-NCKD-Exos或miR-155KD-Exos下調(diào)SOCS6時,則出現(xiàn)相反的結(jié)果(圖9E-H)。
miRNA質(zhì)量檢測PCR芯片用于評估通過miScriptIIRTKit(usingmiScriptHiSpecBufferprovidedinthekit)制備的多個cDNA的質(zhì)量。miScriptmiRNAQCPCR芯片包括96孔、384孔和100孔板。96孔和100孔板可以做8個cDNA對照樣本,384孔可做32個cDNA對照樣本使用miScriptmiRNAQCPCR芯片可以檢測使用miScriptIIRTKit制備的cDNA的質(zhì)量,確保只使用***的樣品在后續(xù)實(shí)驗中可以節(jié)省時間和試劑。miScriptmiRNAPCR芯片*用于分子生物學(xué)應(yīng)用。本產(chǎn)品不用于疾病的診斷、預(yù)防和***。英拜有一支高精尖的團(tuán)隊。
此外,在敲除內(nèi)源性FPN后,USP35過表達(dá)引起的ROS和丙二醛生成的減少也被減緩(圖6G)。我們還評估了體內(nèi)和體外RSL3***后FPN在肺*細(xì)胞或**異種移植中的作用。如圖7A-C所示,F(xiàn)PN敲除恢復(fù)了USP35過表達(dá)肺*細(xì)胞的細(xì)胞內(nèi)LIP和Fe2+水平,同時增加了ROS和MDA的形成。與此同時,F(xiàn)PN敲除后,由于USP35過表達(dá)而增加的細(xì)胞活力和集落形成也被逆轉(zhuǎn)(圖7D-F)。根據(jù)體外數(shù)據(jù),F(xiàn)PN敲除后,USP35過表達(dá)細(xì)胞的**體積和重量均有所減少(圖7G,H)。更重要的是,我們發(fā)現(xiàn)FPN的膜分布在肺ADC和SCC**中***增加(圖7I)。綜上所述,這些數(shù)據(jù)表明FPN是USP35調(diào)節(jié)鐵死亡和**進(jìn)展的潛在靶點(diǎn)。評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調(diào)節(jié)因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達(dá)。上海結(jié)腸黏膜層科研
英拜的實(shí)驗室坐落在上海漕河涇園區(qū)浦江園區(qū)。細(xì)胞核仁科研地區(qū)科學(xué)基金
4、CDK4/6預(yù)處理增強(qiáng)功能性記憶CD8+T細(xì)胞的持久性
長期生存能力是T細(xì)胞記憶的基本特征。為了確定CDK4/6i處理的細(xì)胞在體內(nèi)是否表現(xiàn)出優(yōu)越的存活率,將未處理和CDK4/6i預(yù)處理的體外活化CD45.1OT-iT細(xì)胞轉(zhuǎn)移至同源CD45.2小鼠中,并通過流式細(xì)胞術(shù)評價其隨時間的持續(xù)性和表型(Fig.4A)。在30天內(nèi),在血液和脾臟中檢測到的預(yù)處理OT-I-T細(xì)胞的頻率明顯更高(Fig.4B)。30天后,未處理和預(yù)處理的OT-I-T細(xì)胞在血液和脾臟中的表型持久性相似,都具有記憶前體的特征(MPECs;KLRG1-CD127+)(Fig.4C)。為了評價CDK4/6i處理細(xì)胞的記憶能力,將未處理或體外活化的CD45.1OT-iT細(xì)胞中預(yù)處理的細(xì)胞再次轉(zhuǎn)移至同源CD45.2宿主中。30d后,分離出OT-ⅠT細(xì)胞,等量重新轉(zhuǎn)移到同時***李斯特菌-OVA(LM-OVA)的新宿主中(Fig.4D)。未處理和預(yù)處理的OT-IT細(xì)胞在LM-OVA***后擴(kuò)增和分化,迅速獲得功能性、產(chǎn)生細(xì)胞因子的SLEC表型(KLRG1+CD127-)(Fig.4E-F)。這些表明CDK4/6抑制驅(qū)動T細(xì)胞記憶的表型和功能獲得。 細(xì)胞核仁科研地區(qū)科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實(shí)驗并參與實(shí)驗課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實(shí)驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗:DNA甲基化實(shí)驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗
7.實(shí)時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實(shí)驗(靶基因驗證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗