5.ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯體,通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾
為了探索ELNAT1誘導BCa淋巴轉移的分子機制,我們使用NGS檢測過表達ELNAT1的BCa細胞和對照細胞(Figure5A),由于SUMOylation已經被證明可以調節特異性RNA的識別,并參與RNA分選進入EVs的過程,因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關靶基因。在受ELNAT1調控的925個基因中,作者發現UBC9是SUMOylation相關基因變化*****的(Figure5B-D)。接著通過RNA純化(ChIRP)檢驗ELNAT1與UBC9中P1(153~143bp)啟動子區域存在生理相互作用(Figure5E,F)。CD光譜證實ELNAT1/UBC9TTS1組在270~280nm處有一個***的正峰,在210nm處有一個負峰。 英拜的高通量測序服務質量。分子生物學科研實驗可參觀
本文在一組臨床定義明確的SLE伴活檢證實的腎炎患者中進行的T細胞轉錄組學和代謝研究表明,高IFN信號可驅動CD8 + T細胞線粒體代謝途徑的變化,使其生物能量不適應且更容易死亡。本文證明在SLE患者的CD8 + T細胞中觀察到的代謝重編程是延長IFNα暴露和TCR刺激的結果。在這兩種刺激的持續組合下,這可能是SLE患者特有的一種情況,CD8 + T細胞表現出與NAD + 消耗增強、線粒體氧化能力降低和存活率下降相關的PARP基因表達增加(圖7)。總的來說,本文的發現證明高ISG特征與SLE CD8 + T細胞的代謝適合性之間的聯系,以及它們在壓力下或對抗原再激發的反應中存活的能力。湖北熱休克蛋白科研總體生存率低與m6A水平增高***相關。
MIR210HG與子宮內膜*患者的低生存率相關為了識別子宮內膜*組中異常表達的lncRNA,我們分析了來自TCGA的數據。表達陣列分析顯示332個lncRNA的表達差異有統計學意義。7個lncRNA表達上調(圖1A和1B)。然后,我們分析了GEO數據集,發現在子宮內膜*GSE17025隊列中MIR210HG的表達也上調(圖1C)。qPCR顯示MIR210HG在子宮內膜*中的表達明顯高于正常子宮內膜組織(圖1D)。此外,我們分析了MIR210HG的表達與子宮內膜*患者臨床病理參數的關系,發現MIR210HG在從I、II期到III、IV期的進展過程中增加。MIR210HG的表達與淋巴結轉移***相關(圖1E)。原位雜交實驗結果顯示,MIR210HG在子宮內膜*中的表達水平高于正常子宮內膜組織(圖1F)。MIR210HG高表達的子宮內膜*患者生存率較低(圖1G)。
與基因表達改變一致,白樺素處理以濃度依賴性的方式***減少了膽固醇和脂肪酸的從頭合成(圖3D-E)。此外,白樺素降低了細胞膽固醇(圖3F)和中性脂質(主要是膽固醇酯和甘油三酸酯)的穩態水平(圖3G)。兩者合計,我們的數據表明白樺素抑制SREBP加工并下調膽固醇和脂肪酸的生物合成,從而降低細胞脂質水平。有趣的是,洛伐他汀顯著降低了膽固醇的合成(圖3D),但也適度地增加了脂肪酸的生物合成(圖3E),這可能是因為洛伐他汀是HMGCR的抑制劑,它可以阻斷膽固醇的合成,進而刺激SREBP的活化,從而增加脂肪酸合成。METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。
接受樣品類型a)組織樣品(需提供2100mg組織。必須保存在RNAlater或類似RNA保護溶液中);b)體外培養細胞(需提供≥10^6個細胞。必須保存在RNAlater或類似RNA保護溶液中);c)全血(需提供22ml全血);d)總RNA(需提供25ugtotalRNA)。所有類型樣品必須用冰袋寄至公司。冰塊應足量,以確保樣品寄至公司時,冰塊未完全融化。服務內容與價格樣品類型服務內容價格(人民幣:元)組織樣品,體外培養細胞,全血RNA制備,基因表達定量詢價totalRNA基因表達定量詢價提交數據服務報告提交下列數據:實時熒光PCR擴增曲線;熔解曲線;基因表達定量結果分析。英拜是您身邊的科研小助手。遼寧蛋白組學科研
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3、外泌體S100A4是HCC細胞轉移潛力的關鍵增強子
為了探究通過HMH-exo增強HCC轉移能力的關鍵,作者對LMH-exo和HMH-exo進行了iTRAQ質譜篩選。結果從HMH-exo中鑒定到116個***上調和43***下調的蛋白質;結果發現了4個蛋白家族的聚類:Apo、PSM、EEF/EIF和S100鈣結合蛋白家族(圖3a-b)。經過文獻分析,作者主要關注了S100鈣結合蛋白家族,并以其中*****差異表達的4個蛋白為主:依次是S100A4,S100A6,S100A10,和S100A11。作者檢測了這4個蛋白在5個HCC細胞系外泌體中的表達豐度,結果發現依然是S100A4的表達水平比較高(圖3c)。因此,初步選擇S100A4進行下一步分析。 分子生物學科研實驗可參觀
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗