6、外泌體miR-138-5p促進(jìn)乳腺*肺轉(zhuǎn)移
極化的巨噬細(xì)胞在決定**細(xì)胞的表型中起著重要的作用。因此，探究M2巨噬細(xì)胞外泌體miR-138-5p處理是否有助于乳腺*小鼠異**模型的**轉(zhuǎn)移。使用氯膦酸鈉***小鼠巨噬細(xì)胞，然后轉(zhuǎn)移使用過表達(dá)miR-138-5p的T47D或T47D細(xì)胞來源的外泌體處理的Raw264.7細(xì)胞。小鼠模型通過尾靜脈注射4T1-熒光素酶細(xì)胞構(gòu)建（圖6A）。結(jié)果顯示，外泌體miR-138-5p處理組***促進(jìn)小鼠體內(nèi)乳腺*細(xì)胞的**體積和肺轉(zhuǎn)移，同時(shí)增加了CD206和Arg-1陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)（圖6B-E）。這些結(jié)果表明外泌體miR-138-5p誘導(dǎo)的M2巨噬細(xì)胞促進(jìn)乳腺*的肺轉(zhuǎn)移。 大黃酸導(dǎo)致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。廣州16s測(cè)序科研
巨噬細(xì)胞的差異***與**進(jìn)展密切相關(guān)，而表觀遺傳因子賴氨酸去甲基化酶6B (KDM6B，先前命名為JMJD3)通過一種未知的機(jī)制調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞的極化。本文探討了該調(diào)解機(jī)制及其功能，并于2021年5月發(fā)表在《Theranostics》IF:8.579期刊上。
1、巨噬細(xì)胞KDM6B的表達(dá)被miR-138-5p抑制
根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道KDM6B是巨噬細(xì)胞的***的關(guān)鍵分子，因此，作者首先檢測(cè)了乳腺*細(xì)胞系MB-MDA-231對(duì)巨噬細(xì)胞系TPH-1中KDM6B表達(dá)的影響，結(jié)果表明乳腺*細(xì)胞及其條件培養(yǎng)基都可***下調(diào)KDM6B的表達(dá)，表明存在一種乳腺*細(xì)胞來源的分泌因子產(chǎn)生此種影響。因此，通過生物信息學(xué)預(yù)測(cè)了KDM6B結(jié)合的miRNA，以及結(jié)合文獻(xiàn)，通過在乳腺*中上調(diào)的，同時(shí)符合條件的有3個(gè)。隨后將乳腺*細(xì)胞和巨噬細(xì)胞共培養(yǎng)，檢測(cè)三個(gè)miRNA的表達(dá)，如圖1B所示，只有miR-138-5p和miR-146a的表達(dá)在共培養(yǎng)后***上調(diào)。進(jìn)一步檢測(cè)發(fā)現(xiàn)，只有miR-138-5p處理后KDM6B的表達(dá)***下降而非miR-146a（圖1C-D）。生信分析預(yù)測(cè)了miR-138-5p和KDM6B的結(jié)合位點(diǎn)，并進(jìn)行了熒光素酶實(shí)驗(yàn)檢測(cè)，證實(shí)了兩者間存在結(jié)合關(guān)系。 廣州16s測(cè)序科研尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。
TDP-43包含一個(gè)類似朊病毒的低復(fù)雜度域，并具有一個(gè)本質(zhì)上的無序區(qū)域(IDR)，使TDP-43易于聚集。RNA結(jié)合蛋白(rbp)中的IDRs被認(rèn)為在核糖體蛋白顆粒(如p -小體、應(yīng)激顆粒和神經(jīng)元顆粒)的組裝中起關(guān)鍵作用，提示rbp的突變或異常聚集可能會(huì)破壞這些顆粒的動(dòng)力學(xué)。此外，rbp中的IDRs如TDP-43經(jīng)歷了液-液相分離，TDP-43的病理突變改變了液-液相分離，這可能有助于疾病進(jìn)程。因此，rbp如TDP-43的改變可能是神經(jīng)退行性變的重要指標(biāo)。然而，盡管這些機(jī)制可能解釋了TDP-43病理突變?cè)谏窠?jīng)退行性疾病中的作用，但TDP-43如何在無突變的情況下聚集形成并導(dǎo)致神經(jīng)退行性疾病，如反復(fù)創(chuàng)傷患者的大腦，目前尚不清楚。
為了使細(xì)胞在G1/S檢查點(diǎn)同步，我們對(duì)它們施加雙胸腺嘧啶脈沖。這種處理有效地抑制了PTEN-WT和PTEN-398A細(xì)胞在G1/S邊界(圖4B)。然后在正常生長(zhǎng)培養(yǎng)基中釋放細(xì)胞，在S期進(jìn)展期間用IR處理，6小時(shí)后收集細(xì)胞，用流式細(xì)胞術(shù)分析細(xì)胞周期分布(實(shí)驗(yàn)方案見補(bǔ)充圖7A)。大部分PTEN-WT細(xì)胞被阻滯在s期，而PTEN-398A細(xì)胞未能阻滯細(xì)胞周期，而是發(fā)展到G2/M期(圖4C)。通過測(cè)定表達(dá)磷酸化組蛋白H3(Ser10)的細(xì)胞比例，證實(shí)了這一觀察結(jié)果。磷酸化組蛋白H3(Ser10)標(biāo)志著細(xì)胞處于有絲分裂階段。(圖4d)。英拜提供可靠的技術(shù)咨詢。
與SMARCA4類似，SMARCC1[15](在ChIP-SICAP中發(fā)現(xiàn))顯示與C1和C2位點(diǎn)相結(jié)合(圖2g）。
重點(diǎn)分析了ARBs染色質(zhì)可及性的變化，發(fā)現(xiàn)雄***通常增加了ARBs的可及性(圖3a, ATAC, siCTRL)。盡管SBs和ARBs之間有很大的重疊，但SMARCA4刪除*減少了2149個(gè)ARBs的染色質(zhì)可及性。這些sismarca4受影響的位點(diǎn)中有一半是開放的，不管***暴露與否(pre-accessible)，其余的在***暴露后顯示其可及性增加(de novo位點(diǎn)，圖3a和c)。被AR招募的SMARCA4增加染色質(zhì)可及性，潛在地協(xié)助其他因素招募到這些位點(diǎn)(圖3d，補(bǔ)充表2)。由于雄***誘導(dǎo)了FOXA1在sismarca4影響位點(diǎn)的結(jié)合(圖3e)， AR誘導(dǎo)的SMARCA4的招募可能有助于雄***誘導(dǎo)FOXA1的結(jié)合。上述結(jié)果表明SMARCA4在CRPC細(xì)胞染色質(zhì)景觀的調(diào)節(jié)中既有AR依賴的作用，也有非ARr**的作用。 發(fā)現(xiàn)乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。16s測(cè)序科研省自然科學(xué)基金
乳酸菌是益生菌在嘌呤代謝中發(fā)揮關(guān)鍵作用。廣州16s測(cè)序科研
點(diǎn)擊該基因的名稱，將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻(xiàn)中的更多詳細(xì)信息。***，在“詳細(xì)信息”部分中總結(jié)了有關(guān)疾病，細(xì)胞類型和基因的詳細(xì)信息。SC2disease還提供了從基于單細(xì)胞的結(jié)果和基于GWAS的結(jié)果得出的疾病的易感基因。所有GWAS數(shù)據(jù)均從GWAS目錄獲得。以2型糖尿病為例，將通過單擊“可視化”顯示由scRNA-seq和GWAS檢測(cè)到的易感基因列表。此外，可通過單擊“可視化”以可視方式顯示結(jié)果。在所得圖中，x軸是從GWAS結(jié)果獲得的基因中SNP的**小P值。y軸是從scRNA-seq結(jié)果獲得的疾病的重疊敏感性基因的細(xì)胞類型。條的顏色顯示基因表達(dá)的log 2倍變化。廣州16s測(cè)序科研
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6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)