2.TYRO3使**細胞對抗PD-1***耐藥
在同系BALB/c小鼠模型中比較了Tyro3過表達(Tyro3-OE)和4T1-P細胞對抗mPD-1***的反應。在荷4T1-P**的小鼠中,抗mPD-1******減少**的生長,并延長了生存期。這些結果表明,盡管4T1-P**對抗mPD-1***有反應,Tyro3的過表達促進了這些**的耐藥性。為進一步確定在4T1-R耐藥細胞中抗PD-1/PD-L1耐藥是否需要TYRO3,敲除4T1-R細胞(TYRO3–/–)中的TYRO3。荷瘤Tyro3敲低細胞的小鼠對抗mPD-1***敏感,**生長***減少,小鼠存活時間更長。這些結果證明TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的重要作用。 發(fā)現(xiàn)乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。上海微生物失調科研
一、Pten398A加速MMTVneu驅動的乳腺**發(fā)生
為了研究ATM磷酸化PTEN的體內功能,我們在小鼠中設計了一個敲入等位基因,其中398位絲氨酸取代了丙氨酸(Pten398A)。Pten398A/+和Pten398A/398A小鼠存活,發(fā)育明顯正常。為了研究atm依賴的PTEN磷酸化在乳腺*中的可能作用,我們在小鼠乳腺**病毒(MMTV)啟動子/增強子轉錄控制下表達滅活neu (Erbb2)融合基因的小鼠背景下培養(yǎng)了Pten398A等位基因。在這個成熟的模型中,MMTVneu基因在正常乳腺上皮中低水平表達,導致乳腺**的發(fā)展,據(jù)報道中位發(fā)生率為205天。Pten+/+;MMTVneu小鼠發(fā)生了預期潛伏期的乳腺**,顯示了233天的中位生存期(圖1A)。
上海細胞凋亡基因芯片科研英拜有一支高精尖的團隊。
肺*是**常被診斷的**之一,也是導致**死亡的主要原因,非小細胞肺*(NSCLC)約占肺*病例的85%。環(huán)狀RNA(circRNA)是一類共價閉合的單鏈RNA,與**的發(fā)展有關。***我們來看一篇發(fā)表在Nature Communications期刊的一篇文章,題名為:circNDUFB2 inhibits non-small cell lung cancer progression via destabilizing IGF2BPs and activating anti-tumor immunity。
circNDUFB2在NSCLC中被下調
通過circRNA芯片分析了三對NSCLC樣品中circRNA的表達譜,總共鑒定出109個circRNA失調,33個上調,76個下調。qRT-PCR驗證52個配對NSCLC樣品中**差異circRNA的表達。circNDUFB2是**顯著下調的circRNA。臨床分析發(fā)現(xiàn)circNDUFB2高表達與NSCLC患者的**大小、淋巴結轉移和分期呈負相關。結果表明,circNDUFB2在NSCLC中經(jīng)常被下調,并且與NSCLC的惡性特征呈負相關。circNDUFB2由NDUFB2基因的外顯子2–3產生,長度為249nt。circNDUFB2可由發(fā)散引物擴增,收斂引物不能擴增。核酸酶消化證實circNDUFB2具有閉環(huán)結構。放線菌素D處理表明,與NDUFB2mRNA相比,circNDUFB2是穩(wěn)定的。核質分離PCR以及熒光原位雜交(FISH)顯示circNDUFB2主要定位于細胞質中。這些結果表明circNDUFB2是一個circRNA。
4)體外實驗表明,上調UCP1以減輕AKI期間的脂質積累,可通過影響炎癥和凋亡,***抑制疾病進展
越來越多的證據(jù)表明,在AKI中有明顯的脂質積累和UCP1的異常表達,并與腎損傷的嚴重程度有很強的相關性。為了確定脂質積累是否影響AKI期間的細胞功能,我們首先使用UCP1過表達慢病毒和UCP1激動劑CL316243構建AKI細胞脂質積累***模型。如圖4A所示,在AKI中上調UCP1***脂質積聚,導致腎小管損傷指數(shù)、NGAL***下調,說明UCP1***脂質積聚可***減輕模型細胞的損傷。鑒于炎癥和凋亡是AKI細胞損傷**重要和直接的原因,我們對上述細胞模型中的炎癥和凋亡標記物進行了量化。IL-1β、IL-6和TNF-α隨著UCP1的上調而***降低(圖4B-D)。在凋亡指標Bax和C-caspase3中也觀察到類似的趨勢,而Bcl-2升高(圖4E)。***,通過TUNEL熒光染色直接定量評估細胞凋亡,證實上調UCP1緩解AKI模型細胞的凋亡(圖4F)。 這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以改善DSS誘導的結腸炎。
一、YTHDF1在胃*中的過表達
通過評估YTHDF1突變的分布,我們發(fā)現(xiàn)65%的突變是基因擴增,這通常會導致基因產物的過表達(圖1A).通過對TCGA數(shù)據(jù)集進行分析,發(fā)現(xiàn)YTHDF1在胃*患者中的表達確實明顯高于正常組織(圖1B)。YTHDF1的高表達與胃*進展(圖1C)和較差的總生存期(圖1D)相關。對正常胃組織和胃*標本進行免疫組化分析,證實**組織中YTHDF1蛋白表達上調(圖1F)。此外,YTHDF1在胃*患者中的異常高表達與更嚴重的臨床病理特征(如神經(jīng)周圍侵犯、侵襲性**分期(III/IV期vs.I/II期)、靜脈侵犯等***相關(圖1G)。KaplanMeier生存分析也顯示,YTHDF1高表達的胃*患者4年總生存期較差。綜上所述,YTHDF1在胃*發(fā)生中具有潛在的致瘤作用。 這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強。上海微生物失調科研
外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化促進CRC肝轉移。上海微生物失調科研
7)miR-155負調控SOCS6表達,***NF-κB通路
為了進一步探討外泌體miR-155誘導EndoMT和線粒體功能障礙的潛在機制,我們重點研究了miR-155的下游基因。首先,利用在線miRNA靶標數(shù)據(jù)庫預測了84個潛在靶基因。SOCS6是具有3’UTR的下游mRNA之一,可能與miR-155結合(圖7A)。結合GSE49329和GSE49330數(shù)據(jù)庫,我們發(fā)現(xiàn)miR-155的表達與SOCS6的表達呈負相關(圖7B)。為了進一步證實SOCS63’UTR是miR-155的直接靶標,我們根據(jù)預測的結合位點(圖7C)構建了SOCS63’UTR野生型(WT)和突變型(MUT)序列。熒光素酶報告實驗顯示,與對照組相比,共轉染SOCS6的WT-3’UTR時,miR-155過表達明顯降低了熒光素酶活性(圖7D)。qRT-PCR和westernblot進一步顯示,miR-155過表達導致SOCS6表達降低,而miR-155敲低上調SOCS6mRNA和蛋白水平(圖7E和F)。GO分析顯示miR-155可以負向調控細胞-細胞粘附,參與調控成纖維細胞增殖(圖7G)。從GO分析可知,miR-155可能介導NF-κB信號通路(圖7G)。過表達miR-155可***提高細胞質和細胞核中p65蛋白的水平,而敲低miR-155可起到相反的作用(圖7H)。 上海微生物失調科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗